MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium bovis BCG str. Tokyo 172 chromosome

Total Repeats: 145

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012207	CGTCGG	2	12	66728	66739	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_012207	CAACGG	2	12	76250	76261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_012207	TCACCT	2	12	80470	80481	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_012207	CTCGGT	2	12	149451	149462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_012207	GCCGCG	2	12	181162	181173	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_012207	ACAGCC	2	12	218712	218723	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
7	NC_012207	AGATTC	2	12	328727	328738	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_012207	GGTCGC	2	12	343321	343332	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_012207	TGCCGA	2	12	401959	401970	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_012207	CCGATA	2	12	477627	477638	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_012207	ATAGTC	2	12	544120	544131	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_012207	ACCAGT	2	12	592149	592160	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_012207	CGCCGT	2	12	721172	721183	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
14	NC_012207	CGCGGG	2	12	831645	831656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_012207	CCGGCG	2	12	866658	866669	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_012207	ACCGGG	2	12	873379	873390	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_012207	GCGGCC	2	12	910267	910278	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_012207	ACAGCA	2	12	911640	911651	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_012207	CATCGT	2	12	915460	915471	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_012207	CTGGGT	2	12	926478	926489	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_012207	CAGTCG	2	12	934289	934300	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_012207	TCGGGT	2	12	967747	967758	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_012207	CAACGG	2	12	1031550	1031561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_012207	GATCGA	2	12	1031601	1031612	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_012207	GACTGC	2	12	1036005	1036016	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_012207	CGCCGG	2	12	1054871	1054882	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_012207	GGCGCA	2	12	1096613	1096624	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_012207	TTGGTG	2	12	1153932	1153943	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012207	TTCCGT	2	12	1164625	1164636	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_012207	TAGCCA	2	12	1198886	1198897	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_012207	AGTTAC	2	12	1224698	1224709	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_012207	AGGACG	2	12	1285690	1285701	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_012207	AGGCCA	2	12	1343900	1343911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_012207	TCGACA	2	12	1371351	1371362	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_012207	CCGAGT	2	12	1419331	1419342	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_012207	CACGCG	2	12	1524406	1524417	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
37	NC_012207	ATATTC	2	12	1559436	1559447	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_012207	GCCCCT	2	12	1632561	1632572	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_012207	GCCCCT	2	12	1636160	1636171	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_012207	CGAGTG	2	12	1768256	1768267	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_012207	GGCGCC	2	12	1814481	1814492	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_012207	CCGCGG	2	12	1878223	1878234	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_012207	TAGCGG	2	12	1905272	1905283	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_012207	ACCGCA	2	12	1907208	1907219	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
45	NC_012207	GGTGAT	2	12	2024736	2024747	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012207	TTCGGC	2	12	2038645	2038656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_012207	AGAGGG	2	12	2058779	2058790	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012207	ACCGTG	2	12	2125261	2125272	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_012207	GCTGGG	2	12	2127892	2127903	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_012207	CGCGAG	2	12	2160680	2160691	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_012207	CGGTTG	2	12	2202377	2202388	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_012207	GCCGCA	2	12	2205282	2205293	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
53	NC_012207	CGGCTC	2	12	2234592	2234603	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
54	NC_012207	CCCTGA	2	12	2297803	2297814	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
55	NC_012207	TGCACT	2	12	2312993	2313004	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_012207	ATAGAA	2	12	2339871	2339882	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012207	CTCAAC	2	12	2382363	2382374	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_012207	CCGCTG	2	12	2402843	2402854	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
59	NC_012207	CACCGC	2	12	2411301	2411312	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_012207	GCGTCG	2	12	2463786	2463797	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_012207	CACGAC	2	12	2481957	2481968	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
62	NC_012207	CACGTG	2	12	2673322	2673333	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_012207	GAGGTC	2	12	2676937	2676948	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_012207	CCGGCA	2	12	2690966	2690977	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
65	NC_012207	CGCCAC	2	12	2749151	2749162	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_012207	TCAAAC	2	12	2750904	2750915	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_012207	GCACCC	2	12	2778963	2778974	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_012207	CGACGG	2	12	2827900	2827911	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_012207	GCCCGA	2	12	2834994	2835005	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
70	NC_012207	GTATTG	2	12	2873427	2873438	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012207	CCGTTG	2	12	2883372	2883383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_012207	GGCGCC	2	12	2903052	2903063	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_012207	GTTCGG	2	12	2917270	2917281	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_012207	CATATT	2	12	2961537	2961548	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_012207	CCGGCA	2	12	3025378	3025389	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
