MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Brucella melitensis ATCC 23457 chromosome II

Total Repeats: 83

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012442	CTCGTC	2	12	27144	27155	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
2	NC_012442	GCCGTG	2	12	28391	28402	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_012442	GGGTTT	2	12	77246	77257	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012442	GGGGGC	2	12	156176	156187	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_012442	CTGGTC	2	12	156270	156281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_012442	CCTCAC	2	12	156625	156636	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_012442	ACGCTG	2	12	157074	157085	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_012442	GACGGG	2	12	157202	157213	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_012442	GCCTAT	2	12	158106	158117	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_012442	GAAAAG	2	12	168399	168410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012442	CGCAAG	2	12	192955	192966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_012442	GAAGCC	2	12	205397	205408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_012442	TTCCGG	2	12	205978	205989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_012442	CTGGAA	2	12	210090	210101	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_012442	TGCTGG	2	12	210286	210297	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_012442	GGCAGG	2	12	263578	263589	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_012442	GCCTTG	2	12	269544	269555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_012442	GCCTTT	2	12	295756	295767	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_012442	CATCCG	2	12	296601	296612	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
20	NC_012442	TGGCGC	2	12	317845	317856	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_012442	GATATC	2	12	318139	318150	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_012442	TGGCTG	2	12	318276	318287	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_012442	GAAGGA	2	12	321562	321573	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012442	GCTGGC	2	12	339105	339116	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_012442	ATCCTC	2	12	355954	355965	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_012442	ACGGCA	2	12	357031	357042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_012442	TCGCAT	2	12	366338	366349	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_012442	AAATAA	2	12	379445	379456	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012442	AATTAT	2	12	397415	397426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012442	CATCGC	2	12	397747	397758	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
31	NC_012442	GGCAAG	2	12	413194	413205	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_012442	CTGTTG	2	12	419111	419122	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_012442	TCCGCG	2	12	421583	421594	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
34	NC_012442	GCTGGC	2	12	437873	437884	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_012442	ATTTTG	2	12	448438	448449	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012442	TGAAAA	2	12	508259	508270	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012442	GAGCTA	2	12	519058	519069	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_012442	TCAAAA	2	12	519299	519310	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_012442	AGCGCC	2	12	527882	527893	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
40	NC_012442	CAGCCA	2	12	537231	537242	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
41	NC_012442	GCAGCC	2	12	592951	592962	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
42	NC_012442	TGCTGG	2	12	610753	610764	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_012442	GATCAA	2	12	620755	620766	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_012442	GCGGAT	2	12	628493	628504	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_012442	TTGCGG	2	12	629277	629288	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_012442	GCATCC	2	12	629373	629384	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
47	NC_012442	CGGCTA	2	12	629491	629502	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_012442	AAAAGG	2	12	686325	686336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012442	CTCCTT	3	18	701914	701931	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_012442	GCCTTT	2	12	721715	721726	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_012442	AAAGGA	2	12	726740	726751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012442	TTATGG	2	12	870433	870444	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012442	CGGCAT	2	12	903982	903993	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_012442	GCGACA	2	12	904663	904674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_012442	TTGCCG	2	12	916621	916632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_012442	CGCCCA	2	12	917841	917852	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_012442	CGCCGT	2	12	918304	918315	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
58	NC_012442	CGTCAT	2	12	918843	918854	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_012442	CCGCAG	2	12	919254	919265	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
60	NC_012442	ATCGTC	2	12	934283	934294	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_012442	CACCGC	2	12	941619	941630	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_012442	GATCGG	2	12	941852	941863	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_012442	AGCCCC	2	12	971690	971701	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_012442	CGGAAA	2	12	1005989	1006000	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_012442	CTGGCG	2	12	1021339	1021350	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_012442	GTGGCG	2	12	1021468	1021479	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_012442	CTTCGG	2	12	1040378	1040389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_012442	TCGCCG	2	12	1061010	1061021	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
69	NC_012442	GCTGCA	2	12	1061919	1061930	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_012442	CTGCCG	2	12	1088386	1088397	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
71	NC_012442	GCATAC	2	12	1112519	1112530	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_012442	AACCGG	2	12	1118414	1118425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_012442	GGCAGC	2	12	1118733	1118744	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_012442	GACGCT	3	18	1120313	1120330	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_012442	CGGTGC	2	12	1121480	1121491	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_012442	AATTTC	2	12	1121541	1121552	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_012442	GCACCG	2	12	1122580	1122591	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
78	NC_012442	CGGCAC	2	12	1123442	1123453	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
79	NC_012442	AGCTTC	2	12	1123572	1123583	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_012442	ACGATC	2	12	1125742	1125753	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_012442	AAATCG	2	12	1135871	1135882	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_012442	GCCTCG	2	12	1155239	1155250	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
83	NC_012442	GAGGAA	2	12	1185502	1185513	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.