MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Brachyspira hyodysenteriae WA1 chromosome

Total Repeats: 7833

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012225	AATA	2	8	233	240	75 %	25 %	0 %	0 %	225618951
2	NC_012225	AATA	2	8	301	308	75 %	25 %	0 %	0 %	225618951
3	NC_012225	AATA	2	8	370	377	75 %	25 %	0 %	0 %	225618951
4	NC_012225	AATA	2	8	439	446	75 %	25 %	0 %	0 %	225618951
5	NC_012225	AATA	2	8	508	515	75 %	25 %	0 %	0 %	225618951
6	NC_012225	AATA	2	8	577	584	75 %	25 %	0 %	0 %	225618951
7	NC_012225	GATT	2	8	1028	1035	25 %	50 %	25 %	0 %	225618952
8	NC_012225	TAAT	2	8	2334	2341	50 %	50 %	0 %	0 %	225618953
9	NC_012225	ATTA	2	8	2426	2433	50 %	50 %	0 %	0 %	225618954
10	NC_012225	AATT	2	8	2670	2677	50 %	50 %	0 %	0 %	225618954
11	NC_012225	TCTG	2	8	2854	2861	0 %	50 %	25 %	25 %	225618954
12	NC_012225	TAAA	2	8	3099	3106	75 %	25 %	0 %	0 %	225618954
13	NC_012225	TTTA	2	8	3192	3199	25 %	75 %	0 %	0 %	225618955
14	NC_012225	TTTA	2	8	3370	3377	25 %	75 %	0 %	0 %	225618955
15	NC_012225	TTTC	2	8	3750	3757	0 %	75 %	0 %	25 %	225618955
16	NC_012225	AGGA	2	8	4466	4473	50 %	0 %	50 %	0 %	225618957
17	NC_012225	ATTT	3	12	5140	5151	25 %	75 %	0 %	0 %	225618958
18	NC_012225	ATTC	2	8	5995	6002	25 %	50 %	0 %	25 %	225618958
19	NC_012225	TACA	2	8	7465	7472	50 %	25 %	0 %	25 %	225618960
20	NC_012225	TTTC	2	8	7732	7739	0 %	75 %	0 %	25 %	225618960
21	NC_012225	TTTC	2	8	8203	8210	0 %	75 %	0 %	25 %	225618961
22	NC_012225	AATA	2	8	8237	8244	75 %	25 %	0 %	0 %	225618961
23	NC_012225	AGAA	2	8	9992	9999	75 %	0 %	25 %	0 %	225618962
24	NC_012225	TTTA	2	8	10197	10204	25 %	75 %	0 %	0 %	225618962
25	NC_012225	TTGT	2	8	10288	10295	0 %	75 %	25 %	0 %	225618962
26	NC_012225	CCTG	2	8	10585	10592	0 %	25 %	25 %	50 %	225618962
27	NC_012225	ATTT	2	8	10907	10914	25 %	75 %	0 %	0 %	225618962
28	NC_012225	TATT	2	8	11099	11106	25 %	75 %	0 %	0 %	225618962
29	NC_012225	ATTA	2	8	11107	11114	50 %	50 %	0 %	0 %	225618962
30	NC_012225	ATTA	2	8	11642	11649	50 %	50 %	0 %	0 %	225618963
31	NC_012225	GAAT	2	8	12650	12657	50 %	25 %	25 %	0 %	225618964
32	NC_012225	TCTG	2	8	13273	13280	0 %	50 %	25 %	25 %	225618964
33	NC_012225	AATG	2	8	13432	13439	50 %	25 %	25 %	0 %	225618964
34	NC_012225	AGCA	2	8	13630	13637	50 %	0 %	25 %	25 %	225618964
35	NC_012225	TTGC	2	8	14096	14103	0 %	50 %	25 %	25 %	225618964
36	NC_012225	TAAA	2	8	14502	14509	75 %	25 %	0 %	0 %	225618964
37	NC_012225	AATA	2	8	14513	14520	75 %	25 %	0 %	0 %	225618964
38	NC_012225	TGTA	2	8	14586	14593	25 %	50 %	25 %	0 %	225618964
39	NC_012225	ATTT	2	8	15147	15154	25 %	75 %	0 %	0 %	225618964
40	NC_012225	CAAT	2	8	15297	15304	50 %	25 %	0 %	25 %	225618964
41	NC_012225	TATT	2	8	15410	15417	25 %	75 %	0 %	0 %	225618964
42	NC_012225	CATT	2	8	16409	16416	25 %	50 %	0 %	25 %	225618966
43	NC_012225	ATAC	2	8	17043	17050	50 %	25 %	0 %	25 %	225618967
44	NC_012225	TAAT	2	8	17086	17093	50 %	50 %	0 %	0 %	225618967
