MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_lp36

Total Repeats: 45

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012204	AT	3	6	69	74	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012204	TA	3	6	250	255	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012204	GT	3	6	596	601	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012204	AT	4	8	1533	1540	50 %	50 %	0 %	0 %	224985709
5	NC_012204	CT	3	6	1638	1643	0 %	50 %	0 %	50 %	224985710
6	NC_012204	TA	3	6	1780	1785	50 %	50 %	0 %	0 %	224985710
7	NC_012204	AT	3	6	2748	2753	50 %	50 %	0 %	0 %	224985712
8	NC_012204	AT	3	6	2810	2815	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012204	AT	3	6	2868	2873	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012204	AT	3	6	3020	3025	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012204	AG	3	6	3054	3059	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012204	AT	4	8	3900	3907	50 %	50 %	0 %	0 %	224985713
13	NC_012204	CT	3	6	4005	4010	0 %	50 %	0 %	50 %	224985714
14	NC_012204	TA	3	6	4147	4152	50 %	50 %	0 %	0 %	224985714
15	NC_012204	AT	3	6	5167	5172	50 %	50 %	0 %	0 %	224985715
16	NC_012204	AT	3	6	5225	5230	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012204	CT	3	6	5495	5500	0 %	50 %	0 %	50 %	224985716
18	NC_012204	AT	5	10	7655	7664	50 %	50 %	0 %	0 %	224985720
19	NC_012204	CT	3	6	7716	7721	0 %	50 %	0 %	50 %	224985720
20	NC_012204	GA	3	6	9155	9160	50 %	0 %	50 %	0 %	224985722
21	NC_012204	TA	3	6	10455	10460	50 %	50 %	0 %	0 %	224985725
22	NC_012204	AT	3	6	10665	10670	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012204	TC	3	6	10826	10831	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_012204	AT	3	6	12276	12281	50 %	50 %	0 %	0 %	224985728
25	NC_012204	CA	3	6	12282	12287	50 %	0 %	0 %	50 %	224985728
26	NC_012204	TA	3	6	12907	12912	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012204	TA	3	6	13213	13218	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012204	GT	3	6	13383	13388	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012204	AT	3	6	13424	13429	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012204	TA	3	6	14778	14783	50 %	50 %	0 %	0 %	224985730
31	NC_012204	AG	3	6	14862	14867	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012204	TA	4	8	14911	14918	50 %	50 %	0 %	0 %	224985731
33	NC_012204	AT	3	6	15956	15961	50 %	50 %	0 %	0 %	224985733
34	NC_012204	AC	3	6	16367	16372	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_012204	AT	3	6	17289	17294	50 %	50 %	0 %	0 %	224985735
36	NC_012204	AT	3	6	17761	17766	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012204	AT	3	6	17941	17946	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012204	AT	3	6	18414	18419	50 %	50 %	0 %	0 %	224985736
39	NC_012204	TA	4	8	18577	18584	50 %	50 %	0 %	0 %	224985736
40	NC_012204	TA	3	6	18735	18740	50 %	50 %	0 %	0 %	224985736
41	NC_012204	AT	3	6	18748	18753	50 %	50 %	0 %	0 %	224985736
42	NC_012204	AT	3	6	19810	19815	50 %	50 %	0 %	0 %	224985738
43	NC_012204	AT	3	6	20272	20277	50 %	50 %	0 %	0 %	224985738
44	NC_012204	TA	3	6	20551	20556	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012204	AT	3	6	22894	22899	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.