MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Streptococcus pneumoniae JJA

Total Repeats: 27265

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012466	TAA	2	6	45	50	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012466	AAT	2	6	54	59	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012466	TTC	2	6	60	65	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_012466	ATT	2	6	107	112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012466	AGG	2	6	183	188	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012466	TCA	2	6	291	296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225853612
7	NC_012466	AAC	2	6	360	365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225853612
8	NC_012466	ATT	2	6	374	379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225853612
9	NC_012466	GTA	2	6	380	385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853612
10	NC_012466	GAA	2	6	467	472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853612
11	NC_012466	GGA	2	6	659	664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225853612
12	NC_012466	TTA	2	6	686	691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225853612
13	NC_012466	TTA	2	6	762	767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225853612
14	NC_012466	GAT	2	6	848	853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853612
15	NC_012466	GAA	2	6	890	895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853612
16	NC_012466	GAG	2	6	983	988	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225853612
17	NC_012466	TGC	2	6	1225	1230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225853612
18	NC_012466	ATA	2	6	1413	1418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225853612
19	NC_012466	AAT	2	6	1554	1559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225853612
20	NC_012466	TAT	2	6	1668	1673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012466	TAT	2	6	1677	1682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012466	TAA	2	6	1734	1739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225853613
23	NC_012466	TAC	2	6	1764	1769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225853613
24	NC_012466	CTT	2	6	1925	1930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225853613
25	NC_012466	CTT	2	6	1942	1947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225853613
26	NC_012466	CTT	2	6	1952	1957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225853613
27	NC_012466	GTA	2	6	1969	1974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853613
28	NC_012466	ATT	2	6	2149	2154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225853613
29	NC_012466	TGC	2	6	2169	2174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225853613
30	NC_012466	TGA	2	6	2304	2309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853613
31	NC_012466	GAT	2	6	2365	2370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853613
32	NC_012466	ACT	2	6	2500	2505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225853613
33	NC_012466	GTT	2	6	2608	2613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225853613
34	NC_012466	GAA	2	6	2653	2658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853613
35	NC_012466	CAG	2	6	2798	2803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225853613
36	NC_012466	AGT	2	6	2912	2917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012466	TTG	2	6	2937	2942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225853614
38	NC_012466	TGT	2	6	3055	3060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225853614
39	NC_012466	ATG	2	6	3062	3067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853614
40	NC_012466	ATT	2	6	3101	3106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225853614
41	NC_012466	CAG	2	6	3206	3211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225853615
42	NC_012466	ATT	2	6	3246	3251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225853615
43	NC_012466	GCA	2	6	3280	3285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225853615
44	NC_012466	TGG	2	6	3323	3328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225853615
45	NC_012466	TGA	3	9	3516	3524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853615
46	NC_012466	TTC	2	6	3701	3706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225853615
47	NC_012466	AGA	2	6	3726	3731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853615
48	NC_012466	GAC	2	6	3801	3806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225853615
49	NC_012466	AGT	2	6	3915	3920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853615
50	NC_012466	GAA	2	6	3943	3948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853615
51	NC_012466	GAT	2	6	3961	3966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853615
52	NC_012466	AAG	2	6	4082	4087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853615
53	NC_012466	CTC	2	6	4121	4126	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225853615
54	NC_012466	AGC	2	6	4128	4133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225853615
55	NC_012466	TAT	2	6	4137	4142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225853615
56	NC_012466	AAG	2	6	4229	4234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853615
57	NC_012466	GAA	2	6	4249	4254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853615
58	NC_012466	TAA	2	6	4316	4321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012466	GAA	2	6	4475	4480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853616
60	NC_012466	TTA	2	6	4611	4616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225853616
61	NC_012466	GAT	2	6	4659	4664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853616
62	NC_012466	CAG	2	6	4708	4713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225853616
63	NC_012466	TAT	2	6	4736	4741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225853616
64	NC_012466	GTT	2	6	4812	4817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225853616
65	NC_012466	CAT	2	6	4818	4823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225853616
66	NC_012466	GAT	2	6	4845	4850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853616
67	NC_012466	ACT	2	6	4897	4902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225853616
68	NC_012466	TTA	2	6	4962	4967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225853617
69	NC_012466	CTA	2	6	5056	5061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225853617
70	NC_012466	AGA	2	6	5093	5098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853617
71	NC_012466	GAT	2	6	5199	5204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853617
72	NC_012466	TGG	2	6	5212	5217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225853617
73	NC_012466	GAA	2	6	5385	5390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853617
74	NC_012466	GAG	2	6	5479	5484	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225853617
75	NC_012466	TGA	2	6	5543	5548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853617
76	NC_012466	AGA	2	6	5726	5731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853617
77	NC_012466	TGA	2	6	5852	5857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853617
78	NC_012466	TGA	2	6	5869	5874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853617
79	NC_012466	AGA	2	6	5918	5923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853617
80	NC_012466	AGA	2	6	6113	6118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853617
81	NC_012466	ATT	2	6	6150	6155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225853617
82	NC_012466	GGA	2	6	6191	6196	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225853617
83	NC_012466	CGT	2	6	6360	6365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225853617
84	NC_012466	ACA	2	6	6374	6379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225853617
85	NC_012466	TGT	2	6	6434	6439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225853617
86	NC_012466	CAT	2	6	6441	6446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225853617
87	NC_012466	TGA	2	6	6683	6688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853617
88	NC_012466	TGA	4	12	6743	6754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853617
89	NC_012466	TGA	2	6	6767	6772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853617
90	NC_012466	GAT	2	6	6795	6800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853617
91	NC_012466	GTA	2	6	6808	6813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853617
92	NC_012466	CGA	2	6	6958	6963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225853617
