MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Brachyspira hyodysenteriae WA1 chromosome

Total Repeats: 11732

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012225	AT	3	6	1463	1468	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012225	AT	3	6	1527	1532	50 %	50 %	0 %	0 %	225618953
3	NC_012225	TA	3	6	1661	1666	50 %	50 %	0 %	0 %	225618953
4	NC_012225	TA	3	6	1730	1735	50 %	50 %	0 %	0 %	225618953
5	NC_012225	TA	3	6	1783	1788	50 %	50 %	0 %	0 %	225618953
6	NC_012225	AG	3	6	1828	1833	50 %	0 %	50 %	0 %	225618953
7	NC_012225	AT	3	6	1978	1983	50 %	50 %	0 %	0 %	225618953
8	NC_012225	AT	3	6	2050	2055	50 %	50 %	0 %	0 %	225618953
9	NC_012225	AT	3	6	2602	2607	50 %	50 %	0 %	0 %	225618954
10	NC_012225	AT	3	6	2631	2636	50 %	50 %	0 %	0 %	225618954
11	NC_012225	AT	3	6	2893	2898	50 %	50 %	0 %	0 %	225618954
12	NC_012225	TA	3	6	3709	3714	50 %	50 %	0 %	0 %	225618955
13	NC_012225	TA	3	6	3767	3772	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012225	AT	3	6	3806	3811	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012225	TA	3	6	4109	4114	50 %	50 %	0 %	0 %	225618956
16	NC_012225	TA	3	6	4357	4362	50 %	50 %	0 %	0 %	225618956
17	NC_012225	TA	4	8	4903	4910	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012225	TA	3	6	4912	4917	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012225	TA	3	6	4986	4991	50 %	50 %	0 %	0 %	225618958
20	NC_012225	TA	3	6	5117	5122	50 %	50 %	0 %	0 %	225618958
21	NC_012225	TA	3	6	5594	5599	50 %	50 %	0 %	0 %	225618958
22	NC_012225	AG	3	6	5778	5783	50 %	0 %	50 %	0 %	225618958
23	NC_012225	TA	3	6	5787	5792	50 %	50 %	0 %	0 %	225618958
24	NC_012225	TA	4	8	5908	5915	50 %	50 %	0 %	0 %	225618958
25	NC_012225	AT	3	6	6065	6070	50 %	50 %	0 %	0 %	225618958
26	NC_012225	AT	3	6	6106	6111	50 %	50 %	0 %	0 %	225618958
27	NC_012225	TA	3	6	6746	6751	50 %	50 %	0 %	0 %	225618959
28	NC_012225	TA	3	6	6788	6793	50 %	50 %	0 %	0 %	225618959
29	NC_012225	AT	3	6	6854	6859	50 %	50 %	0 %	0 %	225618959
30	NC_012225	AT	3	6	7269	7274	50 %	50 %	0 %	0 %	225618959
31	NC_012225	AT	3	6	7371	7376	50 %	50 %	0 %	0 %	225618959
32	NC_012225	TA	3	6	7706	7711	50 %	50 %	0 %	0 %	225618960
33	NC_012225	TA	3	6	7720	7725	50 %	50 %	0 %	0 %	225618960
34	NC_012225	TA	3	6	7949	7954	50 %	50 %	0 %	0 %	225618960
35	NC_012225	TA	3	6	7961	7966	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012225	AT	3	6	7987	7992	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012225	AT	4	8	8054	8061	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012225	AG	3	6	8231	8236	50 %	0 %	50 %	0 %	225618961
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40	NC_012225	TA	3	6	9536	9541	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012225	AT	3	6	9630	9635	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012225	AT	3	6	9830	9835	50 %	50 %	0 %	0 %	225618962
43	NC_012225	TA	3	6	9847	9852	50 %	50 %	0 %	0 %	225618962
44	NC_012225	TA	3	6	9885	9890	50 %	50 %	0 %	0 %	225618962
45	NC_012225	AT	3	6	10420	10425	50 %	50 %	0 %	0 %	225618962
46	NC_012225	TA	3	6	10492	10497	50 %	50 %	0 %	0 %	225618962
47	NC_012225	GA	3	6	10504	10509	50 %	0 %	50 %	0 %	225618962
48	NC_012225	AT	3	6	10652	10657	50 %	50 %	0 %	0 %	225618962
49	NC_012225	AT	4	8	10954	10961	50 %	50 %	0 %	0 %	225618962
50	NC_012225	AT	3	6	11059	11064	50 %	50 %	0 %	0 %	225618962
51	NC_012225	TA	5	10	11113	11122	50 %	50 %	0 %	0 %	225618962
52	NC_012225	TA	4	8	11296	11303	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012225	AT	3	6	11465	11470	50 %	50 %	0 %	0 %	225618963
54	NC_012225	TA	3	6	11956	11961	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012225	CT	4	8	12175	12182	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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57	NC_012225	AT	3	6	13580	13585	50 %	50 %	0 %	0 %	225618964
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61	NC_012225	CT	3	6	13998	14003	0 %	50 %	0 %	50 %	225618964
62	NC_012225	AT	3	6	14073	14078	50 %	50 %	0 %	0 %	225618964
63	NC_012225	AT	3	6	14136	14141	50 %	50 %	0 %	0 %	225618964
64	NC_012225	TA	3	6	14232	14237	50 %	50 %	0 %	0 %	225618964
65	NC_012225	TA	3	6	14410	14415	50 %	50 %	0 %	0 %	225618964
