MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Erwinia pyrifoliae Ep1/96 chromosome

Total Repeats: 2233

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012214	TAATG	2	10	424	433	40 %	40 %	20 %	0 %	259906683
2	NC_012214	GGCAA	2	10	3850	3859	40 %	0 %	40 %	20 %	259906686
3	NC_012214	GTGAT	2	10	3974	3983	20 %	40 %	40 %	0 %	259906686
4	NC_012214	TGCGC	2	10	5003	5012	0 %	20 %	40 %	40 %	259906687
5	NC_012214	GCCGG	2	10	6022	6031	0 %	0 %	60 %	40 %	259906687
6	NC_012214	TGCCG	2	10	9900	9909	0 %	20 %	40 %	40 %	259906689
7	NC_012214	GCCTT	2	10	10357	10366	0 %	40 %	20 %	40 %	259906689
8	NC_012214	GGAAG	2	10	12465	12474	40 %	0 %	60 %	0 %	259906689
9	NC_012214	TTTAA	2	10	13744	13753	40 %	60 %	0 %	0 %	259906689
10	NC_012214	CAGGA	2	10	13977	13986	40 %	0 %	40 %	20 %	259906689
11	NC_012214	TCCAG	2	10	17507	17516	20 %	20 %	20 %	40 %	259906690
12	NC_012214	GAAGA	2	10	24934	24943	60 %	0 %	40 %	0 %	259906694
13	NC_012214	GCGCT	2	10	25874	25883	0 %	20 %	40 %	40 %	259906696
14	NC_012214	TTCCG	2	10	30257	30266	0 %	40 %	20 %	40 %	259906699
15	NC_012214	CGTGG	2	10	30545	30554	0 %	20 %	60 %	20 %	259906700
16	NC_012214	CCGAT	2	10	31236	31245	20 %	20 %	20 %	40 %	259906700
17	NC_012214	GGAAC	2	10	31860	31869	40 %	0 %	40 %	20 %	259906701
18	NC_012214	CCCAA	2	10	32090	32099	40 %	0 %	0 %	60 %	259906701
19	NC_012214	GAACA	2	10	40490	40499	60 %	0 %	20 %	20 %	259906703
20	NC_012214	ATCGT	2	10	43733	43742	20 %	40 %	20 %	20 %	259906706
21	NC_012214	GGTGA	2	10	45519	45528	20 %	20 %	60 %	0 %	259906707
22	NC_012214	GCTGC	2	10	47016	47025	0 %	20 %	40 %	40 %	259906709
23	NC_012214	GTAAT	2	10	50004	50013	40 %	40 %	20 %	0 %	259906711
24	NC_012214	CATCG	2	10	51212	51221	20 %	20 %	20 %	40 %	259906712
25	NC_012214	TTTGG	2	10	57901	57910	0 %	60 %	40 %	0 %	259906718
26	NC_012214	ACCTG	2	10	58755	58764	20 %	20 %	20 %	40 %	259906719
27	NC_012214	ACGCC	2	10	61686	61695	20 %	0 %	20 %	60 %	259906720
28	NC_012214	GTGCG	2	10	61894	61903	0 %	20 %	60 %	20 %	259906720
29	NC_012214	ACGTG	2	10	67889	67898	20 %	20 %	40 %	20 %	259906725
30	NC_012214	GAAAT	2	10	68403	68412	60 %	20 %	20 %	0 %	259906726
31	NC_012214	CAAGG	2	10	69256	69265	40 %	0 %	40 %	20 %	259906726
32	NC_012214	ACAGA	2	10	71703	71712	60 %	0 %	20 %	20 %	259906728
33	NC_012214	GACAC	2	10	74712	74721	40 %	0 %	20 %	40 %	259906731
34	NC_012214	CTGCC	2	10	78799	78808	0 %	20 %	20 %	60 %	259906736
35	NC_012214	TCATT	2	10	79314	79323	20 %	60 %	0 %	20 %	259906737
36	NC_012214	GCTGT	2	10	80151	80160	0 %	40 %	40 %	20 %	259906739
37	NC_012214	CATCC	2	10	80183	80192	20 %	20 %	0 %	60 %	259906739