45	NC_012225	AAAG	2	8	17428	17435	75 %	0 %	25 %	0 %	225618967
46	NC_012225	AATG	2	8	17467	17474	50 %	25 %	25 %	0 %	225618967
47	NC_012225	ATTT	2	8	18105	18112	25 %	75 %	0 %	0 %	225618968
48	NC_012225	ATTT	2	8	18142	18149	25 %	75 %	0 %	0 %	225618968
49	NC_012225	TTTA	2	8	18429	18436	25 %	75 %	0 %	0 %	225618968
50	NC_012225	ATCA	2	8	18803	18810	50 %	25 %	0 %	25 %	225618968
51	NC_012225	ATTT	2	8	19062	19069	25 %	75 %	0 %	0 %	225618969
52	NC_012225	TGAT	2	8	19265	19272	25 %	50 %	25 %	0 %	225618969
53	NC_012225	TTCC	2	8	19640	19647	0 %	50 %	0 %	50 %	225618970
54	NC_012225	CTAT	2	8	20083	20090	25 %	50 %	0 %	25 %	225618971
55	NC_012225	TAAA	2	8	20148	20155	75 %	25 %	0 %	0 %	225618971
56	NC_012225	AAAT	2	8	21221	21228	75 %	25 %	0 %	0 %	225618972
57	NC_012225	AAAT	2	8	21300	21307	75 %	25 %	0 %	0 %	225618972
58	NC_012225	AAAT	3	12	21372	21383	75 %	25 %	0 %	0 %	225618972
59	NC_012225	GTAA	2	8	22252	22259	50 %	25 %	25 %	0 %	225618974
60	NC_012225	CTGT	2	8	22382	22389	0 %	50 %	25 %	25 %	225618975
61	NC_012225	TATG	2	8	22468	22475	25 %	50 %	25 %	0 %	225618975
62	NC_012225	ATAA	2	8	22536	22543	75 %	25 %	0 %	0 %	225618975
63	NC_012225	ATTC	2	8	22597	22604	25 %	50 %	0 %	25 %	225618975
64	NC_012225	TCTA	2	8	22738	22745	25 %	50 %	0 %	25 %	225618975
65	NC_012225	TTTA	2	8	22975	22982	25 %	75 %	0 %	0 %	225618975
66	NC_012225	AATT	2	8	23365	23372	50 %	50 %	0 %	0 %	225618976
67	NC_012225	TTAA	2	8	24266	24273	50 %	50 %	0 %	0 %	225618977
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69	NC_012225	ACTT	2	8	25969	25976	25 %	50 %	0 %	25 %	225618979
70	NC_012225	AATA	2	8	26143	26150	75 %	25 %	0 %	0 %	225618979
71	NC_012225	AGTT	2	8	26200	26207	25 %	50 %	25 %	0 %	225618979
72	NC_012225	AATT	2	8	26488	26495	50 %	50 %	0 %	0 %	225618980
73	NC_012225	ATTT	2	8	26679	26686	25 %	75 %	0 %	0 %	225618980
74	NC_012225	ATTT	2	8	26978	26985	25 %	75 %	0 %	0 %	225618981
75	NC_012225	ATAG	2	8	27085	27092	50 %	25 %	25 %	0 %	225618981
76	NC_012225	ATTT	2	8	27818	27825	25 %	75 %	0 %	0 %	225618981
77	NC_012225	CTTT	2	8	29065	29072	0 %	75 %	0 %	25 %	225618982
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80	NC_012225	AAGT	2	8	29539	29546	50 %	25 %	25 %	0 %	225618982
81	NC_012225	ATTT	2	8	29602	29609	25 %	75 %	0 %	0 %	225618982
82	NC_012225	TAAA	2	8	30099	30106	75 %	25 %	0 %	0 %	225618983
83	NC_012225	AAAT	2	8	30463	30470	75 %	25 %	0 %	0 %	225618983
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86	NC_012225	ATTA	2	8	32570	32577	50 %	50 %	0 %	0 %	225618985
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90	NC_012225	TCCT	2	8	34657	34664	0 %	50 %	0 %	50 %	225618987
91	NC_012225	TATT	2	8	35137	35144	25 %	75 %	0 %	0 %	225618988
92	NC_012225	ATTT	2	8	35476	35483	25 %	75 %	0 %	0 %	225618988
93	NC_012225	AAAG	2	8	36145	36152	75 %	0 %	25 %	0 %	225618989
