MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Brachyspira hyodysenteriae WA1 plasmid pBHWA1

Total Repeats: 613

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012226	TCT	2	6	165	170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_012226	AGC	2	6	206	211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_012226	TTC	2	6	302	307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_012226	ATA	2	6	527	532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012226	TAA	2	6	562	567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012226	AAT	3	9	703	711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012226	TCT	2	6	756	761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_012226	TCT	2	6	858	863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_012226	TTC	2	6	899	904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_012226	ATA	2	6	974	979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012226	TCT	2	6	1095	1100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_012226	TAA	2	6	1261	1266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225350701
13	NC_012226	CTC	2	6	1327	1332	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225350701
14	NC_012226	TAT	2	6	1363	1368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225350701
15	NC_012226	ATT	2	6	1383	1388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225350701
16	NC_012226	ATT	2	6	1457	1462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225350701
17	NC_012226	TAT	2	6	1555	1560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225350701
18	NC_012226	TTA	2	6	1566	1571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225350701
19	NC_012226	TTC	2	6	1586	1591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225350701
20	NC_012226	TGA	2	6	1688	1693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225350701
21	NC_012226	CTA	2	6	1753	1758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225350701
22	NC_012226	TAT	3	9	1759	1767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225350701
23	NC_012226	CTC	2	6	1804	1809	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225350701
24	NC_012226	TAT	2	6	1843	1848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225350701
25	NC_012226	TAA	2	6	1880	1885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225350701
26	NC_012226	AGA	2	6	1897	1902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225350701
27	NC_012226	TAT	2	6	1912	1917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225350701
28	NC_012226	ATT	2	6	1922	1927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225350701
29	NC_012226	ATT	2	6	1934	1939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225350701
30	NC_012226	TTA	2	6	1945	1950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225350701
31	NC_012226	TAA	2	6	2009	2014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225350701
32	NC_012226	TAA	2	6	2021	2026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225350701
33	NC_012226	TAA	2	6	2057	2062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225350701
34	NC_012226	CTA	2	6	2076	2081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225350702
35	NC_012226	ATT	2	6	2140	2145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225350702
36	NC_012226	TAT	2	6	2190	2195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225350702
37	NC_012226	ATA	2	6	2202	2207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225350702
38	NC_012226	ACC	2	6	2256	2261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225350702
39	NC_012226	TTA	2	6	2291	2296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225350702
40	NC_012226	TCT	2	6	2351	2356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225350702
41	NC_012226	TAT	2	6	2400	2405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225350702
42	NC_012226	TTC	2	6	2425	2430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225350702
43	NC_012226	ATT	2	6	2557	2562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225350702
44	NC_012226	TAT	2	6	2595	2600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225350702
45	NC_012226	TTC	2	6	2617	2622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225350702
46	NC_012226	TAT	2	6	2638	2643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225350702
47	NC_012226	TCA	2	6	2681	2686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225350702
48	NC_012226	ATT	2	6	2710	2715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225350702
49	NC_012226	TAA	2	6	2730	2735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225350702
50	NC_012226	ATT	2	6	2807	2812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225350702
51	NC_012226	TTC	2	6	2854	2859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225350702
52	NC_012226	TGT	2	6	2874	2879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225350702
53	NC_012226	TTC	2	6	2884	2889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225350702
54	NC_012226	TCT	2	6	2923	2928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225350702
55	NC_012226	TAT	3	9	2991	2999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012226	ATA	2	6	3007	3012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012226	TAA	2	6	3031	3036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225350703
58	NC_012226	ATG	2	6	3054	3059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225350703
59	NC_012226	TTA	2	6	3101	3106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225350703
60	NC_012226	AGA	2	6	3151	3156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225350703
61	NC_012226	AAT	2	6	3178	3183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225350703
62	NC_012226	TAT	2	6	3225	3230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225350703
63	NC_012226	TAA	2	6	3255	3260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225350703
64	NC_012226	TTA	2	6	3303	3308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225350703
65	NC_012226	TAA	2	6	3388	3393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225350703
66	NC_012226	ACT	2	6	3404	3409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225350703
67	NC_012226	ATT	2	6	3412	3417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225350703
68	NC_012226	ATC	2	6	3418	3423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225350703
69	NC_012226	AGA	2	6	3442	3447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225350703
70	NC_012226	TAG	2	6	3484	3489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225350703
71	NC_012226	TAA	3	9	3516	3524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225350703
72	NC_012226	AAT	2	6	3570	3575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225350703
73	NC_012226	CTT	2	6	3588	3593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225350703
74	NC_012226	TCT	2	6	3641	3646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225350703
