MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Persephonella marina EX-H1 chromosome

Total Repeats: 25271

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012440	TTA	2	6	3	8	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225849565
2	NC_012440	TCT	2	6	31	36	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225849565
3	NC_012440	CTC	2	6	51	56	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225849565
4	NC_012440	CAA	3	9	62	70	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225849565
5	NC_012440	AAG	2	6	147	152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225849565
6	NC_012440	CTT	2	6	245	250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225849565
7	NC_012440	CCT	2	6	308	313	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_012440	CTC	2	6	437	442	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225849566
9	NC_012440	TAT	2	6	455	460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225849566
10	NC_012440	AGA	2	6	594	599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225849566
11	NC_012440	GGT	2	6	675	680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225849566
12	NC_012440	ATC	2	6	725	730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225849566
13	NC_012440	CAA	2	6	796	801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225849566
14	NC_012440	TAG	2	6	838	843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225849566
15	NC_012440	GAG	2	6	917	922	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225849566
16	NC_012440	TAA	2	6	952	957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225849566
17	NC_012440	ATA	2	6	1047	1052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225849566
18	NC_012440	TCA	2	6	1053	1058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225849566
19	NC_012440	TCT	2	6	1151	1156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225849566
20	NC_012440	CTT	2	6	1157	1162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225849566
21	NC_012440	CTC	2	6	1163	1168	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225849566
22	NC_012440	TCT	2	6	1172	1177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225849566
23	NC_012440	AGA	2	6	1245	1250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225849566
24	NC_012440	TTC	2	6	1254	1259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225849566
25	NC_012440	TCT	2	6	1388	1393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225849566
26	NC_012440	GAA	2	6	1546	1551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225849566
27	NC_012440	CAT	2	6	1604	1609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225849566
28	NC_012440	CTC	2	6	1649	1654	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225849566
29	NC_012440	GTT	2	6	1793	1798	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225849566
30	NC_012440	AAC	2	6	2192	2197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225849566
31	NC_012440	CAT	2	6	2356	2361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225849566
32	NC_012440	CAT	2	6	2435	2440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225849566
33	NC_012440	CTT	2	6	2528	2533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225849566
34	NC_012440	TAA	2	6	2542	2547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225849566
35	NC_012440	ATC	2	6	2549	2554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225849566
36	NC_012440	AGT	2	6	2692	2697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225849566
37	NC_012440	CTT	2	6	2787	2792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225849566
38	NC_012440	ACC	2	6	2798	2803	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225849566
39	NC_012440	CCT	2	6	2821	2826	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225849566
40	NC_012440	TCC	2	6	2940	2945	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225849566
41	NC_012440	TCA	2	6	2982	2987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225849566
42	NC_012440	CAT	2	6	3035	3040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225849567
43	NC_012440	TCA	2	6	3133	3138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225849567
44	NC_012440	TCC	2	6	3424	3429	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225849567
45	NC_012440	ACA	2	6	3472	3477	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225849567
46	NC_012440	TAA	2	6	3508	3513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225849567
47	NC_012440	CAA	2	6	3722	3727	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225849567
48	NC_012440	TGG	2	6	3732	3737	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225849567
49	NC_012440	TTA	2	6	3820	3825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225849567
50	NC_012440	AAG	2	6	3912	3917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225849567
51	NC_012440	ACA	2	6	4030	4035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225849567
52	NC_012440	ACC	2	6	4185	4190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225849567
53	NC_012440	AGA	2	6	4257	4262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225849567
54	NC_012440	ATC	2	6	4314	4319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225849567
55	NC_012440	GAT	2	6	4324	4329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225849567
56	NC_012440	TTG	2	6	4337	4342	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225849567
57	NC_012440	ATC	2	6	4368	4373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225849567
58	NC_012440	CAA	2	6	4397	4402	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225849567
59	NC_012440	AGG	2	6	4648	4653	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012440	TGG	2	6	4786	4791	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225849568
61	NC_012440	GAT	2	6	4825	4830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225849568
62	NC_012440	ATC	2	6	4859	4864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225849568
63	NC_012440	TGA	2	6	4893	4898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225849568
64	NC_012440	ATA	2	6	4954	4959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225849568
65	NC_012440	CTT	2	6	5027	5032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225849569
66	NC_012440	AAT	2	6	5045	5050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225849569
67	NC_012440	AAC	2	6	5081	5086	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225849569
68	NC_012440	CCA	2	6	5193	5198	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225849569
69	NC_012440	CAA	2	6	5203	5208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225849569
70	NC_012440	AAC	2	6	5252	5257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225849569
71	NC_012440	ATT	2	6	5276	5281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225849569
72	NC_012440	CAT	2	6	5299	5304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225849569
73	NC_012440	TCA	2	6	5328	5333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225849569
74	NC_012440	CAT	2	6	5357	5362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225849569
75	NC_012440	CAA	2	6	5476	5481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225849569
76	NC_012440	CAT	2	6	5621	5626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225849569
77	NC_012440	TCA	2	6	5679	5684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225849569
78	NC_012440	AAT	3	9	5717	5725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225849569
79	NC_012440	TTA	2	6	5791	5796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225849569
