MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_lp36

Total Repeats: 234

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012204	CAA	2	6	670	675	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224985708
2	NC_012204	ATA	2	6	716	721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224985708
3	NC_012204	ATA	2	6	749	754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224985708
4	NC_012204	ACA	3	9	776	784	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224985708
5	NC_012204	GAT	2	6	811	816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224985708
6	NC_012204	TAG	2	6	1246	1251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224985709
7	NC_012204	TGC	2	6	1288	1293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224985709
8	NC_012204	ATG	2	6	1341	1346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224985709
9	NC_012204	AGA	2	6	1351	1356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224985709
10	NC_012204	ATG	2	6	1416	1421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224985709
11	NC_012204	ATG	2	6	1425	1430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224985709
12	NC_012204	ACA	2	6	1650	1655	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224985710
13	NC_012204	ATT	2	6	1696	1701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224985710
14	NC_012204	ATT	2	6	1708	1713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224985710
15	NC_012204	ATT	3	9	1753	1761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224985710
16	NC_012204	ATT	2	6	1771	1776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224985710
17	NC_012204	TAA	2	6	1840	1845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224985711
18	NC_012204	TAT	2	6	1853	1858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224985711
19	NC_012204	GTT	2	6	1897	1902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224985711
20	NC_012204	ATC	2	6	1954	1959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224985711
21	NC_012204	TAC	2	6	1976	1981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224985711
22	NC_012204	CAT	2	6	2035	2040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224985711
23	NC_012204	GAT	2	6	2097	2102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224985711
24	NC_012204	ATA	2	6	2113	2118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224985711
25	NC_012204	AAT	2	6	2147	2152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224985711
26	NC_012204	AAT	2	6	2175	2180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224985711
27	NC_012204	GAA	2	6	2190	2195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224985711
28	NC_012204	TAC	2	6	2255	2260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224985711
29	NC_012204	AAG	3	9	2287	2295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224985711
30	NC_012204	TAT	2	6	2458	2463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224985712
31	NC_012204	ATA	2	6	3330	3335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224985713
32	NC_012204	AGC	3	9	3338	3346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224985713
33	NC_012204	TCT	2	6	3419	3424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224985713
34	NC_012204	AGA	2	6	3427	3432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224985713
35	NC_012204	AGA	2	6	3530	3535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224985713
36	NC_012204	CTG	2	6	3618	3623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224985713
37	NC_012204	ATG	2	6	3636	3641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224985713
38	NC_012204	TGC	2	6	3646	3651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224985713
39	NC_012204	AGA	2	6	3709	3714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224985713
40	NC_012204	CTA	3	9	3751	3759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224985713
41	NC_012204	ACC	2	6	3768	3773	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224985713
42	NC_012204	AGT	2	6	3803	3808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224985713
43	NC_012204	ACA	2	6	4017	4022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224985714
44	NC_012204	ATT	2	6	4063	4068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224985714
45	NC_012204	ATT	2	6	4075	4080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224985714
46	NC_012204	ATT	2	6	4120	4125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224985714
47	NC_012204	ATT	2	6	4138	4143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224985714
48	NC_012204	TAA	2	6	4207	4212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224985715
49	NC_012204	TAT	2	6	4220	4225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224985715
50	NC_012204	GTT	2	6	4264	4269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224985715
51	NC_012204	ATC	2	6	4321	4326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224985715
52	NC_012204	TAC	2	6	4343	4348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224985715
53	NC_012204	CAT	2	6	4402	4407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224985715
54	NC_012204	GAT	2	6	4464	4469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224985715
55	NC_012204	ATA	2	6	4480	4485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224985715
56	NC_012204	AAT	2	6	4514	4519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224985715
57	NC_012204	AAT	2	6	4542	4547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224985715
58	NC_012204	GAA	2	6	4557	4562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224985715
59	NC_012204	CAA	2	6	4627	4632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224985715
60	NC_012204	AGA	3	9	4655	4663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224985715
61	NC_012204	TTA	2	6	4824	4829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224985715
62	NC_012204	TAT	2	6	4874	4879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224985715
63	NC_012204	ATT	2	6	5455	5460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224985716
64	NC_012204	ACA	2	6	5556	5561	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224985716
65	NC_012204	TCT	2	6	5567	5572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224985716