38	NC_012214	GCCGT	2	10	80740	80749	0 %	20 %	40 %	40 %	259906739
39	NC_012214	GCGCC	2	10	80891	80900	0 %	0 %	40 %	60 %	259906739
40	NC_012214	CGCTG	2	10	81119	81128	0 %	20 %	40 %	40 %	259906739
41	NC_012214	CCGTG	2	10	81504	81513	0 %	20 %	40 %	40 %	259906739
42	NC_012214	GCCGC	2	10	82322	82331	0 %	0 %	40 %	60 %	259906739
43	NC_012214	CCCGC	2	10	82381	82390	0 %	0 %	20 %	80 %	259906739
44	NC_012214	GCGCC	2	10	82985	82994	0 %	0 %	40 %	60 %	259906740
45	NC_012214	CGTAC	2	10	85224	85233	20 %	20 %	20 %	40 %	259906745
46	NC_012214	CAGCG	2	10	85328	85337	20 %	0 %	40 %	40 %	259906745
47	NC_012214	GGGTA	2	10	87562	87571	20 %	20 %	60 %	0 %	259906749
48	NC_012214	GCCAG	2	10	90410	90419	20 %	0 %	40 %	40 %	259906751
49	NC_012214	GCTGC	2	10	90690	90699	0 %	20 %	40 %	40 %	259906751
50	NC_012214	GCAGC	2	10	95780	95789	20 %	0 %	40 %	40 %	259906758
51	NC_012214	TAAGG	2	10	98004	98013	40 %	20 %	40 %	0 %	259906760
52	NC_012214	GCGAC	2	10	103902	103911	20 %	0 %	40 %	40 %	259906767
53	NC_012214	AGGGA	2	10	104385	104394	40 %	0 %	60 %	0 %	259906768
54	NC_012214	TTCAG	2	10	104806	104815	20 %	40 %	20 %	20 %	259906768
55	NC_012214	CAGGC	2	10	106192	106201	20 %	0 %	40 %	40 %	259906769
56	NC_012214	TAAAA	2	10	107721	107730	80 %	20 %	0 %	0 %	259906771
57	NC_012214	ACAAG	2	10	111155	111164	60 %	0 %	20 %	20 %	259906774
58	NC_012214	GGCCG	2	10	113386	113395	0 %	0 %	60 %	40 %	259906776
59	NC_012214	GGAAC	2	10	114581	114590	40 %	0 %	40 %	20 %	259906777
60	NC_012214	CGCTG	2	10	117101	117110	0 %	20 %	40 %	40 %	259906779
61	NC_012214	GCACA	2	10	118334	118343	40 %	0 %	20 %	40 %	259906781
62	NC_012214	AACAA	2	10	118498	118507	80 %	0 %	0 %	20 %	259906782
63	NC_012214	GTTTG	2	10	119262	119271	0 %	60 %	40 %	0 %	259906783
64	NC_012214	GCCCG	2	10	121282	121291	0 %	0 %	40 %	60 %	259906785
65	NC_012214	CGGTA	2	10	121623	121632	20 %	20 %	40 %	20 %	259906786
66	NC_012214	TCTGC	2	10	121860	121869	0 %	40 %	20 %	40 %	259906786
67	NC_012214	TCGCT	2	10	121920	121929	0 %	40 %	20 %	40 %	259906786
68	NC_012214	GCCTG	2	10	125006	125015	0 %	20 %	40 %	40 %	259906789
69	NC_012214	AAAAC	2	10	128477	128486	80 %	0 %	0 %	20 %	259906792
70	NC_012214	TTCAT	2	10	132754	132763	20 %	60 %	0 %	20 %	259906796
71	NC_012214	TGCAG	2	10	133651	133660	20 %	20 %	40 %	20 %	259906797
72	NC_012214	GCAGA	2	10	133870	133879	40 %	0 %	40 %	20 %	259906797
73	NC_012214	GAAAA	2	10	135690	135699	80 %	0 %	20 %	0 %	259906799
74	NC_012214	CGTAT	2	10	139989	139998	20 %	40 %	20 %	20 %	259906803
75	NC_012214	CCGGG	2	10	145308	145317	0 %	0 %	60 %	40 %	259906808