66	NC_012225	TC	3	6	15039	15044	0 %	50 %	0 %	50 %	225618964
67	NC_012225	AT	3	6	15113	15118	50 %	50 %	0 %	0 %	225618964
68	NC_012225	TA	3	6	15247	15252	50 %	50 %	0 %	0 %	225618964
69	NC_012225	AT	3	6	15371	15376	50 %	50 %	0 %	0 %	225618964
70	NC_012225	TA	3	6	15435	15440	50 %	50 %	0 %	0 %	225618964
71	NC_012225	TA	3	6	15538	15543	50 %	50 %	0 %	0 %	225618964
72	NC_012225	TA	4	8	15843	15850	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012225	AT	3	6	15869	15874	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012225	TA	3	6	16215	16220	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012225	TA	3	6	16339	16344	50 %	50 %	0 %	0 %	225618966
76	NC_012225	AT	3	6	16526	16531	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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84	NC_012225	AT	3	6	20693	20698	50 %	50 %	0 %	0 %	225618971
85	NC_012225	AT	3	6	20723	20728	50 %	50 %	0 %	0 %	225618971
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90	NC_012225	AT	4	8	22750	22757	50 %	50 %	0 %	0 %	225618975
91	NC_012225	TA	3	6	22883	22888	50 %	50 %	0 %	0 %	225618975
92	NC_012225	AT	3	6	23194	23199	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_012225	TA	4	8	23202	23209	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012225	AT	3	6	23248	23253	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_012225	AT	3	6	23396	23401	50 %	50 %	0 %	0 %	225618976
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103	NC_012225	AT	3	6	26739	26744	50 %	50 %	0 %	0 %	225618980
104	NC_012225	GA	3	6	26938	26943	50 %	0 %	50 %	0 %	225618980
105	NC_012225	AT	3	6	27018	27023	50 %	50 %	0 %	0 %	225618981
106	NC_012225	TA	3	6	27037	27042	50 %	50 %	0 %	0 %	225618981
107	NC_012225	TA	4	8	27127	27134	50 %	50 %	0 %	0 %	225618981
108	NC_012225	TA	3	6	27241	27246	50 %	50 %	0 %	0 %	225618981
109	NC_012225	CT	3	6	27388	27393	0 %	50 %	0 %	50 %	225618981
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111	NC_012225	AT	3	6	28398	28403	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012225	TA	4	8	28440	28447	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_012225	TA	3	6	28894	28899	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012225	TA	4	8	29407	29414	50 %	50 %	0 %	0 %	225618982
115	NC_012225	TA	3	6	29929	29934	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_012225	AT	3	6	30130	30135	50 %	50 %	0 %	0 %	225618983
117	NC_012225	TA	4	8	30661	30668	50 %	50 %	0 %	0 %	225618983
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119	NC_012225	TA	3	6	31116	31121	50 %	50 %	0 %	0 %	225618983
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123	NC_012225	AT	3	6	32908	32913	50 %	50 %	0 %	0 %	225618985
124	NC_012225	TA	3	6	32945	32950	50 %	50 %	0 %	0 %	225618985
125	NC_012225	TA	4	8	33028	33035	50 %	50 %	0 %	0 %	225618985
126	NC_012225	AT	3	6	33061	33066	50 %	50 %	0 %	0 %	225618985
127	NC_012225	AT	3	6	33442	33447	50 %	50 %	0 %	0 %	225618986
128	NC_012225	TA	3	6	33485	33490	50 %	50 %	0 %	0 %	225618986
129	NC_012225	GA	3	6	33518	33523	50 %	0 %	50 %	0 %	225618986
130	NC_012225	AT	3	6	33759	33764	50 %	50 %	0 %	0 %	225618986
131	NC_012225	AT	5	10	33901	33910	50 %	50 %	0 %	0 %	225618986
132	NC_012225	AG	3	6	33975	33980	50 %	0 %	50 %	0 %	225618986
133	NC_012225	AT	3	6	34165	34170	50 %	50 %	0 %	0 %	225618986
134	NC_012225	AT	3	6	34339	34344	50 %	50 %	0 %	0 %	225618986
135	NC_012225	AT	3	6	34831	34836	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_012225	AT	3	6	34893	34898	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_012225	AT	4	8	34909	34916	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_012225	AT	3	6	35706	35711	50 %	50 %	0 %	0 %	225618988
139	NC_012225	AT	4	8	35725	35732	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_012225	AT	3	6	35750	35755	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_012225	TA	3	6	35813	35818	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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145	NC_012225	TA	3	6	36434	36439	50 %	50 %	0 %	0 %	225618989
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