MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Brachyspira hyodysenteriae WA1 plasmid pBHWA1

Total Repeats: 27

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012226	GTCTCT	2	12	1504	1515	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	225350701
2	NC_012226	AAAATT	2	12	3037	3048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225350703
3	NC_012226	AAATTT	2	12	4278	4289	50 %	50 %	0 %	0 %	225350704
4	NC_012226	TTTAAA	2	12	4387	4398	50 %	50 %	0 %	0 %	225350704
5	NC_012226	ATGTAT	2	12	4956	4967	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	225350704
6	NC_012226	ATTTCA	2	12	5846	5857	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	225350705
7	NC_012226	TTATCA	2	12	6860	6871	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	225350705
8	NC_012226	ATCTAT	2	12	7320	7331	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	225350706
9	NC_012226	AAATCA	2	12	9484	9495	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	225350707
10	NC_012226	AAATAA	2	12	9782	9793	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	225350707
11	NC_012226	TTTCTA	2	12	9869	9880	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	225350707
12	NC_012226	ATTTTT	2	12	9883	9894	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	225350707
13	NC_012226	AACTAT	2	12	10385	10396	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	225350707
14	NC_012226	TCAAAA	2	12	11675	11686	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	225350708
15	NC_012226	TAGATT	2	12	12352	12363	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	225350709
16	NC_012226	TTTCAC	2	12	13485	13496	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	225350710
17	NC_012226	TAAATC	2	12	13867	13878	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	225350710
18	NC_012226	TCAAAA	2	12	14889	14900	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	225350711
19	NC_012226	TAACCT	2	12	15853	15864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225350712
20	NC_012226	ATTTAA	2	12	16736	16747	50 %	50 %	0 %	0 %	225350713
21	NC_012226	AATTCT	2	12	20396	20407	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	225350717
22	NC_012226	TTAAAT	2	12	21952	21963	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012226	TTTTTA	2	12	22360	22371	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	225350719
24	NC_012226	TTTTTA	2	12	25776	25787	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012226	TATCTA	2	12	27582	27593	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	225350723
26	NC_012226	TATTTT	2	12	28161	28172	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	225350723
27	NC_012226	TTCCGC	2	12	31730	31741	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	225350726

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.