MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_lp36

Total Repeats: 19

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012204	AAAGT	2	10	878	887	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012204	GATAA	2	10	1121	1130	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012204	GCAGA	2	10	2367	2376	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
4	NC_012204	TATTT	2	10	3100	3109	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012204	GTTTG	2	10	5333	5342	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012204	ATATT	3	15	8509	8523	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012204	TTAAT	2	10	9702	9711	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012204	TAGAT	2	10	9727	9736	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012204	ATTTT	2	10	9814	9823	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012204	GCAAA	2	10	10696	10705	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_012204	TATAG	2	10	10922	10931	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012204	TTTTG	2	10	13700	13709	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012204	TTTAG	2	10	14028	14037	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012204	ATTTT	2	10	16107	16116	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012204	AATTT	2	10	18109	18118	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012204	ATTAT	4	20	20591	20610	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012204	TTATT	2	10	20623	20632	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012204	AAAAT	2	10	20944	20953	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012204	ATTTA	2	10	21102	21111	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.