MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Sulfurihydrogenibium azorense Az-Fu1 chromosome

Total Repeats: 884

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012438	TAACTC	2	12	3420	3431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225847842
2	NC_012438	AGCTAT	2	12	5927	5938	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	225847846
3	NC_012438	TTCTTG	2	12	6686	6697	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	225847846
4	NC_012438	ATCTTT	2	12	7844	7855	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	225847846
5	NC_012438	GATAGA	2	12	9161	9172	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	225847848
6	NC_012438	TAAAGA	2	12	11976	11987	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	225847851
7	NC_012438	TTTTTA	2	12	16405	16416	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	225847855
8	NC_012438	ATACCT	2	12	17522	17533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225847856
9	NC_012438	ACAGGA	2	12	20493	20504	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	225847860
10	NC_012438	GAATAA	2	12	21218	21229	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	225847860
11	NC_012438	CTTTCC	2	12	22943	22954	0 %	50 %	0 %	50 %	225847861
12	NC_012438	TAAGAA	2	12	25852	25863	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	225847864
13	NC_012438	GCTGTT	2	12	27647	27658	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	225847866
14	NC_012438	GTCTTA	2	12	27669	27680	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	225847866
15	NC_012438	TCAACA	2	12	28442	28453	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	225847866
16	NC_012438	TTACAA	2	12	30689	30700	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	225847867
17	NC_012438	GTAAAC	2	12	34014	34025	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	225847871
18	NC_012438	AGAAAA	2	12	34631	34642	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	225847873
19	NC_012438	AGAGAA	2	12	35493	35504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225847873
20	NC_012438	TATTTT	2	12	37384	37395	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	225847875
21	NC_012438	ATGAAG	2	12	40660	40671	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	225847875
22	NC_012438	TAAAAG	2	12	43531	43542	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	225847880
23	NC_012438	TATGTA	2	12	44213	44224	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	225847881
24	NC_012438	TGCTAT	2	12	45182	45193	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	225847883
25	NC_012438	TTCTGC	2	12	47177	47188	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	225847886
26	NC_012438	CTCAAT	2	12	54083	54094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225847893
27	NC_012438	GGCTTG	2	12	54332	54343	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	225847893
28	NC_012438	AGCAGA	2	12	55032	55043	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	225847893
29	NC_012438	CTAAAA	2	12	57040	57051	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	225847895
30	NC_012438	TTTACT	2	12	70399	70410	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	225847911
31	NC_012438	TCATTT	2	12	70757	70768	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	225847912
32	NC_012438	CTTTTT	2	12	72225	72236	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	225847914
33	NC_012438	TCTGTT	2	12	72690	72701	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	225847915
34	NC_012438	GCTTTT	2	12	73086	73097	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	225847915
35	NC_012438	GTCTAT	2	12	75281	75292	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	225847918
36	NC_012438	CTGGTC	2	12	75736	75747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225847918
37	NC_012438	CCTTAT	2	12	76393	76404	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	225847919
38	NC_012438	CTTTCA	2	12	77623	77634	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	225847920
39	NC_012438	AGAAAG	2	12	80277	80288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225847925
40	NC_012438	GAATTA	2	12	80867	80878	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	225847925
41	NC_012438	TTATAG	2	12	86203	86214	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	225847929
42	NC_012438	TTGCTT	2	12	86299	86310	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	225847929
43	NC_012438	ACTTCA	2	12	86319	86330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225847929
44	NC_012438	TTCATC	2	12	86802	86813	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	225847929
45	NC_012438	TCTAAA	2	12	88801	88812	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	225847933
46	NC_012438	CATCAA	2	12	89219	89230	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	225847933
47	NC_012438	AATACC	2	12	93216	93227	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	225847941
48	NC_012438	TTATGC	2	12	94984	94995	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	225847944
49	NC_012438	CTTTGG	2	12	95455	95466	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	225847945
50	NC_012438	CAAAAG	2	12	95475	95486	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	225847945
51	NC_012438	TAGATT	2	12	96191	96202	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	225847945
52	NC_012438	GGAATG	2	12	98281	98292	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	225847947
53	NC_012438	ATGTAA	2	12	103239	103250	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	225847952
54	NC_012438	CTTTTG	2	12	103449	103460	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	225847953
55	NC_012438	CTTTTT	2	12	103956	103967	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	225847953
56	NC_012438	CTTTGA	2	12	111386	111397	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	225847963
57	NC_012438	TCCCAT	2	12	111583	111594	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	225847963
58	NC_012438	TAAGGA	2	12	116611	116622	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	225847970
59	NC_012438	AAAAGA	2	12	117602	117613	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	225847971
60	NC_012438	CTGTAA	2	12	118554	118565	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	225847972
61	NC_012438	AGATAA	2	12	119221	119232	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	225847972
62	NC_012438	TATACA	2	12	119954	119965	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	225847973
63	NC_012438	TTTATT	2	12	120850	120861	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	225847974
64	NC_012438	AATGTA	2	12	124778	124789	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	225847977
65	NC_012438	TTGATG	2	12	127726	127737	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	225847982
66	NC_012438	CAATTC	2	12	128407	128418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225847982
67	NC_012438	AGAAAG	2	12	130583	130594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225847987
68	NC_012438	GAATTA	2	12	131173	131184	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	225847987
69	NC_012438	AAATTT	2	12	132445	132456	50 %	50 %	0 %	0 %	225847989
70	NC_012438	TGCAGA	2	12	135747	135758	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	225847991
71	NC_012438	ATAGGA	2	12	139763	139774	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	225847995
