MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_lp36

Total Repeats: 42

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012204	AATA	2	8	339	346	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012204	ATTT	2	8	404	411	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012204	TTTA	2	8	438	445	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012204	ATCT	2	8	478	485	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_012204	TAGA	2	8	561	568	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012204	TAAT	2	8	3075	3082	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012204	TACA	2	8	3145	3152	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_012204	TAGA	2	8	6388	6395	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012204	CTTA	2	8	7339	7346	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_012204	AGAT	2	8	7423	7430	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012204	TTTC	2	8	7530	7537	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_012204	TCAC	2	8	7541	7548	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_012204	ATTG	2	8	7889	7896	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012204	AAAT	2	8	8195	8202	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012204	TTTA	2	8	8254	8261	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012204	ATAA	2	8	8369	8376	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012204	TAAA	2	8	8391	8398	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012204	TTAA	2	8	8586	8593	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012204	AAGC	2	8	9677	9684	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_012204	ACAA	2	8	9839	9846	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_012204	TAAT	2	8	9907	9914	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012204	AATA	2	8	9944	9951	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012204	ACAA	2	8	10542	10549	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_012204	TAAA	2	8	10683	10690	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012204	AATG	2	8	13097	13104	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012204	GAAT	2	8	13750	13757	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012204	TAAT	2	8	14084	14091	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012204	TGTA	2	8	14324	14331	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012204	TATG	2	8	14494	14501	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012204	TCAT	2	8	16558	16565	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_012204	TATT	2	8	17664	17671	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012204	ATTA	2	8	17708	17715	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012204	AATA	2	8	17793	17800	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012204	TTAT	2	8	17982	17989	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012204	ATTA	2	8	18135	18142	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012204	ATTA	2	8	18167	18174	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012204	TATT	2	8	21225	21232	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012204	TAGA	2	8	21569	21576	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012204	AACC	2	8	21872	21879	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_012204	AGAC	2	8	22085	22092	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_012204	GAGT	2	8	22333	22340	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012204	GAAA	2	8	22388	22395	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.