75	NC_012226	TTA	2	6	3692	3697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225350703
76	NC_012226	AAT	2	6	3753	3758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225350703
77	NC_012226	TAA	2	6	3769	3774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225350703
78	NC_012226	ATT	2	6	3775	3780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225350703
79	NC_012226	TTC	2	6	3826	3831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225350703
80	NC_012226	ATA	2	6	3845	3850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225350703
81	NC_012226	AAT	2	6	3858	3863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225350703
82	NC_012226	ATC	2	6	3961	3966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225350703
83	NC_012226	AAT	2	6	3995	4000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225350703
84	NC_012226	ATT	2	6	4063	4068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225350704
85	NC_012226	TCA	2	6	4228	4233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225350704
86	NC_012226	TAT	2	6	4247	4252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225350704
87	NC_012226	ATA	2	6	4309	4314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225350704
88	NC_012226	ATT	2	6	4318	4323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225350704
89	NC_012226	AAT	3	9	4501	4509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225350704
90	NC_012226	ATG	2	6	4515	4520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225350704
91	NC_012226	ATC	2	6	4524	4529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225350704
92	NC_012226	AAT	3	9	4559	4567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225350704
93	NC_012226	GAG	2	6	4574	4579	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225350704
94	NC_012226	ATA	2	6	4582	4587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225350704
95	NC_012226	CTT	2	6	4634	4639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225350704
96	NC_012226	ATT	2	6	4734	4739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225350704
97	NC_012226	ATT	2	6	4746	4751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225350704
98	NC_012226	CTA	2	6	4793	4798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225350704
99	NC_012226	TCT	2	6	4864	4869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225350704
100	NC_012226	TAA	2	6	4922	4927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225350704
101	NC_012226	CAT	2	6	4935	4940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225350704
102	NC_012226	TCT	2	6	4990	4995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225350704
103	NC_012226	AAT	2	6	5015	5020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225350704
104	NC_012226	TTA	2	6	5023	5028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225350704
105	NC_012226	CCA	2	6	5131	5136	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225350705
106	NC_012226	TTA	2	6	5217	5222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225350705
107	NC_012226	TAA	2	6	5332	5337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225350705
108	NC_012226	ATT	2	6	5380	5385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225350705
109	NC_012226	TGG	2	6	5464	5469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225350705
110	NC_012226	TAT	3	9	5550	5558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225350705
111	NC_012226	TAA	2	6	5577	5582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225350705
112	NC_012226	TAA	2	6	5659	5664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225350705
113	NC_012226	TAC	2	6	5712	5717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225350705
114	NC_012226	TTA	2	6	5727	5732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225350705
115	NC_012226	TTA	2	6	5762	5767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225350705
116	NC_012226	ATA	2	6	5799	5804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225350705
117	NC_012226	TTA	2	6	5858	5863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225350705
118	NC_012226	TAA	2	6	5872	5877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225350705
119	NC_012226	TAA	2	6	5884	5889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225350705
120	NC_012226	TTC	2	6	6037	6042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225350705
121	NC_012226	AAT	2	6	6201	6206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225350705
122	NC_012226	AAG	2	6	6223	6228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225350705
123	NC_012226	AAT	2	6	6242	6247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225350705
124	NC_012226	CAA	2	6	6285	6290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225350705
125	NC_012226	ATC	2	6	6334	6339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225350705
126	NC_012226	ACA	2	6	6404	6409	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225350705
127	NC_012226	CTT	2	6	6561	6566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225350705
128	NC_012226	TAT	2	6	6580	6585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225350705
129	NC_012226	TTA	4	12	6627	6638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225350705
130	NC_012226	TTA	2	6	6665	6670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225350705
131	NC_012226	TTC	2	6	6766	6771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225350705
132	NC_012226	ATT	3	9	6781	6789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225350705
133	NC_012226	ATC	2	6	6847	6852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225350705
134	NC_012226	TAT	2	6	6853	6858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225350705
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391	NC_012226	ATA	3	9	22778	22786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225350719
392	NC_012226	TTA	2	6	22935	22940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225350719
393	NC_012226	AAT	2	6	23035	23040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225350719
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396	NC_012226	ATA	2	6	23301	23306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225350719
397	NC_012226	TTA	2	6	23320	23325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
398	NC_012226	ATA	2	6	23326	23331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
399	NC_012226	TAA	2	6	23445	23450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
400	NC_012226	TAT	2	6	23451	23456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
401	NC_012226	TTA	2	6	23460	23465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225350720
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421	NC_012226	TCT	2	6	24585	24590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225350721
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