MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Mycobacterium bovis BCG str. Tokyo 172 chromosome

Total Repeats: 3460

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012207	TCATC	2	10	902	911	20 %	40 %	0 %	40 %	224988384
2	NC_012207	CGTTT	2	10	2092	2101	0 %	60 %	20 %	20 %	224988385
3	NC_012207	CGGTT	2	10	3241	3250	0 %	40 %	40 %	20 %	224988385
4	NC_012207	GTCGG	2	10	4589	4598	0 %	20 %	60 %	20 %	224988387
5	NC_012207	ACGGT	2	10	5747	5756	20 %	20 %	40 %	20 %	224988388
6	NC_012207	GCAGC	2	10	7373	7382	20 %	0 %	40 %	40 %	224988389
7	NC_012207	CGGTG	2	10	9281	9290	0 %	20 %	60 %	20 %	224988389
8	NC_012207	CAGAC	2	10	9799	9808	40 %	0 %	20 %	40 %	224988389
9	NC_012207	CGCAA	2	10	10323	10332	40 %	0 %	20 %	40 %	224988390
10	NC_012207	CGGCG	2	10	10449	10458	0 %	0 %	60 %	40 %	224988390
11	NC_012207	ACCCG	2	10	11279	11288	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
12	NC_012207	CGACC	2	10	13671	13680	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
13	NC_012207	GGCGT	2	10	14153	14162	0 %	20 %	60 %	20 %	224988395
14	NC_012207	GGGCC	2	10	14436	14445	0 %	0 %	60 %	40 %	224988395
15	NC_012207	GCGTT	2	10	15181	15190	0 %	40 %	40 %	20 %	224988396
16	NC_012207	CCAGC	2	10	15721	15730	20 %	0 %	20 %	60 %	224988397
17	NC_012207	ACCGA	2	10	16484	16493	40 %	0 %	20 %	40 %	224988397
18	NC_012207	ATCGG	2	10	16876	16885	20 %	20 %	40 %	20 %	224988397
19	NC_012207	CGGCC	2	10	17885	17894	0 %	0 %	40 %	60 %	224988398
20	NC_012207	TTAGC	2	10	19036	19045	20 %	40 %	20 %	20 %	224988399
21	NC_012207	GGTCC	2	10	19108	19117	0 %	20 %	40 %	40 %	224988399
22	NC_012207	GTCGT	2	10	21627	21636	0 %	40 %	40 %	20 %	224988400
23	NC_012207	ATCAC	2	10	23900	23909	40 %	20 %	0 %	40 %	224988403
24	NC_012207	GCCGG	2	10	24587	24596	0 %	0 %	60 %	40 %	224988403
25	NC_012207	CGAGC	2	10	26949	26958	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
26	NC_012207	GGCAA	2	10	29281	29290	40 %	0 %	40 %	20 %	224988408
27	NC_012207	CGATC	2	10	30107	30116	20 %	20 %	20 %	40 %	224988409
28	NC_012207	CGACG	2	10	32294	32303	20 %	0 %	40 %	40 %	224988412
29	NC_012207	GCGTC	2	10	32349	32358	0 %	20 %	40 %	40 %	224988412
30	NC_012207	GACAC	2	10	32446	32455	40 %	0 %	20 %	40 %	224988412
31	NC_012207	CCGCC	2	10	33792	33801	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
32	NC_012207	TCCTG	2	10	37451	37460	0 %	40 %	20 %	40 %	224988418
33	NC_012207	CTCGG	2	10	37544	37553	0 %	20 %	40 %	40 %	224988418
34	NC_012207	GGCGC	2	10	38087	38096	0 %	0 %	60 %	40 %	224988418
35	NC_012207	TGGCC	2	10	38235	38244	0 %	20 %	40 %	40 %	224988418
36	NC_012207	CGGCG	2	10	38767	38776	0 %	0 %	60 %	40 %	224988418
37	NC_012207	GTCCA	2	10	39378	39387	20 %	20 %	20 %	40 %	224988419
38	NC_012207	GCCAA	2	10	41512	41521	40 %	0 %	20 %	40 %	224988421
39	NC_012207	GCGTC	2	10	41927	41936	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
40	NC_012207	GCACA	2	10	42311	42320	40 %	0 %	20 %	40 %	224988422
41	NC_012207	GGTAC	2	10	44845	44854	20 %	20 %	40 %	20 %	224988424
42	NC_012207	TCGAA	2	10	45077	45086	40 %	20 %	20 %	20 %	224988424
