MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium bovis BCG str. Tokyo 172 chromosome

Total Repeats: 76634

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012207	CAC	2	6	27	32	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224988384
2	NC_012207	GTC	2	6	46	51	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988384
3	NC_012207	GAC	2	6	79	84	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988384
4	NC_012207	CAG	2	6	90	95	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988384
5	NC_012207	TCG	2	6	167	172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988384
6	NC_012207	AGC	2	6	199	204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988384
7	NC_012207	GCC	2	6	260	265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988384
8	NC_012207	CCG	2	6	304	309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988384
9	NC_012207	CGA	2	6	324	329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988384
10	NC_012207	GCC	2	6	339	344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988384
11	NC_012207	ACG	2	6	389	394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988384
12	NC_012207	TGA	2	6	399	404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224988384
13	NC_012207	CGC	3	9	561	569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988384
14	NC_012207	GTT	2	6	681	686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224988384
15	NC_012207	CGA	2	6	810	815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988384
16	NC_012207	TTC	2	6	856	861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224988384
17	NC_012207	CAA	2	6	888	893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224988384
18	NC_012207	AGC	2	6	926	931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988384
19	NC_012207	ACC	2	6	993	998	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224988384
20	NC_012207	CGA	2	6	1062	1067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988384
21	NC_012207	CAG	2	6	1086	1091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988384
22	NC_012207	GCG	2	6	1237	1242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988384
23	NC_012207	CCG	2	6	1259	1264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988384
24	NC_012207	CAC	2	6	1491	1496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224988384
25	NC_012207	GTT	2	6	2186	2191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224988385
26	NC_012207	CCG	2	6	2242	2247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988385
27	NC_012207	TTG	2	6	2304	2309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224988385
28	NC_012207	CGA	2	6	2407	2412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988385
29	NC_012207	TTG	2	6	2463	2468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224988385
30	NC_012207	ATT	2	6	2477	2482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224988385
31	NC_012207	CGC	2	6	2510	2515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988385
32	NC_012207	GAC	2	6	2523	2528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988385
33	NC_012207	GGT	2	6	2576	2581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224988385
34	NC_012207	CGT	2	6	2635	2640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988385
35	NC_012207	GCC	2	6	2691	2696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988385
36	NC_012207	CGG	2	6	2708	2713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988385
37	NC_012207	GCA	2	6	2794	2799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988385
38	NC_012207	CTT	2	6	2808	2813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224988385
39	NC_012207	CCA	2	6	2869	2874	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224988385
40	NC_012207	GAT	2	6	2988	2993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224988385
41	NC_012207	TTG	3	9	3016	3024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224988385
42	NC_012207	CGG	2	6	3205	3210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988385
43	NC_012207	TTG	2	6	3362	3367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224988386
44	NC_012207	CGA	2	6	3416	3421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988386
45	NC_012207	GTG	2	6	3499	3504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224988386
46	NC_012207	ACG	2	6	3506	3511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988386
47	NC_012207	CAA	2	6	3555	3560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224988386
48	NC_012207	ATC	2	6	3576	3581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224988386
49	NC_012207	TGT	2	6	3623	3628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224988386
50	NC_012207	CGG	2	6	3673	3678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988386
51	NC_012207	GAT	2	6	3688	3693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224988386
52	NC_012207	GTG	2	6	3748	3753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224988386
53	NC_012207	TGG	2	6	3869	3874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224988386
54	NC_012207	GAA	2	6	3915	3920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224988386
55	NC_012207	AGC	2	6	4029	4034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988386
56	NC_012207	GGC	2	6	4044	4049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988386
57	NC_012207	GGC	2	6	4053	4058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988386
58	NC_012207	GAC	2	6	4111	4116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988386
59	NC_012207	GGC	2	6	4200	4205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988386
60	NC_012207	TGG	2	6	4227	4232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224988386
61	NC_012207	GTT	2	6	4242	4247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224988386
62	NC_012207	CGA	2	6	4251	4256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988386
63	NC_012207	CGG	2	6	4301	4306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988386
64	NC_012207	CCG	2	6	4313	4318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988386
65	NC_012207	CCG	2	6	4358	4363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988386
66	NC_012207	GGT	2	6	4422	4427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224988386
67	NC_012207	TGC	3	9	4532	4540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988387
68	NC_012207	CGA	2	6	4611	4616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988387
69	NC_012207	GGT	2	6	4745	4750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224988387
70	NC_012207	CCA	2	6	4754	4759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224988387
71	NC_012207	ACG	2	6	4792	4797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988387
