MICAS: Microsatellite Analysis Server

Penta-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium bovis BCG str. Tokyo 172 chromosome

Total Repeats: 3066

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012207	TCATC	2	10	902	911	20 %	40 %	0 %	40 %	224988384
2	NC_012207	CGTTT	2	10	2092	2101	0 %	60 %	20 %	20 %	224988385
3	NC_012207	CGGTT	2	10	3241	3250	0 %	40 %	40 %	20 %	224988385
4	NC_012207	GTCGG	2	10	4589	4598	0 %	20 %	60 %	20 %	224988387
5	NC_012207	ACGGT	2	10	5747	5756	20 %	20 %	40 %	20 %	224988388
6	NC_012207	GCAGC	2	10	7373	7382	20 %	0 %	40 %	40 %	224988389
7	NC_012207	CGGTG	2	10	9281	9290	0 %	20 %	60 %	20 %	224988389
8	NC_012207	CAGAC	2	10	9799	9808	40 %	0 %	20 %	40 %	224988389
9	NC_012207	CGCAA	2	10	10323	10332	40 %	0 %	20 %	40 %	224988390
10	NC_012207	CGGCG	2	10	10449	10458	0 %	0 %	60 %	40 %	224988390
11	NC_012207	GGCGT	2	10	14153	14162	0 %	20 %	60 %	20 %	224988395
12	NC_012207	GGGCC	2	10	14436	14445	0 %	0 %	60 %	40 %	224988395
13	NC_012207	GCGTT	2	10	15181	15190	0 %	40 %	40 %	20 %	224988396
14	NC_012207	CCAGC	2	10	15721	15730	20 %	0 %	20 %	60 %	224988397
15	NC_012207	ACCGA	2	10	16484	16493	40 %	0 %	20 %	40 %	224988397
16	NC_012207	ATCGG	2	10	16876	16885	20 %	20 %	40 %	20 %	224988397
17	NC_012207	CGGCC	2	10	17885	17894	0 %	0 %	40 %	60 %	224988398
18	NC_012207	TTAGC	2	10	19036	19045	20 %	40 %	20 %	20 %	224988399
19	NC_012207	GGTCC	2	10	19108	19117	0 %	20 %	40 %	40 %	224988399
20	NC_012207	GTCGT	2	10	21627	21636	0 %	40 %	40 %	20 %	224988400
21	NC_012207	ATCAC	2	10	23900	23909	40 %	20 %	0 %	40 %	224988403
22	NC_012207	GCCGG	2	10	24587	24596	0 %	0 %	60 %	40 %	224988403
23	NC_012207	GGCAA	2	10	29281	29290	40 %	0 %	40 %	20 %	224988408
24	NC_012207	CGATC	2	10	30107	30116	20 %	20 %	20 %	40 %	224988409
25	NC_012207	CGACG	2	10	32294	32303	20 %	0 %	40 %	40 %	224988412
26	NC_012207	GCGTC	2	10	32349	32358	0 %	20 %	40 %	40 %	224988412
27	NC_012207	GACAC	2	10	32446	32455	40 %	0 %	20 %	40 %	224988412
28	NC_012207	TCCTG	2	10	37451	37460	0 %	40 %	20 %	40 %	224988418
29	NC_012207	CTCGG	2	10	37544	37553	0 %	20 %	40 %	40 %	224988418
30	NC_012207	GGCGC	2	10	38087	38096	0 %	0 %	60 %	40 %	224988418
31	NC_012207	TGGCC	2	10	38235	38244	0 %	20 %	40 %	40 %	224988418
32	NC_012207	CGGCG	2	10	38767	38776	0 %	0 %	60 %	40 %	224988418
33	NC_012207	GTCCA	2	10	39378	39387	20 %	20 %	20 %	40 %	224988419
34	NC_012207	GCCAA	2	10	41512	41521	40 %	0 %	20 %	40 %	224988421
35	NC_012207	GCACA	2	10	42311	42320	40 %	0 %	20 %	40 %	224988422
36	NC_012207	GGTAC	2	10	44845	44854	20 %	20 %	40 %	20 %	224988424