76	NC_012214	TTGCT	2	10	147283	147292	0 %	60 %	20 %	20 %	259906812
77	NC_012214	TCAGT	2	10	148325	148334	20 %	40 %	20 %	20 %	259906812
78	NC_012214	TGGCC	2	10	149184	149193	0 %	20 %	40 %	40 %	259906813
79	NC_012214	CGCAT	2	10	149357	149366	20 %	20 %	20 %	40 %	259906813
80	NC_012214	TTTAT	2	10	149759	149768	20 %	80 %	0 %	0 %	259906814
81	NC_012214	GGGCA	2	10	150495	150504	20 %	0 %	60 %	20 %	259906814
82	NC_012214	CGTAT	2	10	154377	154386	20 %	40 %	20 %	20 %	259906818
83	NC_012214	GCTCG	2	10	154863	154872	0 %	20 %	40 %	40 %	259906819
84	NC_012214	AAAGT	2	10	157951	157960	60 %	20 %	20 %	0 %	259906822
85	NC_012214	GCTTG	2	10	158998	159007	0 %	40 %	40 %	20 %	259906823
86	NC_012214	AGCGG	2	10	159332	159341	20 %	0 %	60 %	20 %	259906823
87	NC_012214	GGCAT	2	10	160743	160752	20 %	20 %	40 %	20 %	259906823
88	NC_012214	AAAAT	2	10	163295	163304	80 %	20 %	0 %	0 %	259906827
89	NC_012214	AGCAG	2	10	163861	163870	40 %	0 %	40 %	20 %	259906827
90	NC_012214	ATTTC	2	10	163881	163890	20 %	60 %	0 %	20 %	259906827
91	NC_012214	CGAAT	2	10	165367	165376	40 %	20 %	20 %	20 %	259906829
92	NC_012214	TTCTT	2	10	165910	165919	0 %	80 %	0 %	20 %	259906829
93	NC_012214	ATCTC	2	10	166184	166193	20 %	40 %	0 %	40 %	259906829
94	NC_012214	GCGCG	2	10	167535	167544	0 %	0 %	60 %	40 %	259906831
95	NC_012214	CGCTG	2	10	167589	167598	0 %	20 %	40 %	40 %	259906831
96	NC_012214	GCTGC	2	10	169214	169223	0 %	20 %	40 %	40 %	259906832
97	NC_012214	ACGGT	2	10	170287	170296	20 %	20 %	40 %	20 %	259906832
98	NC_012214	AACCG	2	10	170339	170348	40 %	0 %	20 %	40 %	259906832
99	NC_012214	GCTGC	2	10	170646	170655	0 %	20 %	40 %	40 %	259906832
100	NC_012214	GCACC	2	10	171309	171318	20 %	0 %	20 %	60 %	259906833
101	NC_012214	GGCAT	2	10	173638	173647	20 %	20 %	40 %	20 %	259906836
102	NC_012214	CAGGC	2	10	175716	175725	20 %	0 %	40 %	40 %	259906837
103	NC_012214	TGGCC	2	10	177059	177068	0 %	20 %	40 %	40 %	259906838
104	NC_012214	ATCAC	2	10	182461	182470	40 %	20 %	0 %	40 %	259906843
105	NC_012214	GATGG	2	10	183241	183250	20 %	20 %	60 %	0 %	259906843
106	NC_012214	CGATG	2	10	198616	198625	20 %	20 %	40 %	20 %	259906853
107	NC_012214	CTGCC	2	10	198843	198852	0 %	20 %	20 %	60 %	259906853
108	NC_012214	TGCGG	2	10	201405	201414	0 %	20 %	60 %	20 %	259906855
109	NC_012214	GGGCA	2	10	202951	202960	20 %	0 %	60 %	20 %	259906856
110	NC_012214	TGCGC	2	10	203412	203421	0 %	20 %	40 %	40 %	259906856
111	NC_012214	GAAGT	2	10	204279	204288	40 %	20 %	40 %	0 %	259906857
112	NC_012214	CTGAT	2	10	204289	204298	20 %	40 %	20 %	20 %	259906857
113	NC_012214	ATGAA	2	10	204862	204871	60 %	20 %	20 %	0 %	259906857