72	NC_012207	CGC	2	6	4877	4882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988387
73	NC_012207	CGG	2	6	4927	4932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988387
74	NC_012207	AGA	2	6	5141	5146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224988388
75	NC_012207	GTG	2	6	5174	5179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224988388
76	NC_012207	GCG	2	6	5191	5196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988388
77	NC_012207	GAG	2	6	5222	5227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	224988388
78	NC_012207	AAG	2	6	5255	5260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224988388
79	NC_012207	GGT	2	6	5383	5388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224988388
80	NC_012207	CGA	2	6	5401	5406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988388
81	NC_012207	TGC	2	6	5442	5447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988388
82	NC_012207	CGA	2	6	5473	5478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988388
83	NC_012207	GTG	2	6	5531	5536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224988388
84	NC_012207	CGG	2	6	5554	5559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988388
85	NC_012207	TGG	2	6	5590	5595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224988388
86	NC_012207	GGT	2	6	5617	5622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224988388
87	NC_012207	AAG	2	6	5732	5737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224988388
88	NC_012207	CAA	2	6	5839	5844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224988388
89	NC_012207	CGA	2	6	5866	5871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988388
90	NC_012207	GTC	2	6	5891	5896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988388
91	NC_012207	TGG	2	6	6009	6014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224988388
92	NC_012207	AGC	2	6	6056	6061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988388
93	NC_012207	GGC	2	6	6176	6181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988388
94	NC_012207	GGT	2	6	6217	6222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224988388
95	NC_012207	GCG	2	6	6520	6525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988388
96	NC_012207	ATC	2	6	6692	6697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224988388
97	NC_012207	ATC	2	6	6752	6757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224988388
98	NC_012207	ACG	2	6	6780	6785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988388
99	NC_012207	TGT	2	6	6867	6872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224988388
100	NC_012207	GTT	3	9	6877	6885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224988388
101	NC_012207	CCG	2	6	6935	6940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988388
102	NC_012207	CTG	2	6	7007	7012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988388
103	NC_012207	GAA	2	6	7033	7038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224988388
104	NC_012207	CAA	2	6	7042	7047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224988388
105	NC_012207	ACC	2	6	7109	7114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224988388
106	NC_012207	GAC	2	6	7154	7159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988388
107	NC_012207	GCC	4	12	7160	7171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988388
108	NC_012207	GTT	2	6	7177	7182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224988388
109	NC_012207	GCC	2	6	7319	7324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988389
110	NC_012207	GAC	2	6	7326	7331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988389
111	NC_012207	CAG	2	6	7362	7367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988389
112	NC_012207	TCG	2	6	7408	7413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988389
113	NC_012207	ACC	2	6	7552	7557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224988389
114	NC_012207	TGG	2	6	7627	7632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224988389
115	NC_012207	CGG	2	6	7672	7677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988389
116	NC_012207	CGA	2	6	7736	7741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988389
117	NC_012207	ACG	2	6	7768	7773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988389
118	NC_012207	CTG	2	6	7818	7823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988389
119	NC_012207	GGC	2	6	7836	7841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988389
120	NC_012207	CGC	2	6	7870	7875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988389
121	NC_012207	ACG	2	6	7924	7929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988389
122	NC_012207	CGA	2	6	7931	7936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988389
123	NC_012207	CCG	2	6	7990	7995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988389
124	NC_012207	TCG	2	6	8002	8007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988389
125	NC_012207	GTT	2	6	8067	8072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224988389
126	NC_012207	AGA	2	6	8078	8083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224988389
127	NC_012207	TCA	2	6	8149	8154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224988389
128	NC_012207	GGT	2	6	8276	8281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224988389
129	NC_012207	TAA	2	6	8285	8290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224988389
130	NC_012207	TCG	2	6	8344	8349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988389
131	NC_012207	ACC	2	6	8401	8406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224988389
132	NC_012207	GCG	2	6	8423	8428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988389
133	NC_012207	CAC	2	6	8429	8434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224988389
134	NC_012207	GCT	2	6	8570	8575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988389
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138	NC_012207	CGA	2	6	8774	8779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988389
139	NC_012207	ATC	2	6	8793	8798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224988389
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249	NC_012207	CCG	2	6	16668	16673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988397
250	NC_012207	ACG	2	6	16718	16723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988397
251	NC_012207	CGG	2	6	16734	16739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988397
252	NC_012207	CTG	2	6	16944	16949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988397
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