MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_lp36

Total Repeats: 381

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012204	TTA	2	6	3	8	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012204	GTT	2	6	90	95	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012204	CTA	2	6	163	168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_012204	TTC	2	6	190	195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_012204	CTT	2	6	205	210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_012204	TAG	2	6	305	310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012204	TAC	2	6	510	515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_012204	TAA	2	6	545	550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012204	CAA	2	6	670	675	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224985708
10	NC_012204	ATA	2	6	716	721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224985708
11	NC_012204	ATA	2	6	749	754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224985708
12	NC_012204	ACA	3	9	776	784	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224985708
13	NC_012204	GAT	2	6	811	816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224985708
14	NC_012204	CAA	3	9	862	870	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_012204	AAT	2	6	871	876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012204	ACA	2	6	974	979	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_012204	ACT	2	6	1009	1014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_012204	TAA	2	6	1015	1020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012204	CTT	2	6	1062	1067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_012204	AGA	2	6	1069	1074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012204	TAA	2	6	1141	1146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012204	AAT	2	6	1163	1168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012204	TAG	2	6	1246	1251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224985709
24	NC_012204	TGC	2	6	1288	1293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224985709
25	NC_012204	ATG	2	6	1341	1346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224985709
26	NC_012204	AGA	2	6	1351	1356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224985709
27	NC_012204	ATG	2	6	1416	1421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224985709
28	NC_012204	ATG	2	6	1425	1430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224985709
29	NC_012204	CTT	2	6	1621	1626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_012204	ACA	2	6	1650	1655	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224985710
31	NC_012204	ATT	2	6	1696	1701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224985710
32	NC_012204	ATT	2	6	1708	1713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224985710
33	NC_012204	ATT	3	9	1753	1761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224985710
34	NC_012204	ATT	2	6	1771	1776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224985710
35	NC_012204	TTA	2	6	1802	1807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012204	TAA	2	6	1840	1845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224985711
37	NC_012204	TAT	2	6	1853	1858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224985711
38	NC_012204	GTT	2	6	1897	1902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224985711
39	NC_012204	ATC	2	6	1954	1959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224985711
40	NC_012204	TAC	2	6	1976	1981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224985711
41	NC_012204	CAT	2	6	2035	2040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224985711
42	NC_012204	GAT	2	6	2097	2102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224985711
43	NC_012204	ATA	2	6	2113	2118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224985711
44	NC_012204	AAT	2	6	2147	2152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224985711
45	NC_012204	AAT	2	6	2175	2180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224985711
46	NC_012204	GAA	2	6	2190	2195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224985711
47	NC_012204	TAC	2	6	2255	2260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224985711
48	NC_012204	AAG	3	9	2287	2295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224985711
49	NC_012204	AAG	2	6	2326	2331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012204	GCA	2	6	2352	2357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_012204	TAT	2	6	2458	2463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224985712
52	NC_012204	ACT	2	6	2950	2955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_012204	ATT	2	6	2989	2994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012204	TAA	2	6	3061	3066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012204	ATT	2	6	3085	3090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012204	AAG	2	6	3137	3142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012204	AAT	2	6	3185	3190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012204	ATA	2	6	3258	3263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012204	ATA	2	6	3330	3335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224985713
60	NC_012204	AGC	3	9	3338	3346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224985713
61	NC_012204	TCT	2	6	3419	3424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224985713
62	NC_012204	AGA	2	6	3427	3432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224985713
63	NC_012204	AGA	2	6	3530	3535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224985713
64	NC_012204	CTG	2	6	3618	3623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224985713
65	NC_012204	ATG	2	6	3636	3641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224985713
66	NC_012204	TGC	2	6	3646	3651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224985713
67	NC_012204	AGA	2	6	3709	3714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224985713
68	NC_012204	CTA	3	9	3751	3759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224985713
69	NC_012204	ACC	2	6	3768	3773	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224985713
70	NC_012204	AGT	2	6	3803	3808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224985713