80	NC_012440	TCA	2	6	5814	5819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225849569
81	NC_012440	TCT	2	6	5893	5898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225849569
82	NC_012440	ATC	2	6	6113	6118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225849569
83	NC_012440	CAT	2	6	6172	6177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225849569
84	NC_012440	TGA	2	6	6457	6462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225849569
85	NC_012440	GGT	2	6	6649	6654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012440	TAT	3	9	6943	6951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_012440	TAT	2	6	6955	6960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_012440	TAT	3	9	7163	7171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225849571
89	NC_012440	CAG	2	6	7172	7177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225849571
90	NC_012440	ATT	2	6	7267	7272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225849571
91	NC_012440	TAA	2	6	7400	7405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225849571
92	NC_012440	AGA	2	6	7536	7541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225849571
93	NC_012440	GGA	2	6	7607	7612	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225849571
94	NC_012440	TGT	2	6	7734	7739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225849571
95	NC_012440	AAG	2	6	7762	7767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225849571
96	NC_012440	AAG	2	6	7857	7862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225849571
97	NC_012440	GTA	2	6	7875	7880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225849571
98	NC_012440	TTC	2	6	7885	7890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225849572
99	NC_012440	TGG	2	6	7939	7944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225849572
100	NC_012440	CAT	2	6	7982	7987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225849572
101	NC_012440	CAT	3	9	8042	8050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225849572
102	NC_012440	ATG	2	6	8056	8061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225849572
103	NC_012440	TCT	2	6	8144	8149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225849572
104	NC_012440	CCA	2	6	8158	8163	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225849572
105	NC_012440	GCT	2	6	8263	8268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225849572
106	NC_012440	GAT	2	6	8433	8438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225849572
107	NC_012440	CTG	2	6	8473	8478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225849572
108	NC_012440	TAT	2	6	8556	8561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225849572
109	NC_012440	TCT	2	6	8591	8596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225849572
110	NC_012440	TCA	2	6	8647	8652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225849572
111	NC_012440	CTG	2	6	8786	8791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225849572
112	NC_012440	CTT	2	6	8807	8812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225849572
113	NC_012440	TTA	2	6	8816	8821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225849572
114	NC_012440	TGT	2	6	8939	8944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225849572
115	NC_012440	CAA	2	6	8960	8965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225849572
116	NC_012440	TAT	2	6	8967	8972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225849572
117	NC_012440	CTT	2	6	9073	9078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225849572
118	NC_012440	TCT	2	6	9404	9409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225849572
119	NC_012440	TCA	2	6	9583	9588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225849572
120	NC_012440	CTT	2	6	9600	9605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225849572
121	NC_012440	ACA	2	6	9826	9831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225849572
122	NC_012440	CTT	2	6	9876	9881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225849572
123	NC_012440	GAA	2	6	9896	9901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225849572
124	NC_012440	TTC	2	6	9924	9929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225849572
125	NC_012440	GTT	2	6	9933	9938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225849572
126	NC_012440	GTA	2	6	9939	9944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225849572
127	NC_012440	TGT	2	6	10043	10048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225849572
128	NC_012440	CTT	2	6	10142	10147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225849572
129	NC_012440	TGT	2	6	10231	10236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225849573
130	NC_012440	GAA	2	6	10285	10290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225849573
131	NC_012440	TTG	2	6	10387	10392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225849573
132	NC_012440	CAG	2	6	10419	10424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225849573
133	NC_012440	TGG	2	6	10442	10447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225849573
134	NC_012440	ACA	2	6	10482	10487	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225849573
135	NC_012440	TTA	2	6	10540	10545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225849573
136	NC_012440	TCA	2	6	10546	10551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225849573
137	NC_012440	ACT	2	6	10619	10624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_012440	ATT	2	6	10633	10638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_012440	ACC	2	6	10698	10703	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225849574
140	NC_012440	TCA	2	6	10834	10839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225849574
141	NC_012440	AAC	2	6	11061	11066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225849574
142	NC_012440	TCC	2	6	11116	11121	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225849574
143	NC_012440	ACT	2	6	11299	11304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225849574
144	NC_012440	ATC	2	6	11395	11400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225849575
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146	NC_012440	CTT	2	6	11555	11560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225849575
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152	NC_012440	CAT	2	6	11940	11945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225849575
153	NC_012440	CTT	2	6	12007	12012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225849575
154	NC_012440	GCT	2	6	12143	12148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225849575
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163	NC_012440	TAT	2	6	12634	12639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225849575
164	NC_012440	TTC	2	6	12749	12754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225849575
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241	NC_012440	AAG	3	9	19022	19030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225849583
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253	NC_012440	GAT	2	6	19905	19910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225849583
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257	NC_012440	CAA	2	6	20317	20322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225849583
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500	NC_012440	ATA	2	6	40994	40999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225849605

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