MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium bovis BCG str. Tokyo 172 chromosome

Total Repeats: 1100

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012207	CCGA	2	8	1725	1732	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_012207	GCAC	2	8	11608	11615	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_012207	GCCC	2	8	12453	12460	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4	NC_012207	ATTC	2	8	13690	13697	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_012207	TCAA	2	8	25495	25502	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_012207	GAGC	2	8	25523	25530	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_012207	GGCC	2	8	25537	25544	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_012207	GCTA	2	8	33839	33846	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_012207	CAGC	2	8	39085	39092	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_012207	CTAC	2	8	47202	47209	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_012207	CTGG	2	8	52699	52706	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_012207	GCCG	2	8	53553	53560	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_012207	CGGT	2	8	79199	79206	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_012207	CTGG	2	8	87274	87281	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_012207	CGCA	2	8	89575	89582	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_012207	CGCT	2	8	97705	97712	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_012207	CCTG	2	8	97752	97759	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_012207	GCGA	2	8	97796	97803	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_012207	ACCG	2	8	99519	99526	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_012207	ATCC	2	8	125655	125662	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_012207	GCGA	2	8	130743	130750	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_012207	CGGG	2	8	130786	130793	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
23	NC_012207	GCTC	2	8	131298	131305	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
24	NC_012207	CGGG	2	8	134010	134017	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
25	NC_012207	TTCT	2	8	139927	139934	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_012207	ACGC	2	8	139999	140006	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_012207	GGGC	2	8	140091	140098	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
28	NC_012207	AGCA	2	8	141171	141178	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_012207	GCCG	2	8	143977	143984	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_012207	GCGT	2	8	148520	148527	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_012207	GCGG	2	8	149586	149593	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
32	NC_012207	GCCG	2	8	152466	152473	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_012207	CCGG	2	8	155832	155839	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_012207	GCGT	3	12	155860	155871	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
35	NC_012207	GGCT	2	8	158006	158013	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_012207	CGCA	2	8	158032	158039	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_012207	TCGT	2	8	161723	161730	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_012207	CCGG	2	8	161731	161738	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_012207	CCCG	2	8	161943	161950	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
40	NC_012207	GGGT	2	8	162538	162545	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012207	GCTG	2	8	162668	162675	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_012207	GTGC	2	8	162862	162869	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_012207	ACTT	2	8	171420	171427	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_012207	GCCG	2	8	181128	181135	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_012207	TTGA	2	8	186952	186959	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012207	CTGG	2	8	196939	196946	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_012207	CTGT	2	8	212491	212498	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_012207	GGCC	2	8	218579	218586	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_012207	CGGT	2	8	218915	218922	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_012207	GATG	2	8	219662	219669	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012207	AACT	2	8	230859	230866	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_012207	GGAA	2	8	231034	231041	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012207	ACGT	2	8	231786	231793	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_012207	ACAT	2	8	231853	231860	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_012207	GTGC	2	8	241566	241573	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_012207	GAAC	2	8	249252	249259	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_012207	CGCA	2	8	253861	253868	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_012207	GACG	2	8	256270	256277	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_012207	GCGG	2	8	271278	271285	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
60	NC_012207	CGGC	2	8	272644	272651	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_012207	TAGA	2	8	286753	286760	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012207	ACTT	2	8	290458	290465	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_012207	TCGT	2	8	292086	292093	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_012207	AACT	2	8	294136	294143	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_012207	AACC	2	8	294144	294151	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_012207	ATGC	2	8	295134	295141	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_012207	GACG	2	8	300452	300459	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
68	NC_012207	TTGC	2	8	308092	308099	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_012207	TCGG	2	8	308489	308496	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_012207	GGTA	2	8	334743	334750	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012207	GCCG	2	8	334830	334837	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_012207	TGGC	2	8	334842	334849	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
73	NC_012207	GCCG	2	8	337780	337787	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_012207	TGGC	2	8	337792	337799	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
75	NC_012207	CTGT	2	8	365823	365830	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_012207	AATC	2	8	377017	377024	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_012207	GGCC	2	8	387377	387384	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_012207	AAGG	2	8	388393	388400	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012207	TGAC	2	8	397362	397369	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_012207	GTCA	2	8	397373	397380	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_012207	ATCG	2	8	401535	401542	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_012207	TCAG	2	8	401704	401711	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_012207	GGCG	2	8	402175	402182	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
84	NC_012207	TTCG	2	8	402452	402459	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_012207	CCCA	2	8	402551	402558	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
86	NC_012207	ACCC	2	8	402755	402762	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
87	NC_012207	ATCG	2	8	418344	418351	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_012207	GCCA	2	8	418435	418442	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
89	NC_012207	GTCC	2	8	418461	418468	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
90	NC_012207	ACGG	2	8	418547	418554	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
91	NC_012207	CACG	2	8	455536	455543	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