72	NC_012438	GAAAGG	2	12	140596	140607	50 %	0 %	50 %	0 %	225847996
73	NC_012438	TAAAGA	2	12	141224	141235	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	225847996
74	NC_012438	TAGGAA	2	12	141446	141457	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	225847996
75	NC_012438	CCATCC	2	12	145214	145225	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	225848001
76	NC_012438	ACCAAG	2	12	146540	146551	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	225848002
77	NC_012438	ACAAAA	2	12	146797	146808	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	225848002
78	NC_012438	CATACA	2	12	147012	147023	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	225848002
79	NC_012438	ACATTC	2	12	149847	149858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225848004
80	NC_012438	AAAAGA	2	12	149983	149994	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	225848004
81	NC_012438	ATTTAG	2	12	150510	150521	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	225848005
82	NC_012438	AGATTT	2	12	154292	154303	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	225848010
83	NC_012438	ATAGCC	2	12	154317	154328	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	225848010
84	NC_012438	AAGTTA	2	12	156523	156534	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	225848012
85	NC_012438	GCTTTT	2	12	157210	157221	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	225848012
86	NC_012438	TAAAAG	2	12	158014	158025	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	225848013
87	NC_012438	TATTCC	2	12	158965	158976	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	225848015
88	NC_012438	TCTTTT	2	12	161094	161105	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	225848017
89	NC_012438	TTTAAG	2	12	161222	161233	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	225848018
90	NC_012438	TAATTT	2	12	163514	163525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225848021
91	NC_012438	TATAGC	2	12	164756	164767	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	225848022
92	NC_012438	ACCTCT	2	12	168438	168449	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	225848025
93	NC_012438	TCCTTC	2	12	169514	169525	0 %	50 %	0 %	50 %	225848025
94	NC_012438	ATCTTT	2	12	170959	170970	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	225848027
95	NC_012438	TGTATA	2	12	171455	171466	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	225848028
96	NC_012438	TTTCTT	2	12	171689	171700	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	225848029
97	NC_012438	TTCCCG	2	12	172547	172558	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	225848030
98	NC_012438	TTGTTT	2	12	173697	173708	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	225848032
99	NC_012438	TAAAAG	2	12	174712	174723	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	225848033
100	NC_012438	ATATCT	2	12	175902	175913	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	225848034
101	NC_012438	AGGGCA	2	12	177915	177926	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	225848034
102	NC_012438	TACTTT	2	12	179723	179734	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	225848037
103	NC_012438	AACTTG	2	12	182103	182114	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	225848039
104	NC_012438	ACGTAA	2	12	182792	182803	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	225848040
105	NC_012438	TTTAAT	2	12	182966	182977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225848040
106	NC_012438	ACATTG	2	12	190110	190121	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	225848049
107	NC_012438	TTAAAC	2	12	193399	193410	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	225848053
108	NC_012438	TTTTGA	2	12	193566	193577	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	225848053
109	NC_012438	TCCAAA	2	12	200149	200160	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	225848059
110	NC_012438	CTTTTG	2	12	200442	200453	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	225848059
111	NC_012438	GTTTTG	2	12	203486	203497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225848060
112	NC_012438	TTTATC	2	12	204364	204375	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	225848060
113	NC_012438	ACTATA	2	12	204763	204774	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	225848060
114	NC_012438	TTGTTA	2	12	207614	207625	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	225848062
115	NC_012438	ACGTGG	2	12	209191	209202	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	225848065
116	NC_012438	TTTAGT	2	12	210181	210192	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	225848065
117	NC_012438	TTCTAT	2	12	210828	210839	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	225848065
118	NC_012438	TATCTT	2	12	211037	211048	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	225848065
119	NC_012438	GATTTA	2	12	211341	211352	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	225848066
120	NC_012438	CTCTAT	2	12	214032	214043	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	225848069
121	NC_012438	ATTTTT	2	12	215578	215589	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	225848072
122	NC_012438	ACATCA	2	12	216950	216961	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	225848075
123	NC_012438	TGCACT	2	12	217910	217921	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	225848077
124	NC_012438	TTGAAC	2	12	217996	218007	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	225848077
125	NC_012438	ACTAAA	2	12	222538	222549	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	225848080
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220	NC_012438	AAGTTA	2	12	393662	393673	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	225848267
221	NC_012438	CAGCGT	2	12	400184	400195	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	225848275
222	NC_012438	TCTAAA	2	12	405068	405079	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	225848282
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224	NC_012438	ACGTAA	2	12	409220	409231	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	225848287
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226	NC_012438	CCAGCT	2	12	412353	412364	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	225848289
227	NC_012438	TCTCTA	2	12	415295	415306	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	225848292
228	NC_012438	ACTTTA	2	12	419929	419940	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	225848296
229	NC_012438	AATCCC	2	12	420148	420159	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	225848296
230	NC_012438	ATATCA	2	12	421920	421931	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	225848296
231	NC_012438	TTAAGA	2	12	422966	422977	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	225848297
232	NC_012438	GTAAGC	2	12	423221	423232	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	225848298
233	NC_012438	ATAGGA	2	12	424668	424679	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	225848301
234	NC_012438	AGAAAA	2	12	426094	426105	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	225848305
235	NC_012438	TAGAGA	2	12	426138	426149	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	225848305
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