93	NC_012466	TGT	2	6	7139	7144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225853617
94	NC_012466	TGA	2	6	7162	7167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853617
95	NC_012466	TGA	2	6	7172	7177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853617
96	NC_012466	GAA	2	6	7223	7228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853617
97	NC_012466	CCG	2	6	7323	7328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	225853617
98	NC_012466	TAT	2	6	7425	7430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225853617
99	NC_012466	ACA	2	6	7435	7440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225853617
100	NC_012466	GAC	2	6	7586	7591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225853617
101	NC_012466	TAT	2	6	7595	7600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225853617
102	NC_012466	TTA	2	6	7920	7925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225853617
103	NC_012466	GTA	2	6	8148	8153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853617
104	NC_012466	ATA	2	6	8227	8232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225853617
105	NC_012466	ATT	2	6	8284	8289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225853617
106	NC_012466	CTG	2	6	8400	8405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225853617
107	NC_012466	TTA	2	6	8421	8426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225853617
108	NC_012466	GAA	2	6	8445	8450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853617
109	NC_012466	TCT	2	6	8469	8474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_012466	AAT	2	6	8497	8502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_012466	TAA	2	6	8512	8517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012466	CGT	2	6	8562	8567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225853618
113	NC_012466	TGC	2	6	8683	8688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225853618
114	NC_012466	GCA	2	6	8733	8738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225853618
115	NC_012466	AGA	2	6	8771	8776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853618
116	NC_012466	AAT	2	6	8803	8808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225853619
117	NC_012466	CGT	2	6	8833	8838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225853619
118	NC_012466	TGA	2	6	8846	8851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853619
119	NC_012466	TAT	2	6	8906	8911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225853619
120	NC_012466	TGA	2	6	9009	9014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853619
121	NC_012466	TGC	2	6	9063	9068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225853619
122	NC_012466	TAT	2	6	9091	9096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225853619
123	NC_012466	TTA	2	6	9161	9166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225853620
124	NC_012466	GAA	2	6	9209	9214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853620
125	NC_012466	ATT	2	6	9232	9237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225853620
126	NC_012466	AAG	2	6	9246	9251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853620
127	NC_012466	ATT	2	6	9282	9287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225853621
128	NC_012466	TTG	2	6	9288	9293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225853621
129	NC_012466	GTC	2	6	9342	9347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225853621
130	NC_012466	TTA	2	6	9365	9370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225853621
131	NC_012466	TAG	2	6	9463	9468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853621
132	NC_012466	ATC	2	6	9559	9564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225853621
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256	NC_012466	TAG	2	6	18707	18712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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258	NC_012466	CGG	2	6	19045	19050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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261	NC_012466	GGT	2	6	19539	19544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
262	NC_012466	TCG	2	6	19654	19659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
263	NC_012466	CGT	2	6	19734	19739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
264	NC_012466	AGT	2	6	20192	20197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
265	NC_012466	GTA	2	6	20259	20264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
266	NC_012466	ATG	2	6	20282	20287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
267	NC_012466	TAA	3	9	20353	20361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
268	NC_012466	GTA	2	6	20477	20482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853626
269	NC_012466	ACC	2	6	20567	20572	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225853626
270	NC_012466	CTA	2	6	20743	20748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225853626
271	NC_012466	TGA	2	6	20824	20829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
272	NC_012466	TAA	2	6	20886	20891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
273	NC_012466	GAA	2	6	20907	20912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
274	NC_012466	TTA	3	9	21054	21062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
275	NC_012466	GAG	2	6	21110	21115	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
276	NC_012466	TCC	2	6	21139	21144	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
277	NC_012466	GAA	2	6	21319	21324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853628
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279	NC_012466	ATT	2	6	21420	21425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225853628
280	NC_012466	GTG	2	6	21554	21559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
281	NC_012466	TTA	2	6	21603	21608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
282	NC_012466	TTG	2	6	21668	21673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225853629
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285	NC_012466	TGA	2	6	21934	21939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853630
286	NC_012466	TGA	2	6	21992	21997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853630
287	NC_012466	TGA	2	6	22009	22014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853630
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290	NC_012466	ATA	2	6	22132	22137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
291	NC_012466	TTG	2	6	22268	22273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
292	NC_012466	GAA	2	6	22414	22419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853631
293	NC_012466	TAT	2	6	22483	22488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225853631
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295	NC_012466	ATA	2	6	22649	22654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
296	NC_012466	TCT	2	6	22721	22726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
297	NC_012466	TAA	2	6	22751	22756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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301	NC_012466	TTC	2	6	23010	23015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225853632
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371	NC_012466	TAT	2	6	28720	28725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
372	NC_012466	GTT	2	6	28791	28796	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
373	NC_012466	AGG	2	6	28819	28824	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
374	NC_012466	ACC	2	6	28871	28876	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225853641
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376	NC_012466	CAT	2	6	28989	28994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
377	NC_012466	AGA	2	6	29081	29086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
378	NC_012466	TTC	2	6	29265	29270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225853642
379	NC_012466	GAG	2	6	29309	29314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
380	NC_012466	AGA	2	6	29465	29470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853643
381	NC_012466	AGG	2	6	29524	29529	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225853643
382	NC_012466	TCC	2	6	29854	29859	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
383	NC_012466	TAT	2	6	29894	29899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
384	NC_012466	GAA	2	6	29935	29940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853646
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