43	NC_012207	GCACC	2	10	46007	46016	20 %	0 %	20 %	60 %	224988424
44	NC_012207	CGGTG	2	10	47041	47050	0 %	20 %	60 %	20 %	224988425
45	NC_012207	TCATG	2	10	47187	47196	20 %	40 %	20 %	20 %	224988425
46	NC_012207	ATCGG	2	10	47334	47343	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
47	NC_012207	GCAGC	2	10	48581	48590	20 %	0 %	40 %	40 %	224988427
48	NC_012207	CCCGA	2	10	48664	48673	20 %	0 %	20 %	60 %	224988427
49	NC_012207	CAGCG	2	10	49789	49798	20 %	0 %	40 %	40 %	224988428
50	NC_012207	CTCCC	2	10	56232	56241	0 %	20 %	0 %	80 %	224988434
51	NC_012207	CGGCG	2	10	56681	56690	0 %	0 %	60 %	40 %	224988434
52	NC_012207	CGACC	2	10	58213	58222	20 %	0 %	20 %	60 %	224988436
53	NC_012207	CTTCG	2	10	58900	58909	0 %	40 %	20 %	40 %	224988437
54	NC_012207	CGGTG	2	10	59956	59965	0 %	20 %	60 %	20 %	224988440
55	NC_012207	TCAGG	2	10	62442	62451	20 %	20 %	40 %	20 %	224988441
56	NC_012207	TGCCG	2	10	65473	65482	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
57	NC_012207	GGCGA	2	10	66405	66414	20 %	0 %	60 %	20 %	224988445
58	NC_012207	GGTGT	2	10	68981	68990	0 %	40 %	60 %	0 %	224988447
59	NC_012207	ATCGG	2	10	69618	69627	20 %	20 %	40 %	20 %	224988447
60	NC_012207	CCGCG	2	10	70155	70164	0 %	0 %	40 %	60 %	224988447
61	NC_012207	GGCAA	2	10	70506	70515	40 %	0 %	40 %	20 %	224988447
62	NC_012207	CGACC	2	10	70795	70804	20 %	0 %	20 %	60 %	224988447
63	NC_012207	CGGGT	2	10	71249	71258	0 %	20 %	60 %	20 %	224988447
64	NC_012207	GGTCG	2	10	71309	71318	0 %	20 %	60 %	20 %	224988447
65	NC_012207	TGCCT	2	10	72050	72059	0 %	40 %	20 %	40 %	224988449
66	NC_012207	GTCCA	2	10	72921	72930	20 %	20 %	20 %	40 %	224988450
67	NC_012207	TGACC	2	10	75545	75554	20 %	20 %	20 %	40 %	224988452
68	NC_012207	GCCAA	2	10	75859	75868	40 %	0 %	20 %	40 %	224988452
69	NC_012207	GTCGC	2	10	75936	75945	0 %	20 %	40 %	40 %	224988452
70	NC_012207	GCGCG	2	10	77024	77033	0 %	0 %	60 %	40 %	224988453
71	NC_012207	CACGA	2	10	79926	79935	40 %	0 %	20 %	40 %	224988455
72	NC_012207	GCACC	2	10	80366	80375	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
73	NC_012207	CCACC	2	10	80559	80568	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
74	NC_012207	GAGCA	2	10	82464	82473	40 %	0 %	40 %	20 %	224988457
75	NC_012207	GCCGG	2	10	82563	82572	0 %	0 %	60 %	40 %	224988457
76	NC_012207	GCGAC	2	10	82639	82648	20 %	0 %	40 %	40 %	224988457
77	NC_012207	ATCCG	2	10	83409	83418	20 %	20 %	20 %	40 %	224988458
78	NC_012207	CACCG	2	10	84189	84198	20 %	0 %	20 %	60 %	224988459
79	NC_012207	TGGTC	2	10	86324	86333	0 %	40 %	40 %	20 %	224988461
80	NC_012207	GCTGG	2	10	86961	86970	0 %	20 %	60 %	20 %	224988462
81	NC_012207	TGGGT	2	10	89999	90008	0 %	40 %	60 %	0 %	224988468
82	NC_012207	TCGCC	2	10	90206	90215	0 %	20 %	20 %	60 %	224988468
83	NC_012207	GGGCC	2	10	91179	91188	0 %	0 %	60 %	40 %	224988469
84	NC_012207	GGCCG	2	10	92498	92507	0 %	0 %	60 %	40 %	224988470
85	NC_012207	GCGCC	2	10	93150	93159	0 %	0 %	40 %	60 %	224988470
86	NC_012207	GCTTG	2	10	95182	95191	0 %	40 %	40 %	20 %	224988472
87	NC_012207	CGTGT	2	10	95614	95623	0 %	40 %	40 %	20 %	224988473
