MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Erwinia pyrifoliae Ep1/96 chromosome

Total Repeats: 132

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012214	TCCCGG	2	12	39485	39496	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
2	NC_012214	AGAAAA	2	12	48263	48274	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012214	GATTTT	2	12	83515	83526	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012214	TTACCT	2	12	212514	212525	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_012214	ATCAGA	2	12	214263	214274	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_012214	TTTACG	2	12	361442	361453	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_012214	ATTTAT	2	12	372065	372076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012214	TGGCGC	2	12	415085	415096	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_012214	ATGCCA	2	12	549850	549861	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_012214	GAAAAG	2	12	569795	569806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012214	TAAAAT	2	12	577908	577919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012214	GGATTC	2	12	611549	611560	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_012214	AGGGAA	2	12	650470	650481	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012214	ATTAAC	2	12	695852	695863	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_012214	CTTTTA	2	12	727211	727222	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_012214	ACCATT	2	12	753936	753947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_012214	CGATAA	2	12	754211	754222	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_012214	TTCCCG	2	12	763971	763982	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
19	NC_012214	TACAAT	2	12	794919	794930	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_012214	ATGACA	2	12	805656	805667	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_012214	TATGAT	2	12	851652	851663	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012214	CCGCAC	2	12	851944	851955	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_012214	GCAGGG	2	12	949654	949665	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_012214	GACTTT	2	12	956863	956874	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_012214	GCTAAC	2	12	961815	961826	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_012214	TAAATT	2	12	962847	962858	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012214	CTTTAC	2	12	1105929	1105940	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_012214	AAATTA	2	12	1123363	1123374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012214	TGAAAA	2	12	1169862	1169873	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012214	GTTTCA	2	12	1170852	1170863	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_012214	GCTGCG	2	12	1239675	1239686	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_012214	CACTCA	2	12	1370979	1370990	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_012214	TTTTCT	2	12	1422534	1422545	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_012214	GGGGCA	2	12	1422593	1422604	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_012214	CTCATG	2	12	1447904	1447915	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_012214	GCTATC	2	12	1515544	1515555	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_012214	CGCGCC	2	12	1537180	1537191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_012214	TGGATA	2	12	1554382	1554393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012214	GCTGGA	2	12	1633448	1633459	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_012214	ATTTTA	2	12	1666390	1666401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012214	TTAAAA	2	12	1667496	1667507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012214	CAGAAA	2	12	1668980	1668991	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_012214	TTAATT	2	12	1705213	1705224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012214	TAACCC	2	12	1710672	1710683	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_012214	GATAAT	2	12	1720576	1720587	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012214	CCTTTT	2	12	1726268	1726279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_012214	GCGATG	2	12	1744131	1744142	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_012214	TGATTA	2	12	1783140	1783151	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012214	GACGTT	2	12	1821171	1821182	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_012214	GAAAAA	2	12	1836332	1836343	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012214	TTTTAC	2	12	1838496	1838507	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_012214	CATAAC	2	12	1850773	1850784	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_012214	AAGGTA	2	12	1867238	1867249	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012214	AAGGTA	2	12	1867408	1867419	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012214	AATATA	2	12	1879144	1879155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012214	CAATTT	2	12	1903803	1903814	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_012214	AGGTAA	2	12	1907468	1907479	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012214	ATTAAA	2	12	1920172	1920183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012214	CTGCGA	2	12	1920719	1920730	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_012214	AGTAAA	2	12	1953702	1953713	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012214	AAATAA	2	12	1953778	1953789	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012214	TTAGCA	2	12	1958276	1958287	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_012214	GCTAAT	2	12	1982555	1982566	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_012214	ACTGCT	2	12	2004798	2004809	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_012214	AGGGAG	4	24	2037215	2037238	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012214	AATTAA	2	12	2053185	2053196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012214	CTTCGC	2	12	2071456	2071467	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