114	NC_012214	CGGGT	2	10	205621	205630	0 %	20 %	60 %	20 %	259906859
115	NC_012214	AGGCC	2	10	211606	211615	20 %	0 %	40 %	40 %	259906863
116	NC_012214	TTCTG	2	10	211932	211941	0 %	60 %	20 %	20 %	259906863
117	NC_012214	TCACG	2	10	213496	213505	20 %	20 %	20 %	40 %	259906865
118	NC_012214	CCGCG	2	10	219121	219130	0 %	0 %	40 %	60 %	259906870
119	NC_012214	GCTGG	2	10	219868	219877	0 %	20 %	60 %	20 %	259906870
120	NC_012214	CTGCG	2	10	221524	221533	0 %	20 %	40 %	40 %	259906872
121	NC_012214	GGCGC	2	10	223293	223302	0 %	0 %	60 %	40 %	259906874
122	NC_012214	CTGGC	2	10	226014	226023	0 %	20 %	40 %	40 %	259906876
123	NC_012214	AGTTT	2	10	227094	227103	20 %	60 %	20 %	0 %	259906877
124	NC_012214	CGCGG	2	10	228515	228524	0 %	0 %	60 %	40 %	259906878
125	NC_012214	TGCTC	2	10	229707	229716	0 %	40 %	20 %	40 %	259906879
126	NC_012214	TCGGT	2	10	237090	237099	0 %	40 %	40 %	20 %	259906885
127	NC_012214	GCCGG	2	10	238626	238635	0 %	0 %	60 %	40 %	259906887
128	NC_012214	CCGTA	2	10	240051	240060	20 %	20 %	20 %	40 %	259906888
129	NC_012214	AGGCC	2	10	240566	240575	20 %	0 %	40 %	40 %	259906888
130	NC_012214	GGAAG	2	10	241895	241904	40 %	0 %	60 %	0 %	259906889
131	NC_012214	GCTGG	2	10	243760	243769	0 %	20 %	60 %	20 %	259906891
132	NC_012214	GCAGA	2	10	245662	245671	40 %	0 %	40 %	20 %	259906892
133	NC_012214	GGGCG	2	10	247006	247015	0 %	0 %	80 %	20 %	259906894
134	NC_012214	GGCAG	2	10	251056	251065	20 %	0 %	60 %	20 %	259906898
135	NC_012214	TACCG	2	10	253290	253299	20 %	20 %	20 %	40 %	259906899
136	NC_012214	CCGGT	2	10	253579	253588	0 %	20 %	40 %	40 %	259906899
137	NC_012214	GCCTT	2	10	258301	258310	0 %	40 %	20 %	40 %	259906903
138	NC_012214	GGGTT	2	10	260333	260342	0 %	40 %	60 %	0 %	259906905
139	NC_012214	TGAAG	2	10	261271	261280	40 %	20 %	40 %	0 %	259906906
140	NC_012214	TTTCA	2	10	263097	263106	20 %	60 %	0 %	20 %	259906909
141	NC_012214	ACTGC	2	10	263145	263154	20 %	20 %	20 %	40 %	259906909
142	NC_012214	AGTAA	2	10	263977	263986	60 %	20 %	20 %	0 %	259906910
143	NC_012214	CGGTG	2	10	264927	264936	0 %	20 %	60 %	20 %	259906911
144	NC_012214	GGCGC	2	10	267880	267889	0 %	0 %	60 %	40 %	259906914
145	NC_012214	GCATC	2	10	269417	269426	20 %	20 %	20 %	40 %	259906914
146	NC_012214	AAAAG	2	10	272277	272286	80 %	0 %	20 %	0 %	259906917
147	NC_012214	TGCCT	2	10	273262	273271	0 %	40 %	20 %	40 %	259906917
148	NC_012214	ACTTC	2	10	273438	273447	20 %	40 %	0 %	40 %	259906917
149	NC_012214	CGTAC	2	10	281183	281192	20 %	20 %	20 %	40 %	259906919
150	NC_012214	TTCCG	2	10	289862	289871	0 %	40 %	20 %	40 %	259906929
151	NC_012214	TCCGT	2	10	291063	291072	0 %	40 %	20 %	40 %	259906929
