MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Sulfurihydrogenibium azorense Az-Fu1 chromosome

Total Repeats: 116

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012438	CAAAA	2	10	18357	18366	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_012438	TTTAA	2	10	25489	25498	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012438	ATTTA	2	10	46530	46539	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012438	TAAAA	2	10	57624	57633	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012438	AATTT	2	10	68107	68116	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012438	ACTTA	2	10	84015	84024	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_012438	ATTTT	2	10	107725	107734	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012438	CAGAA	2	10	108544	108553	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_012438	TAAAA	2	10	112513	112522	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012438	AGGGG	2	10	112557	112566	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012438	TTTTA	2	10	124550	124559	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012438	TAAAA	2	10	150297	150306	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012438	TTAAG	2	10	153268	153277	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012438	TATAA	2	10	219899	219908	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012438	AAAAT	2	10	220065	220074	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012438	ATTTT	2	10	234050	234059	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012438	AGTAT	2	10	235338	235347	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012438	AATCG	2	10	236853	236862	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_012438	ATTAT	2	10	291316	291325	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012438	TTCTT	2	10	324381	324390	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_012438	GATTT	2	10	336186	336195	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012438	TAATT	2	10	340500	340509	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012438	GATAT	2	10	342606	342615	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012438	TTGAT	2	10	350805	350814	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012438	TAATA	2	10	377559	377568	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012438	TAAAT	2	10	377686	377695	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012438	AAATT	2	10	387286	387295	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012438	AGAGA	2	10	393940	393949	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012438	CTTTT	2	10	398780	398789	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_012438	GCAAA	2	10	400600	400609	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NC_012438	AAATT	2	10	402703	402712	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012438	TATAA	2	10	458756	458765	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012438	TCACC	2	10	482737	482746	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
34	NC_012438	TTTAG	2	10	483065	483074	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012438	TAAAA	2	10	483436	483445	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012438	AATAT	2	10	507645	507654	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012438	TTTTA	2	10	514267	514276	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012438	ATTAG	2	10	553496	553505	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012438	GTAAA	2	10	559220	559229	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012438	ATTAA	2	10	568366	568375	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012438	AGAAA	2	10	629565	629574	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012438	TAAAA	2	10	630516	630525	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012438	AATAA	2	10	631285	631294	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012438	TAAAA	2	10	673811	673820	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012438	CTTTT	2	10	674032	674041	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_012438	TAATA	2	10	674141	674150	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012438	GAAAG	2	10	688984	688993	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012438	AGTAA	2	10	702684	702693	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012438	GAAAA	2	10	706028	706037	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012438	CACTT	2	10	755679	755688	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
51	NC_012438	ACAAA	2	10	755774	755783	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_012438	TTACT	2	10	769776	769785	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_012438	ATGTT	2	10	769968	769977	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012438	CTATT	2	10	788752	788761	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_012438	AAAAG	2	10	790054	790063	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012438	TTTAT	2	10	807089	807098	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012438	GCCGC	2	10	827977	827986	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
58	NC_012438	TCGTG	2	10	828013	828022	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
59	NC_012438	ACGCA	2	10	828200	828209	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
60	NC_012438	GAAAA	2	10	828719	828728	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012438	TCCAA	2	10	830157	830166	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
62	NC_012438	AATAT	2	10	847469	847478	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012438	TATCA	2	10	864876	864885	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_012438	TAATT	2	10	872268	872277	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012438	GTTTA	2	10	917592	917601	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012438	AAAAG	2	10	919469	919478	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012438	ATCTT	2	10	919913	919922	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_012438	GTAAA	2	10	962677	962686	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012438	CTACA	2	10	973889	973898	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
70	NC_012438	TAAAA	2	10	988935	988944	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012438	TATAA	2	10	989670	989679	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012438	CCTGT	2	10	1002660	1002669	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
73	NC_012438	TCTCT	2	10	1010184	1010193	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
74	NC_012438	GATTT	2	10	1010513	1010522	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012438	GCATG	2	10	1011236	1011245	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
76	NC_012438	TTTAT	2	10	1013779	1013788	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012438	AAACA	2	10	1023847	1023856	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_012438	TTTAA	2	10	1035302	1035311	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012438	TCTCC	2	10	1043354	1043363	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
80	NC_012438	GTAAA	2	10	1046983	1046992	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012438	AAAAT	2	10	1048149	1048158	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012438	CTTTA	2	10	1058276	1058285	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_012438	AATAG	2	10	1082754	1082763	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012438	TAAAA	2	10	1145977	1145986	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012438	AATAG	2	10	1158280	1158289	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012438	AACTT	2	10	1176761	1176770	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_012438	TTTAT	2	10	1199908	1199917	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_012438	CTTAA	2	10	1207990	1207999	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_012438	TAATA	2	10	1209673	1209682	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_012438	TTAAC	2	10	1214746	1214755	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_012438	TTTTC	2	10	1223816	1223825	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_012438	AATAA	2	10	1224018	1224027	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_012438	ATATT	2	10	1286707	1286716	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012438	TATAA	2	10	1294925	1294934	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_012438	TTTAA	2	10	1363075	1363084	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_012438	TAAAA	2	10	1410919	1410928	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012438	GAGAG	2	10	1434617	1434626	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
98	NC_012438	TATAA	2	10	1463031	1463040	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_012438	CTATA	2	10	1471202	1471211	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_012438	ATTAT	2	10	1471285	1471294	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_012438	TTTAA	2	10	1478754	1478763	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_012438	TTTGT	2	10	1481292	1481301	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_012438	TTTAC	3	15	1488436	1488450	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_012438	ATAAA	2	10	1488463	1488472	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_012438	CTAAT	2	10	1506149	1506158	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_012438	GCCAA	2	10	1522300	1522309	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
107	NC_012438	ATTGG	2	10	1523839	1523848	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
108	NC_012438	CACGA	2	10	1525984	1525993	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
109	NC_012438	TTTTG	2	10	1527246	1527255	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_012438	AGAAA	2	10	1566114	1566123	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_012438	TACAA	2	10	1568267	1568276	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_012438	TTTCA	2	10	1580314	1580323	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_012438	ATTTT	2	10	1585294	1585303	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012438	TATAA	2	10	1585304	1585313	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_012438	ATATA	2	10	1599859	1599868	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_012438	TGTTT	2	10	1602819	1602828	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.