88	NC_012207	AGATC	2	10	95693	95702	40 %	20 %	20 %	20 %	224988473
89	NC_012207	CGGCG	2	10	99274	99283	0 %	0 %	60 %	40 %	224988476
90	NC_012207	CGGCG	2	10	99401	99410	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
91	NC_012207	GCGGT	2	10	100350	100359	0 %	20 %	60 %	20 %	224988477
92	NC_012207	GGTGA	2	10	100568	100577	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
93	NC_012207	GCGCC	2	10	103182	103191	0 %	0 %	40 %	60 %	224988479
94	NC_012207	GGTGG	2	10	103870	103879	0 %	20 %	80 %	0 %	224988480
95	NC_012207	CTGGC	2	10	105606	105615	0 %	20 %	40 %	40 %	224988482
96	NC_012207	GCACA	2	10	106727	106736	40 %	0 %	20 %	40 %	224988482
97	NC_012207	CTGAA	2	10	109057	109066	40 %	20 %	20 %	20 %	224988485
98	NC_012207	ATCGC	2	10	109552	109561	20 %	20 %	20 %	40 %	224988485
99	NC_012207	TCTGA	2	10	110886	110895	20 %	40 %	20 %	20 %	224988487
100	NC_012207	CGGTC	2	10	111161	111170	0 %	20 %	40 %	40 %	224988487
101	NC_012207	GACCA	2	10	112299	112308	40 %	0 %	20 %	40 %	224988487
102	NC_012207	GGCTG	2	10	114863	114872	0 %	20 %	60 %	20 %	224988487
103	NC_012207	CCGCG	2	10	118783	118792	0 %	0 %	40 %	60 %	224988488
104	NC_012207	TCGTG	2	10	122736	122745	0 %	40 %	40 %	20 %	224988490
105	NC_012207	GCACG	2	10	124391	124400	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
106	NC_012207	CCGGA	2	10	124517	124526	20 %	0 %	40 %	40 %	224988492
107	NC_012207	GGCCG	2	10	126878	126887	0 %	0 %	60 %	40 %	224988493
108	NC_012207	TGCGC	2	10	126990	126999	0 %	20 %	40 %	40 %	224988493
109	NC_012207	GCGAG	2	10	127501	127510	20 %	0 %	60 %	20 %	224988493
110	NC_012207	GGGGT	2	10	128510	128519	0 %	20 %	80 %	0 %	224988493
111	NC_012207	CCCAC	2	10	129072	129081	20 %	0 %	0 %	80 %	224988493
112	NC_012207	CCGGC	2	10	129582	129591	0 %	0 %	40 %	60 %	224988493
113	NC_012207	TGCGG	2	10	129992	130001	0 %	20 %	60 %	20 %	224988493
114	NC_012207	ATCAC	2	10	131471	131480	40 %	20 %	0 %	40 %	224988495
115	NC_012207	ATCGG	2	10	131519	131528	20 %	20 %	40 %	20 %	224988495
116	NC_012207	CGGGC	2	10	132610	132619	0 %	0 %	60 %	40 %	224988495
117	NC_012207	GCGAT	2	10	134415	134424	20 %	20 %	40 %	20 %	224988497
118	NC_012207	GTTCG	2	10	134636	134645	0 %	40 %	40 %	20 %	224988497
119	NC_012207	CCTGG	2	10	135028	135037	0 %	20 %	40 %	40 %	224988497
120	NC_012207	GGCCC	2	10	135134	135143	0 %	0 %	40 %	60 %	224988497
121	NC_012207	CGTTG	2	10	135646	135655	0 %	40 %	40 %	20 %	224988497
122	NC_012207	CGACC	2	10	135718	135727	20 %	0 %	20 %	60 %	224988497
123	NC_012207	GAGAT	2	10	138738	138747	40 %	20 %	40 %	0 %	224988501
124	NC_012207	CGGCG	2	10	140893	140902	0 %	0 %	60 %	40 %	224988502
125	NC_012207	TGCGG	2	10	141526	141535	0 %	20 %	60 %	20 %	224988503
126	NC_012207	CGCTG	2	10	142233	142242	0 %	20 %	40 %	40 %	224988504
127	NC_012207	GTTGC	2	10	142779	142788	0 %	40 %	40 %	20 %	224988504
128	NC_012207	CCGAT	2	10	143527	143536	20 %	20 %	20 %	40 %	224988504
129	NC_012207	ATCGC	2	10	144218	144227	20 %	20 %	20 %	40 %	224988505
130	NC_012207	AACCG	2	10	144957	144966	40 %	0 %	20 %	40 %	224988505