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95	NC_012225	ATTC	3	12	37071	37082	25 %	50 %	0 %	25 %	225618990
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98	NC_012225	TTCA	2	8	37771	37778	25 %	50 %	0 %	25 %	225618990
99	NC_012225	TAAA	2	8	38478	38485	75 %	25 %	0 %	0 %	225618991
100	NC_012225	TCTT	2	8	38730	38737	0 %	75 %	0 %	25 %	225618992
101	NC_012225	AATA	2	8	38907	38914	75 %	25 %	0 %	0 %	225618992
102	NC_012225	ATGT	2	8	38918	38925	25 %	50 %	25 %	0 %	225618992
103	NC_012225	CACT	2	8	39188	39195	25 %	25 %	0 %	50 %	225618992
104	NC_012225	GCAT	2	8	39310	39317	25 %	25 %	25 %	25 %	225618992
105	NC_012225	GGTT	2	8	39478	39485	0 %	50 %	50 %	0 %	225618993
106	NC_012225	TTTA	2	8	39662	39669	25 %	75 %	0 %	0 %	225618993
107	NC_012225	AGAT	2	8	39884	39891	50 %	25 %	25 %	0 %	225618993
108	NC_012225	TAAT	2	8	39963	39970	50 %	50 %	0 %	0 %	225618993
109	NC_012225	CTGT	2	8	40779	40786	0 %	50 %	25 %	25 %	225618994
110	NC_012225	TGTT	2	8	40827	40834	0 %	75 %	25 %	0 %	225618994
111	NC_012225	GCTT	2	8	41233	41240	0 %	50 %	25 %	25 %	225618995
112	NC_012225	GTAA	2	8	41514	41521	50 %	25 %	25 %	0 %	225618995
113	NC_012225	AAGT	2	8	41596	41603	50 %	25 %	25 %	0 %	225618995
114	NC_012225	TCTT	2	8	43462	43469	0 %	75 %	0 %	25 %	225618996
115	NC_012225	CTTT	2	8	43470	43477	0 %	75 %	0 %	25 %	225618996
116	NC_012225	GATA	2	8	43547	43554	50 %	25 %	25 %	0 %	225618996
117	NC_012225	TATG	2	8	43893	43900	25 %	50 %	25 %	0 %	225618997
118	NC_012225	TAGA	2	8	44559	44566	50 %	25 %	25 %	0 %	225618997
119	NC_012225	AATG	2	8	45106	45113	50 %	25 %	25 %	0 %	225618997
120	NC_012225	GATA	2	8	45130	45137	50 %	25 %	25 %	0 %	225618997
121	NC_012225	ATTA	2	8	46310	46317	50 %	50 %	0 %	0 %	225618998
122	NC_012225	ATAG	2	8	47192	47199	50 %	25 %	25 %	0 %	225618999
123	NC_012225	TTTA	2	8	47407	47414	25 %	75 %	0 %	0 %	225618999
124	NC_012225	CTTT	2	8	48077	48084	0 %	75 %	0 %	25 %	225619000
125	NC_012225	TTTC	2	8	48570	48577	0 %	75 %	0 %	25 %	225619000
126	NC_012225	TTTA	2	8	48583	48590	25 %	75 %	0 %	0 %	225619000
127	NC_012225	TAAA	2	8	48597	48604	75 %	25 %	0 %	0 %	225619000
128	NC_012225	AAAT	2	8	49276	49283	75 %	25 %	0 %	0 %	225619000
129	NC_012225	CATA	2	8	49287	49294	50 %	25 %	0 %	25 %	225619000
130	NC_012225	GACT	2	8	49460	49467	25 %	25 %	25 %	25 %	225619000
131	NC_012225	TATT	2	8	49646	49653	25 %	75 %	0 %	0 %	225619000
132	NC_012225	TCTT	2	8	49723	49730	0 %	75 %	0 %	25 %	225619000
133	NC_012225	AAGC	2	8	49773	49780	50 %	0 %	25 %	25 %	225619000
134	NC_012225	TTTC	2	8	49916	49923	0 %	75 %	0 %	25 %	225619000
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136	NC_012225	TTAT	2	8	50765	50772	25 %	75 %	0 %	0 %	225619001
137	NC_012225	TATT	2	8	50927	50934	25 %	75 %	0 %	0 %	225619001
138	NC_012225	ACTA	2	8	50960	50967	50 %	25 %	0 %	25 %	225619001
139	NC_012225	AATG	2	8	51383	51390	50 %	25 %	25 %	0 %	225619001
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