76	NC_012207	CGTTGC	2	12	3046391	3046402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_012207	GACATC	2	12	3068427	3068438	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_012207	ACGGCG	2	12	3069978	3069989	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_012207	GTCAAT	2	12	3086555	3086566	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_012207	CATCAC	2	12	3131541	3131552	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_012207	TCGCCG	2	12	3238248	3238259	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
82	NC_012207	TCGCCG	2	12	3238305	3238316	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
83	NC_012207	TCGCCG	2	12	3238362	3238373	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
84	NC_012207	TCGCCG	2	12	3238419	3238430	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
85	NC_012207	TCGCCG	2	12	3238476	3238487	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
86	NC_012207	CGCCAC	2	12	3254498	3254509	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_012207	CGCCGG	2	12	3257872	3257883	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_012207	GGCCGG	2	12	3260198	3260209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_012207	CGTAGG	2	12	3328239	3328250	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_012207	TGTACA	2	12	3377490	3377501	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_012207	ACCAAC	2	12	3382839	3382850	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_012207	CCGTTG	2	12	3404537	3404548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_012207	GCTCCT	2	12	3432139	3432150	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
94	NC_012207	CTGTCA	2	12	3446851	3446862	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_012207	GTCGAC	2	12	3448738	3448749	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_012207	TCCGCT	2	12	3494852	3494863	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
97	NC_012207	GCCTCC	2	12	3585378	3585389	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_012207	TGTCGA	2	12	3645549	3645560	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_012207	ATCCAG	2	12	3650089	3650100	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_012207	TGTCGA	2	12	3666253	3666264	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_012207	ATCCAG	2	12	3670793	3670804	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_012207	TGTCGA	2	12	3686957	3686968	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_012207	CCCGAA	2	12	3730744	3730755	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
104	NC_012207	AGGTTG	2	12	3730874	3730885	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_012207	CGTTGC	2	12	3730905	3730916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_012207	TGCCGG	2	12	3732330	3732341	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_012207	CGCAGC	2	12	3740867	3740878	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
108	NC_012207	TGCCGG	2	12	3742851	3742862	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_012207	GCCCAC	2	12	3742882	3742893	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_012207	TGCCGG	2	12	3744516	3744527	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_012207	CCCGAT	2	12	3744598	3744609	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
112	NC_012207	TGCCGG	2	12	3744612	3744623	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_012207	GCAGCG	2	12	3745295	3745306	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_012207	TCCCGG	2	12	3746267	3746278	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
115	NC_012207	CCCGAT	2	12	3746379	3746390	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
116	NC_012207	TGCCGG	2	12	3746393	3746404	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_012207	GCTGCC	2	12	3746451	3746462	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
118	NC_012207	GGGGAT	2	12	3747603	3747614	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_012207	TGCCGG	2	12	3748064	3748075	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_012207	TGCCGG	2	12	3748094	3748105	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_012207	CCCGAT	2	12	3748176	3748187	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
122	NC_012207	GCCCAG	2	12	3748377	3748388	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
123	NC_012207	CGGGAT	2	12	3748833	3748844	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_012207	CCCGAT	2	12	3749937	3749948	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
125	NC_012207	GCCCAG	2	12	3750138	3750149	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
126	NC_012207	CAACGG	2	12	3750705	3750716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_012207	GCGCAG	2	12	3763885	3763896	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_012207	TGTACA	2	12	3783233	3783244	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_012207	TCCTCT	2	12	3859486	3859497	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_012207	TCGGAG	2	12	3883053	3883064	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_012207	CCGCTC	2	12	3887082	3887093	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_012207	CGTTGG	2	12	3899722	3899733	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_012207	CGGCCG	2	12	3903862	3903873	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
134	NC_012207	GCCGAC	2	12	3925382	3925393	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
135	NC_012207	CGGCGA	2	12	3984901	3984912	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_012207	CGAACA	2	12	3992685	3992696	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_012207	AGACCG	2	12	4079398	4079409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_012207	GGCGAG	2	12	4081150	4081161	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
139	NC_012207	GCGCCG	2	12	4121442	4121453	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140	NC_012207	CCGACG	2	12	4160225	4160236	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
141	NC_012207	TGGCGG	2	12	4168723	4168734	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
142	NC_012207	CTGCGG	2	12	4191407	4191418	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_012207	AACGCG	2	12	4192117	4192128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_012207	CTCATC	2	12	4236265	4236276	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_012207	GGGTTG	2	12	4293526	4293537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.