152	NC_012214	GCCAA	2	10	291188	291197	40 %	0 %	20 %	40 %	259906929
153	NC_012214	GGTAA	2	10	292358	292367	40 %	20 %	40 %	0 %	259906929
154	NC_012214	TCGCT	2	10	295441	295450	0 %	40 %	20 %	40 %	259906930
155	NC_012214	GACCA	2	10	295683	295692	40 %	0 %	20 %	40 %	259906930
156	NC_012214	GTCTG	2	10	295826	295835	0 %	40 %	40 %	20 %	259906930
157	NC_012214	TGACC	2	10	296972	296981	20 %	20 %	20 %	40 %	259906930
158	NC_012214	GGGAT	2	10	300128	300137	20 %	20 %	60 %	0 %	259906932
159	NC_012214	GTTCG	2	10	300887	300896	0 %	40 %	40 %	20 %	259906933
160	NC_012214	CAGAC	2	10	302879	302888	40 %	0 %	20 %	40 %	259906934
161	NC_012214	AGCAC	2	10	303594	303603	40 %	0 %	20 %	40 %	259906935
162	NC_012214	GCGCT	2	10	309938	309947	0 %	20 %	40 %	40 %	259906941
163	NC_012214	TGCCA	2	10	310645	310654	20 %	20 %	20 %	40 %	259906942
164	NC_012214	GGGAT	2	10	313581	313590	20 %	20 %	60 %	0 %	259906944
165	NC_012214	TACGG	2	10	314100	314109	20 %	20 %	40 %	20 %	259906944
166	NC_012214	TGCCG	2	10	314699	314708	0 %	20 %	40 %	40 %	259906945
167	NC_012214	TGGGG	2	10	315014	315023	0 %	20 %	80 %	0 %	259906945
168	NC_012214	CTGGA	2	10	315191	315200	20 %	20 %	40 %	20 %	259906945
169	NC_012214	TGCCA	2	10	318199	318208	20 %	20 %	20 %	40 %	259906950
170	NC_012214	TGCTG	2	10	318240	318249	0 %	40 %	40 %	20 %	259906950
171	NC_012214	ACGCA	2	10	331133	331142	40 %	0 %	20 %	40 %	259906955
172	NC_012214	GTACG	2	10	334483	334492	20 %	20 %	40 %	20 %	259906958
173	NC_012214	CAGGT	2	10	334780	334789	20 %	20 %	40 %	20 %	259906959
174	NC_012214	CCCAG	2	10	337111	337120	20 %	0 %	20 %	60 %	259906961
175	NC_012214	CACGG	2	10	341066	341075	20 %	0 %	40 %	40 %	259906967
176	NC_012214	AGGGC	2	10	345391	345400	20 %	0 %	60 %	20 %	259906970
177	NC_012214	ATCTC	2	10	347642	347651	20 %	40 %	0 %	40 %	259906972
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179	NC_012214	TCCAG	2	10	354083	354092	20 %	20 %	20 %	40 %	259906976
180	NC_012214	GATCA	2	10	354208	354217	40 %	20 %	20 %	20 %	259906976
181	NC_012214	CATAT	2	10	356429	356438	40 %	40 %	0 %	20 %	259906978
182	NC_012214	CTGAG	2	10	356682	356691	20 %	20 %	40 %	20 %	259906979
183	NC_012214	GTTGG	2	10	359829	359838	0 %	40 %	60 %	0 %	259906983
184	NC_012214	GCTGC	2	10	362371	362380	0 %	20 %	40 %	40 %	259906986
185	NC_012214	GCACC	2	10	362521	362530	20 %	0 %	20 %	60 %	259906986
186	NC_012214	ATCTG	2	10	363727	363736	20 %	40 %	20 %	20 %	259906987
187	NC_012214	CTTTC	2	10	366449	366458	0 %	60 %	0 %	40 %	259906989
188	NC_012214	TACCG	2	10	370005	370014	20 %	20 %	20 %	40 %	259906995