37	NC_012207	TCGAA	2	10	45077	45086	40 %	20 %	20 %	20 %	224988424
38	NC_012207	GCACC	2	10	46007	46016	20 %	0 %	20 %	60 %	224988424
39	NC_012207	CGGTG	2	10	47041	47050	0 %	20 %	60 %	20 %	224988425
40	NC_012207	TCATG	2	10	47187	47196	20 %	40 %	20 %	20 %	224988425
41	NC_012207	GCAGC	2	10	48581	48590	20 %	0 %	40 %	40 %	224988427
42	NC_012207	CCCGA	2	10	48664	48673	20 %	0 %	20 %	60 %	224988427
43	NC_012207	CAGCG	2	10	49789	49798	20 %	0 %	40 %	40 %	224988428
44	NC_012207	CTCCC	2	10	56232	56241	0 %	20 %	0 %	80 %	224988434
45	NC_012207	CGGCG	2	10	56681	56690	0 %	0 %	60 %	40 %	224988434
46	NC_012207	CGACC	2	10	58213	58222	20 %	0 %	20 %	60 %	224988436
47	NC_012207	CTTCG	2	10	58900	58909	0 %	40 %	20 %	40 %	224988437
48	NC_012207	CGGTG	2	10	59956	59965	0 %	20 %	60 %	20 %	224988440
49	NC_012207	TCAGG	2	10	62442	62451	20 %	20 %	40 %	20 %	224988441
50	NC_012207	GGCGA	2	10	66405	66414	20 %	0 %	60 %	20 %	224988445
51	NC_012207	GGTGT	2	10	68981	68990	0 %	40 %	60 %	0 %	224988447
52	NC_012207	ATCGG	2	10	69618	69627	20 %	20 %	40 %	20 %	224988447
53	NC_012207	CCGCG	2	10	70155	70164	0 %	0 %	40 %	60 %	224988447
54	NC_012207	GGCAA	2	10	70506	70515	40 %	0 %	40 %	20 %	224988447
55	NC_012207	CGACC	2	10	70795	70804	20 %	0 %	20 %	60 %	224988447
56	NC_012207	CGGGT	2	10	71249	71258	0 %	20 %	60 %	20 %	224988447
57	NC_012207	GGTCG	2	10	71309	71318	0 %	20 %	60 %	20 %	224988447
58	NC_012207	TGCCT	2	10	72050	72059	0 %	40 %	20 %	40 %	224988449
59	NC_012207	GTCCA	2	10	72921	72930	20 %	20 %	20 %	40 %	224988450
60	NC_012207	TGACC	2	10	75545	75554	20 %	20 %	20 %	40 %	224988452
61	NC_012207	GCCAA	2	10	75859	75868	40 %	0 %	20 %	40 %	224988452
62	NC_012207	GTCGC	2	10	75936	75945	0 %	20 %	40 %	40 %	224988452
63	NC_012207	GCGCG	2	10	77024	77033	0 %	0 %	60 %	40 %	224988453
64	NC_012207	CACGA	2	10	79926	79935	40 %	0 %	20 %	40 %	224988455
65	NC_012207	GAGCA	2	10	82464	82473	40 %	0 %	40 %	20 %	224988457
66	NC_012207	GCCGG	2	10	82563	82572	0 %	0 %	60 %	40 %	224988457
67	NC_012207	GCGAC	2	10	82639	82648	20 %	0 %	40 %	40 %	224988457
68	NC_012207	ATCCG	2	10	83409	83418	20 %	20 %	20 %	40 %	224988458
69	NC_012207	CACCG	2	10	84189	84198	20 %	0 %	20 %	60 %	224988459
70	NC_012207	TGGTC	2	10	86324	86333	0 %	40 %	40 %	20 %	224988461
71	NC_012207	GCTGG	2	10	86961	86970	0 %	20 %	60 %	20 %	224988462
72	NC_012207	TGGGT	2	10	89999	90008	0 %	40 %	60 %	0 %	224988468
73	NC_012207	TCGCC	2	10	90206	90215	0 %	20 %	20 %	60 %	224988468
74	NC_012207	GGGCC	2	10	91179	91188	0 %	0 %	60 %	40 %	224988469
75	NC_012207	GGCCG	2	10	92498	92507	0 %	0 %	60 %	40 %	224988470
76	NC_012207	GCGCC	2	10	93150	93159	0 %	0 %	40 %	60 %	224988470