131	NC_012207	CCGCC	2	10	145544	145553	0 %	0 %	20 %	80 %	224988505
132	NC_012207	CCGCC	2	10	146187	146196	0 %	0 %	20 %	80 %	224988506
133	NC_012207	GGGTC	2	10	147940	147949	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
134	NC_012207	ATCGG	2	10	149670	149679	20 %	20 %	40 %	20 %	224988510
135	NC_012207	ATTGG	2	10	152478	152487	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
136	NC_012207	AGCGA	2	10	154381	154390	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
137	NC_012207	AGCGA	2	10	154434	154443	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
138	NC_012207	TCGTC	2	10	154781	154790	0 %	40 %	20 %	40 %	224988513
139	NC_012207	CACGC	2	10	155245	155254	20 %	0 %	20 %	60 %	224988513
140	NC_012207	ATTCT	2	10	156089	156098	20 %	60 %	0 %	20 %	224988514
141	NC_012207	AGGCG	2	10	156617	156626	20 %	0 %	60 %	20 %	224988514
142	NC_012207	TGACC	2	10	159621	159630	20 %	20 %	20 %	40 %	224988517
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146	NC_012207	CGCGG	2	10	161294	161303	0 %	0 %	60 %	40 %	224988519
147	NC_012207	CGGTT	2	10	161621	161630	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
148	NC_012207	GTCGC	2	10	161783	161792	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
149	NC_012207	GCCGG	2	10	162082	162091	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
150	NC_012207	GCGCG	2	10	162204	162213	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
151	NC_012207	CTGGG	2	10	164418	164427	0 %	20 %	60 %	20 %	224988521
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153	NC_012207	GTTGG	2	10	166980	166989	0 %	40 %	60 %	0 %	224988524
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155	NC_012207	GCCGC	2	10	168819	168828	0 %	0 %	40 %	60 %	224988527
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177	NC_012207	GGCCG	2	10	196611	196620	0 %	0 %	60 %	40 %	224988551
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197	NC_012207	CCGTG	2	10	222309	222318	0 %	20 %	40 %	40 %	224988575
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237	NC_012207	GCAGT	2	10	274366	274375	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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249	NC_012207	TGCGC	2	10	300554	300563	0 %	20 %	40 %	40 %	224988637
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253	NC_012207	TGCGG	2	10	307403	307412	0 %	20 %	60 %	20 %	224988642
254	NC_012207	TGCCA	2	10	309167	309176	20 %	20 %	20 %	40 %	224988645
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258	NC_012207	CAGAT	2	10	312438	312447	40 %	20 %	20 %	20 %	224988647
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260	NC_012207	CGCAG	2	10	312984	312993	20 %	0 %	40 %	40 %	224988648
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263	NC_012207	TCGGC	2	10	314825	314834	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
264	NC_012207	CCTGG	2	10	315373	315382	0 %	20 %	40 %	40 %	224988651
265	NC_012207	GGCCG	2	10	318478	318487	0 %	0 %	60 %	40 %	224988652
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