68	NC_012214	GCCAAA	2	12	2139618	2139629	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_012214	CCGCAC	2	12	2167509	2167520	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_012214	GCATCG	2	12	2223815	2223826	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_012214	TTTACG	2	12	2224490	2224501	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_012214	GATTCA	2	12	2234299	2234310	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_012214	TTTCAA	2	12	2258129	2258140	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_012214	ATCATT	2	12	2306091	2306102	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_012214	CGTTAA	2	12	2343192	2343203	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_012214	AATACA	2	12	2346890	2346901	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_012214	AAAAAT	2	12	2421233	2421244	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012214	GCTGGA	2	12	2446165	2446176	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_012214	CAATAC	3	18	2530316	2530333	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_012214	GCTTTC	2	12	2557454	2557465	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_012214	CAGCGC	2	12	2566978	2566989	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
82	NC_012214	GATAAG	2	12	2597538	2597549	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012214	CAGAAA	2	12	2628057	2628068	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_012214	AGGACA	2	12	2629361	2629372	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_012214	CTATGT	2	12	2669806	2669817	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_012214	TCTCGC	2	12	2696461	2696472	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
87	NC_012214	TCTCGC	2	12	2696599	2696610	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
88	NC_012214	TCTCGC	2	12	2697203	2697214	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
89	NC_012214	TGATAA	2	12	2703326	2703337	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_012214	TCATGA	2	12	2713534	2713545	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_012214	TGAATG	2	12	2772081	2772092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012214	TAACAA	2	12	2777724	2777735	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_012214	TATCGG	2	12	2798241	2798252	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_012214	ATAATG	2	12	2809445	2809456	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_012214	AAAAGC	2	12	2894758	2894769	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_012214	TGGGCG	2	12	2964730	2964741	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_012214	GCGGCT	2	12	2966007	2966018	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_012214	TTGCCT	2	12	3022095	3022106	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_012214	GATATG	2	12	3043177	3043188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_012214	TGCCAC	2	12	3050825	3050836	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
101	NC_012214	ACTTAA	2	12	3071713	3071724	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_012214	ACGCGG	2	12	3142241	3142252	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_012214	GTTTAA	2	12	3166659	3166670	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_012214	CGGAAG	2	12	3210143	3210154	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_012214	TTCCCG	2	12	3250156	3250167	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
106	NC_012214	AGACGG	2	12	3254383	3254394	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_012214	AGAATT	2	12	3269813	3269824	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_012214	TTCAGC	2	12	3308707	3308718	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_012214	TATTGA	2	12	3321230	3321241	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_012214	GAATAT	2	12	3350306	3350317	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_012214	ATAAAT	2	12	3359085	3359096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012214	CTCATC	2	12	3376109	3376120	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_012214	ATTTTT	2	12	3376478	3376489	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012214	ATACAT	2	12	3416498	3416509	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_012214	ACCCTA	2	12	3470305	3470316	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_012214	ACCCTA	2	12	3478068	3478079	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_012214	CCATCA	2	12	3506298	3506309	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_012214	CTGCCG	2	12	3538216	3538227	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
119	NC_012214	CGGCAT	2	12	3544047	3544058	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_012214	CTGGCG	2	12	3556787	3556798	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_012214	AAAAAT	2	12	3571399	3571410	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012214	GAAGCC	2	12	3579069	3579080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_012214	TAAATC	2	12	3690983	3690994	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_012214	AACCGG	2	12	3816769	3816780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_012214	GCTATC	2	12	3823243	3823254	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_012214	TTATCA	2	12	3853468	3853479	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_012214	AAAAAT	2	12	3859059	3859070	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_012214	AATGAG	3	18	3875562	3875579	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_012214	TGCCCC	2	12	3905042	3905053	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_012214	AGTCGA	2	12	3938917	3938928	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_012214	TAAGAA	2	12	3955474	3955485	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_012214	ACTTAT	2	12	3990034	3990045	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.