MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_lp36

Total Repeats: 20

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012204	TCTAA	2	10	2466	2475	40 %	40 %	0 %	20 %	224985712
2	NC_012204	ATAAA	2	10	3480	3489	80 %	20 %	0 %	0 %	224985713
3	NC_012204	GCCTA	2	10	3571	3580	20 %	20 %	20 %	40 %	224985713
4	NC_012204	AAACA	2	10	5639	5648	80 %	0 %	0 %	20 %	224985716
5	NC_012204	AAAGT	2	10	6880	6889	60 %	20 %	20 %	0 %	224985719
6	NC_012204	ATATA	2	10	8610	8619	60 %	40 %	0 %	0 %	224985722
7	NC_012204	TTTTC	2	10	10289	10298	0 %	80 %	0 %	20 %	224985724
8	NC_012204	AACTT	2	10	11700	11709	40 %	40 %	0 %	20 %	224985727
9	NC_012204	AAATT	2	10	11922	11931	60 %	40 %	0 %	0 %	224985727
10	NC_012204	AAATT	2	10	12036	12045	60 %	40 %	0 %	0 %	224985727
11	NC_012204	TATTG	2	10	15089	15098	20 %	60 %	20 %	0 %	224985731
12	NC_012204	TAAAT	2	10	15934	15943	60 %	40 %	0 %	0 %	224985732
13	NC_012204	TAAAA	2	10	17139	17148	80 %	20 %	0 %	0 %	224985735
14	NC_012204	AATCA	2	10	18799	18808	60 %	20 %	0 %	20 %	224985736
15	NC_012204	CTAAA	2	10	18930	18939	60 %	20 %	0 %	20 %	224985736
16	NC_012204	GACAT	2	10	19387	19396	40 %	20 %	20 %	20 %	224985737
17	NC_012204	AATTT	2	10	19558	19567	40 %	60 %	0 %	0 %	224985737
18	NC_012204	AAAAT	2	10	19881	19890	80 %	20 %	0 %	0 %	224985738
19	NC_012204	TTATA	2	10	20017	20026	40 %	60 %	0 %	0 %	224985738
20	NC_012204	TGTAT	2	10	20248	20257	20 %	60 %	20 %	0 %	224985738

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.