77	NC_012207	GCTTG	2	10	95182	95191	0 %	40 %	40 %	20 %	224988472
78	NC_012207	CGTGT	2	10	95614	95623	0 %	40 %	40 %	20 %	224988473
79	NC_012207	AGATC	2	10	95693	95702	40 %	20 %	20 %	20 %	224988473
80	NC_012207	CGGCG	2	10	99274	99283	0 %	0 %	60 %	40 %	224988476
81	NC_012207	GCGGT	2	10	100350	100359	0 %	20 %	60 %	20 %	224988477
82	NC_012207	GCGCC	2	10	103182	103191	0 %	0 %	40 %	60 %	224988479
83	NC_012207	GGTGG	2	10	103870	103879	0 %	20 %	80 %	0 %	224988480
84	NC_012207	CTGGC	2	10	105606	105615	0 %	20 %	40 %	40 %	224988482
85	NC_012207	GCACA	2	10	106727	106736	40 %	0 %	20 %	40 %	224988482
86	NC_012207	CTGAA	2	10	109057	109066	40 %	20 %	20 %	20 %	224988485
87	NC_012207	ATCGC	2	10	109552	109561	20 %	20 %	20 %	40 %	224988485
88	NC_012207	TCTGA	2	10	110886	110895	20 %	40 %	20 %	20 %	224988487
89	NC_012207	CGGTC	2	10	111161	111170	0 %	20 %	40 %	40 %	224988487
90	NC_012207	GACCA	2	10	112299	112308	40 %	0 %	20 %	40 %	224988487
91	NC_012207	GGCTG	2	10	114863	114872	0 %	20 %	60 %	20 %	224988487
92	NC_012207	CCGCG	2	10	118783	118792	0 %	0 %	40 %	60 %	224988488
93	NC_012207	TCGTG	2	10	122736	122745	0 %	40 %	40 %	20 %	224988490
94	NC_012207	CCGGA	2	10	124517	124526	20 %	0 %	40 %	40 %	224988492
95	NC_012207	GGCCG	2	10	126878	126887	0 %	0 %	60 %	40 %	224988493
96	NC_012207	TGCGC	2	10	126990	126999	0 %	20 %	40 %	40 %	224988493
97	NC_012207	GCGAG	2	10	127501	127510	20 %	0 %	60 %	20 %	224988493
98	NC_012207	GGGGT	2	10	128510	128519	0 %	20 %	80 %	0 %	224988493
99	NC_012207	CCCAC	2	10	129072	129081	20 %	0 %	0 %	80 %	224988493
100	NC_012207	CCGGC	2	10	129582	129591	0 %	0 %	40 %	60 %	224988493
101	NC_012207	TGCGG	2	10	129992	130001	0 %	20 %	60 %	20 %	224988493
102	NC_012207	ATCAC	2	10	131471	131480	40 %	20 %	0 %	40 %	224988495
103	NC_012207	ATCGG	2	10	131519	131528	20 %	20 %	40 %	20 %	224988495
104	NC_012207	CGGGC	2	10	132610	132619	0 %	0 %	60 %	40 %	224988495
105	NC_012207	GCGAT	2	10	134415	134424	20 %	20 %	40 %	20 %	224988497
106	NC_012207	GTTCG	2	10	134636	134645	0 %	40 %	40 %	20 %	224988497
107	NC_012207	CCTGG	2	10	135028	135037	0 %	20 %	40 %	40 %	224988497
108	NC_012207	GGCCC	2	10	135134	135143	0 %	0 %	40 %	60 %	224988497
109	NC_012207	CGTTG	2	10	135646	135655	0 %	40 %	40 %	20 %	224988497
110	NC_012207	CGACC	2	10	135718	135727	20 %	0 %	20 %	60 %	224988497
111	NC_012207	GAGAT	2	10	138738	138747	40 %	20 %	40 %	0 %	224988501
112	NC_012207	CGGCG	2	10	140893	140902	0 %	0 %	60 %	40 %	224988502
113	NC_012207	TGCGG	2	10	141526	141535	0 %	20 %	60 %	20 %	224988503
114	NC_012207	CGCTG	2	10	142233	142242	0 %	20 %	40 %	40 %	224988504