71	NC_012204	CTT	2	6	3988	3993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_012204	ACA	2	6	4017	4022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224985714
73	NC_012204	ATT	2	6	4063	4068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224985714
74	NC_012204	ATT	2	6	4075	4080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224985714
75	NC_012204	ATT	2	6	4120	4125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224985714
76	NC_012204	ATT	2	6	4138	4143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224985714
77	NC_012204	TTA	2	6	4169	4174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012204	TAA	2	6	4207	4212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224985715
79	NC_012204	TAT	2	6	4220	4225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224985715
80	NC_012204	GTT	2	6	4264	4269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224985715
81	NC_012204	ATC	2	6	4321	4326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224985715
82	NC_012204	TAC	2	6	4343	4348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224985715
83	NC_012204	CAT	2	6	4402	4407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224985715
84	NC_012204	GAT	2	6	4464	4469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224985715
85	NC_012204	ATA	2	6	4480	4485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224985715
86	NC_012204	AAT	2	6	4514	4519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224985715
87	NC_012204	AAT	2	6	4542	4547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224985715
88	NC_012204	GAA	2	6	4557	4562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224985715
89	NC_012204	CAA	2	6	4627	4632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224985715
90	NC_012204	AGA	3	9	4655	4663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224985715
91	NC_012204	TTA	2	6	4824	4829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224985715
92	NC_012204	TAT	2	6	4874	4879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224985715
93	NC_012204	CTT	2	6	5316	5321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_012204	ATC	2	6	5405	5410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_012204	AAG	2	6	5418	5423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_012204	TAA	2	6	5427	5432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012204	ATT	2	6	5455	5460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224985716
98	NC_012204	ACA	2	6	5556	5561	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224985716
99	NC_012204	TCT	2	6	5567	5572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224985716
100	NC_012204	AGC	2	6	5585	5590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224985716
101	NC_012204	AAT	2	6	5624	5629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224985716
102	NC_012204	GTT	2	6	5666	5671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224985716
103	NC_012204	ATA	2	6	5688	5693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224985716
104	NC_012204	AGC	2	6	5696	5701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224985716
105	NC_012204	CAA	2	6	5711	5716	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224985716
106	NC_012204	TCT	2	6	5774	5779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224985716
107	NC_012204	AGA	2	6	5782	5787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224985716
108	NC_012204	ATA	2	6	5834	5839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_012204	AGT	2	6	5959	5964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224985717
110	NC_012204	CTT	2	6	5969	5974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224985717
111	NC_012204	ATG	2	6	5990	5995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224985717
112	NC_012204	GCT	2	6	6245	6250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224985718
113	NC_012204	ATA	2	6	6257	6262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012204	TAA	2	6	6372	6377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_012204	AAG	2	6	6421	6426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224985719
116	NC_012204	CAA	2	6	6495	6500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224985719
117	NC_012204	TAA	3	9	6524	6532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224985719
118	NC_012204	ACA	2	6	6547	6552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224985719
119	NC_012204	AAG	2	6	6554	6559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224985719
120	NC_012204	AAT	2	6	6597	6602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224985719
121	NC_012204	AAT	2	6	6612	6617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224985719
122	NC_012204	AAG	2	6	6631	6636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224985719
123	NC_012204	AAT	2	6	6657	6662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224985719
124	NC_012204	CAA	2	6	6747	6752	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224985719
125	NC_012204	TAA	3	9	6755	6763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224985719
126	NC_012204	CAT	2	6	6791	6796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224985719
127	NC_012204	AGA	2	6	6818	6823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224985719
128	NC_012204	TAA	2	6	6827	6832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224985719
129	NC_012204	TAA	2	6	6869	6874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224985719
130	NC_012204	AAT	2	6	6912	6917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224985719
131	NC_012204	TAA	2	6	6929	6934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224985719
132	NC_012204	TAG	2	6	6983	6988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224985719
133	NC_012204	ATT	2	6	7012	7017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224985719
134	NC_012204	AGA	2	6	7079	7084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224985719
135	NC_012204	AAG	2	6	7093	7098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224985719
136	NC_012204	ATA	2	6	7105	7110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224985719
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144	NC_012204	GCT	2	6	7620	7625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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275	NC_012204	ATT	2	6	16507	16512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.