92	NC_012207	TGCG	2	8	456648	456655	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
93	NC_012207	GCTC	2	8	457028	457035	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
94	NC_012207	GGAT	2	8	469321	469328	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_012207	CGAG	2	8	469464	469471	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
96	NC_012207	GCAC	2	8	477544	477551	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
97	NC_012207	CAAC	2	8	481413	481420	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_012207	AGAA	2	8	491920	491927	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_012207	GCGG	2	8	504296	504303	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
100	NC_012207	ACCG	2	8	506176	506183	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
101	NC_012207	CGGG	2	8	506213	506220	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
102	NC_012207	GAGG	2	8	508169	508176	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
103	NC_012207	GCGT	2	8	508255	508262	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
104	NC_012207	ACGG	2	8	511505	511512	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
105	NC_012207	GATG	2	8	516479	516486	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_012207	CTGA	2	8	517103	517110	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_012207	GCAA	2	8	519739	519746	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_012207	GCTG	2	8	522612	522619	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
109	NC_012207	CCGT	2	8	529657	529664	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
110	NC_012207	CGGC	2	8	534969	534976	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
111	NC_012207	CGGC	2	8	539712	539719	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_012207	GACG	2	8	539722	539729	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
113	NC_012207	CCGA	2	8	545974	545981	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
114	NC_012207	AATC	2	8	546405	546412	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_012207	GTCT	2	8	547027	547034	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_012207	CGGC	2	8	561028	561035	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117	NC_012207	CCGG	2	8	561963	561970	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
118	NC_012207	AGCA	2	8	566107	566114	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_012207	CGAC	2	8	566777	566784	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
120	NC_012207	CGCC	2	8	578669	578676	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
121	NC_012207	GCAT	2	8	578752	578759	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
122	NC_012207	GTTT	2	8	587486	587493	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_012207	GCCG	2	8	592500	592507	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_012207	GCTA	2	8	597802	597809	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_012207	GCGT	2	8	605688	605695	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
126	NC_012207	CCGA	2	8	605713	605720	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
127	NC_012207	CCGA	2	8	609716	609723	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
128	NC_012207	GTCC	2	8	612271	612278	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
129	NC_012207	GCCC	2	8	626781	626788	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
130	NC_012207	CCGG	2	8	636786	636793	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_012207	TGCC	2	8	641223	641230	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
132	NC_012207	CGCC	2	8	642167	642174	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
133	NC_012207	GCCG	2	8	652764	652771	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
134	NC_012207	TGGC	2	8	656054	656061	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
135	NC_012207	CCAG	2	8	658764	658771	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
136	NC_012207	CGGT	2	8	659508	659515	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
137	NC_012207	GTGC	2	8	662208	662215	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
138	NC_012207	AAGG	2	8	662231	662238	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_012207	CGGC	2	8	664714	664721	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140	NC_012207	TTGC	2	8	666808	666815	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_012207	GTCG	2	8	666879	666886	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
142	NC_012207	CGGC	2	8	669708	669715	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
143	NC_012207	GTGG	2	8	669725	669732	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
144	NC_012207	GCCG	2	8	673215	673222	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
145	NC_012207	CGAA	2	8	677318	677325	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
146	NC_012207	CGGC	2	8	678343	678350	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
147	NC_012207	CCGG	2	8	680349	680356	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
148	NC_012207	TTCA	2	8	685635	685642	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_012207	CGGA	2	8	696868	696875	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
150	NC_012207	TCCG	2	8	698240	698247	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
151	NC_012207	CGGG	2	8	698332	698339	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
152	NC_012207	CCCA	2	8	705467	705474	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
153	NC_012207	ACCG	2	8	705564	705571	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
154	NC_012207	CCGC	2	8	708179	708186	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
155	NC_012207	GGTC	2	8	715217	715224	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
156	NC_012207	TCGA	2	8	723337	723344	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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161	NC_012207	GACT	2	8	733142	733149	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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166	NC_012207	AGGA	2	8	750602	750609	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
167	NC_012207	CGGC	2	8	756235	756242	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
168	NC_012207	TCGA	2	8	756283	756290	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
169	NC_012207	CGGC	2	8	757030	757037	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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173	NC_012207	CATG	2	8	769197	769204	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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181	NC_012207	GCTG	2	8	791379	791386	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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183	NC_012207	GGCG	2	8	796402	796409	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
184	NC_012207	GTGG	2	8	800343	800350	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
185	NC_012207	CAGG	2	8	801342	801349	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
186	NC_012207	ATTG	2	8	801386	801393	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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230	NC_012207	CTTA	2	8	934257	934264	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
231	NC_012207	CACT	2	8	936346	936353	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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272	NC_012207	CCGG	2	8	1095456	1095463	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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496	NC_012207	TTGT	2	8	2035028	2035035	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
497	NC_012207	GGTA	2	8	2035839	2035846	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
498	NC_012207	CGGT	2	8	2039123	2039130	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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500	NC_012207	ACCG	2	8	2039382	2039389	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding

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