115	NC_012207	GTTGC	2	10	142779	142788	0 %	40 %	40 %	20 %	224988504
116	NC_012207	CCGAT	2	10	143527	143536	20 %	20 %	20 %	40 %	224988504
117	NC_012207	ATCGC	2	10	144218	144227	20 %	20 %	20 %	40 %	224988505
118	NC_012207	AACCG	2	10	144957	144966	40 %	0 %	20 %	40 %	224988505
119	NC_012207	CCGCC	2	10	145544	145553	0 %	0 %	20 %	80 %	224988505
120	NC_012207	CCGCC	2	10	146187	146196	0 %	0 %	20 %	80 %	224988506
121	NC_012207	ATCGG	2	10	149670	149679	20 %	20 %	40 %	20 %	224988510
122	NC_012207	TCGTC	2	10	154781	154790	0 %	40 %	20 %	40 %	224988513
123	NC_012207	CACGC	2	10	155245	155254	20 %	0 %	20 %	60 %	224988513
124	NC_012207	ATTCT	2	10	156089	156098	20 %	60 %	0 %	20 %	224988514
125	NC_012207	AGGCG	2	10	156617	156626	20 %	0 %	60 %	20 %	224988514
126	NC_012207	TGACC	2	10	159621	159630	20 %	20 %	20 %	40 %	224988517
127	NC_012207	CGGCG	2	10	159867	159876	0 %	0 %	60 %	40 %	224988517
128	NC_012207	GCACC	2	10	160037	160046	20 %	0 %	20 %	60 %	224988518
129	NC_012207	CCGCA	2	10	161215	161224	20 %	0 %	20 %	60 %	224988519
130	NC_012207	CGCGG	2	10	161294	161303	0 %	0 %	60 %	40 %	224988519
131	NC_012207	CTGGG	2	10	164418	164427	0 %	20 %	60 %	20 %	224988521
132	NC_012207	GCCGG	2	10	165011	165020	0 %	0 %	60 %	40 %	224988522
133	NC_012207	GTTGG	2	10	166980	166989	0 %	40 %	60 %	0 %	224988524
134	NC_012207	GCGTG	2	10	168146	168155	0 %	20 %	60 %	20 %	224988527
135	NC_012207	GCCGC	2	10	168819	168828	0 %	0 %	40 %	60 %	224988527
136	NC_012207	CCGCC	2	10	170070	170079	0 %	0 %	20 %	80 %	224988528
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152	NC_012207	GGCTG	2	10	191193	191202	0 %	20 %	60 %	20 %	224988546
153	NC_012207	ACGGT	2	10	191339	191348	20 %	20 %	40 %	20 %	224988546
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174	NC_012207	CCGTG	2	10	222309	222318	0 %	20 %	40 %	40 %	224988575
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247	NC_012207	CGCGG	2	10	341945	341954	0 %	0 %	60 %	40 %	224988668
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251	NC_012207	GCCCG	2	10	346793	346802	0 %	0 %	40 %	60 %	224988671
252	NC_012207	GCCCG	2	10	347724	347733	0 %	0 %	40 %	60 %	224988672
253	NC_012207	CGGTT	2	10	350067	350076	0 %	40 %	40 %	20 %	224988672
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259	NC_012207	CGCGC	2	10	364801	364810	0 %	0 %	40 %	60 %	224988687
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261	NC_012207	GCTCT	2	10	365069	365078	0 %	40 %	20 %	40 %	224988687
262	NC_012207	GCGCG	2	10	366111	366120	0 %	0 %	60 %	40 %	224988690
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