189	NC_012214	ACGGC	2	10	370195	370204	20 %	0 %	40 %	40 %	259906995
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191	NC_012214	CTGGA	2	10	373937	373946	20 %	20 %	40 %	20 %	259906998
192	NC_012214	CGCCA	2	10	374566	374575	20 %	0 %	20 %	60 %	259906998
193	NC_012214	TCTGG	2	10	374843	374852	0 %	40 %	40 %	20 %	259906998
194	NC_012214	TCATA	2	10	376410	376419	40 %	40 %	0 %	20 %	259906999
195	NC_012214	CCGAT	2	10	377069	377078	20 %	20 %	20 %	40 %	259906999
196	NC_012214	TTTGG	2	10	377968	377977	0 %	60 %	40 %	0 %	259906999
197	NC_012214	CCGGA	2	10	379193	379202	20 %	0 %	40 %	40 %	259907000
198	NC_012214	ACCGC	2	10	379826	379835	20 %	0 %	20 %	60 %	259907000
199	NC_012214	GCCTG	2	10	380526	380535	0 %	20 %	40 %	40 %	259907000
200	NC_012214	ACTGC	2	10	380590	380599	20 %	20 %	20 %	40 %	259907000
201	NC_012214	GCAGT	2	10	381912	381921	20 %	20 %	40 %	20 %	259907000
202	NC_012214	ACTAC	2	10	384753	384762	40 %	20 %	0 %	40 %	259907001
203	NC_012214	GAAGC	2	10	385760	385769	40 %	0 %	40 %	20 %	259907001
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209	NC_012214	CGGCG	2	10	396644	396653	0 %	0 %	60 %	40 %	259907005
210	NC_012214	TGTGC	2	10	405284	405293	0 %	40 %	40 %	20 %	259907015
211	NC_012214	TGGCC	2	10	407898	407907	0 %	20 %	40 %	40 %	259907018
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241	NC_012214	AATAA	2	10	473805	473814	80 %	20 %	0 %	0 %	259907077
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244	NC_012214	ACATG	2	10	479535	479544	40 %	20 %	20 %	20 %	259907081
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247	NC_012214	TGAAA	2	10	482758	482767	60 %	20 %	20 %	0 %	259907086
248	NC_012214	TGGGT	2	10	482942	482951	0 %	40 %	60 %	0 %	259907086
249	NC_012214	CGTTG	2	10	484361	484370	0 %	40 %	40 %	20 %	259907087
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251	NC_012214	GATTT	2	10	487978	487987	20 %	60 %	20 %	0 %	259907089
252	NC_012214	TTCTT	2	10	488372	488381	0 %	80 %	0 %	20 %	259907089
253	NC_012214	GAGCA	2	10	490825	490834	40 %	0 %	40 %	20 %	259907091
254	NC_012214	ACCCA	2	10	492860	492869	40 %	0 %	0 %	60 %	259907095
255	NC_012214	AGCGT	2	10	493681	493690	20 %	20 %	40 %	20 %	259907095
256	NC_012214	GCCTG	2	10	493733	493742	0 %	20 %	40 %	40 %	259907095
257	NC_012214	GACCT	2	10	497451	497460	20 %	20 %	20 %	40 %	259907097
258	NC_012214	CAGAC	2	10	499007	499016	40 %	0 %	20 %	40 %	259907099
259	NC_012214	CTTCG	2	10	500645	500654	0 %	40 %	20 %	40 %	259907100
260	NC_012214	AAGGC	2	10	503511	503520	40 %	0 %	40 %	20 %	259907101
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