MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus USA300_TCH1516 plasmid pUSA01-HOU

Total Repeats: 38

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012417	ATA	2	6	8	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225631040
2	NC_012417	CTA	2	6	14	19	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225631040
3	NC_012417	ATA	2	6	41	46	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225631040
4	NC_012417	AAC	2	6	77	82	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225631040
5	NC_012417	TGA	2	6	201	206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225631040
6	NC_012417	CAA	2	6	365	370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225631040
7	NC_012417	TTG	2	6	467	472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225631040
8	NC_012417	TAA	2	6	501	506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225631040
9	NC_012417	AAG	2	6	593	598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225631040
10	NC_012417	ATC	2	6	735	740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225631040
11	NC_012417	TGA	4	12	753	764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225631040
12	NC_012417	TGG	2	6	828	833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225631040
13	NC_012417	TGA	2	6	903	908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225631040
14	NC_012417	ACA	2	6	916	921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225631040
15	NC_012417	GAA	3	9	925	933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225631040
16	NC_012417	ATT	3	9	977	985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225631040
17	NC_012417	GTT	2	6	1732	1737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225631042
18	NC_012417	AAT	2	6	1759	1764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225631042
19	NC_012417	TCT	2	6	1796	1801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225631043
20	NC_012417	GTT	2	6	1834	1839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225631043
21	NC_012417	GAT	2	6	1864	1869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225631043
22	NC_012417	GAA	2	6	1885	1890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225631043
23	NC_012417	ATA	2	6	1910	1915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225631043
24	NC_012417	GAC	2	6	1923	1928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225631043
25	NC_012417	GAA	2	6	1961	1966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012417	TAG	2	6	2140	2145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225631044
27	NC_012417	CTG	2	6	2236	2241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225631044
28	NC_012417	CCA	2	6	2322	2327	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225631044
29	NC_012417	ATA	2	6	2469	2474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225631044
30	NC_012417	CTT	2	6	2572	2577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225631044
31	NC_012417	TAC	2	6	2627	2632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225631044
32	NC_012417	ATT	2	6	2773	2778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225631045
33	NC_012417	TTA	2	6	2779	2784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225631045
34	NC_012417	AGA	2	6	2909	2914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225631045
35	NC_012417	GTT	2	6	2923	2928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012417	TCT	2	6	2953	2958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_012417	TAT	2	6	3080	3085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012417	ATA	2	6	3104	3109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.