66	NC_012204	AGC	2	6	5585	5590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224985716
67	NC_012204	AAT	2	6	5624	5629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224985716
68	NC_012204	GTT	2	6	5666	5671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224985716
69	NC_012204	ATA	2	6	5688	5693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224985716
70	NC_012204	AGC	2	6	5696	5701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224985716
71	NC_012204	CAA	2	6	5711	5716	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224985716
72	NC_012204	TCT	2	6	5774	5779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224985716
73	NC_012204	AGA	2	6	5782	5787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224985716
74	NC_012204	AGT	2	6	5959	5964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224985717
75	NC_012204	CTT	2	6	5969	5974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224985717
76	NC_012204	ATG	2	6	5990	5995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224985717
77	NC_012204	GCT	2	6	6245	6250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224985718
78	NC_012204	AAG	2	6	6421	6426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224985719
79	NC_012204	CAA	2	6	6495	6500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224985719
80	NC_012204	TAA	3	9	6524	6532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224985719
81	NC_012204	ACA	2	6	6547	6552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224985719
82	NC_012204	AAG	2	6	6554	6559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224985719
83	NC_012204	AAT	2	6	6597	6602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224985719
84	NC_012204	AAT	2	6	6612	6617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224985719
85	NC_012204	AAG	2	6	6631	6636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224985719
86	NC_012204	AAT	2	6	6657	6662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224985719
87	NC_012204	CAA	2	6	6747	6752	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224985719
88	NC_012204	TAA	3	9	6755	6763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224985719
89	NC_012204	CAT	2	6	6791	6796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224985719
90	NC_012204	AGA	2	6	6818	6823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224985719
91	NC_012204	TAA	2	6	6827	6832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224985719
92	NC_012204	TAA	2	6	6869	6874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224985719
93	NC_012204	AAT	2	6	6912	6917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224985719
94	NC_012204	TAA	2	6	6929	6934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224985719
95	NC_012204	TAG	2	6	6983	6988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224985719
96	NC_012204	ATT	2	6	7012	7017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224985719
97	NC_012204	AGA	2	6	7079	7084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224985719
98	NC_012204	AAG	2	6	7093	7098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224985719
99	NC_012204	ATA	2	6	7105	7110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224985719
100	NC_012204	TAT	2	6	7146	7151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224985719
101	NC_012204	AAG	2	6	7165	7170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224985719
102	NC_012204	GCT	2	6	7284	7289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224985719
103	NC_012204	AGT	2	6	7293	7298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224985719
104	NC_012204	TCT	2	6	7673	7678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224985720
105	NC_012204	CTT	2	6	8123	8128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224985721
106	NC_012204	CAA	2	6	8132	8137	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224985721
107	NC_012204	AAC	2	6	8149	8154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224985721
108	NC_012204	TAA	2	6	8724	8729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224985722
109	NC_012204	TAA	2	6	8745	8750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224985722
110	NC_012204	AAG	2	6	8789	8794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224985722
111	NC_012204	AAG	3	9	8825	8833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224985722
112	NC_012204	TGA	2	6	8865	8870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224985722
113	NC_012204	AGA	2	6	8931	8936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224985722
114	NC_012204	TCA	2	6	8983	8988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224985722
115	NC_012204	GGT	2	6	8992	8997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224985722
116	NC_012204	ATA	2	6	9011	9016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224985722
117	NC_012204	ATA	2	6	9100	9105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224985722
118	NC_012204	ATC	2	6	9277	9282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224985722
119	NC_012204	TTA	2	6	9304	9309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224985722
120	NC_012204	ATG	2	6	9320	9325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224985722
121	NC_012204	ATT	2	6	9590	9595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224985723
122	NC_012204	ATG	2	6	9616	9621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224985723
123	NC_012204	TCC	2	6	9633	9638	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	224985723
124	NC_012204	GAA	2	6	10150	10155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224985724
125	NC_012204	TTC	2	6	10156	10161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224985724
126	NC_012204	ATT	2	6	10222	10227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224985724
127	NC_012204	ATC	2	6	10299	10304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224985724
128	NC_012204	AAT	2	6	10315	10320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224985724
129	NC_012204	TTC	2	6	10465	10470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224985725
130	NC_012204	AAC	2	6	11117	11122	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224985727
131	NC_012204	TAT	2	6	11222	11227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224985727
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.