MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_lp36

Total Repeats: 187

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012204	A	6	6	45	50	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012204	A	7	7	97	103	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012204	A	7	7	899	905	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012204	A	6	6	1174	1179	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012204	G	6	6	1382	1387	0 %	0 %	100 %	0 %	224985709
6	NC_012204	A	6	6	1541	1546	100 %	0 %	0 %	0 %	224985709
7	NC_012204	T	6	6	1700	1705	0 %	100 %	0 %	0 %	224985710
8	NC_012204	T	7	7	1882	1888	0 %	100 %	0 %	0 %	224985711
9	NC_012204	A	6	6	1917	1922	100 %	0 %	0 %	0 %	224985711
10	NC_012204	A	8	8	1968	1975	100 %	0 %	0 %	0 %	224985711
11	NC_012204	A	7	7	2046	2052	100 %	0 %	0 %	0 %	224985711
12	NC_012204	A	7	7	2442	2448	100 %	0 %	0 %	0 %	224985712
13	NC_012204	A	6	6	2794	2799	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012204	T	6	6	3025	3030	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012204	A	6	6	3287	3292	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012204	A	6	6	3908	3913	100 %	0 %	0 %	0 %	224985713
17	NC_012204	T	6	6	4067	4072	0 %	100 %	0 %	0 %	224985714
18	NC_012204	T	7	7	4249	4255	0 %	100 %	0 %	0 %	224985715
19	NC_012204	A	6	6	4284	4289	100 %	0 %	0 %	0 %	224985715
20	NC_012204	A	8	8	4335	4342	100 %	0 %	0 %	0 %	224985715
21	NC_012204	A	7	7	4413	4419	100 %	0 %	0 %	0 %	224985715
22	NC_012204	A	6	6	5057	5062	100 %	0 %	0 %	0 %	224985715
23	NC_012204	A	6	6	5151	5156	100 %	0 %	0 %	0 %	224985715
24	NC_012204	T	6	6	5382	5387	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012204	A	6	6	6648	6653	100 %	0 %	0 %	0 %	224985719
26	NC_012204	T	6	6	6905	6910	0 %	100 %	0 %	0 %	224985719
27	NC_012204	T	6	6	7388	7393	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012204	A	6	6	7600	7605	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012204	T	7	7	7739	7745	0 %	100 %	0 %	0 %	224985720
30	NC_012204	T	6	6	8019	8024	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012204	A	6	6	8161	8166	100 %	0 %	0 %	0 %	224985721
32	NC_012204	A	6	6	8405	8410	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012204	A	7	7	8429	8435	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012204	A	6	6	8850	8855	100 %	0 %	0 %	0 %	224985722
35	NC_012204	A	6	6	8999	9004	100 %	0 %	0 %	0 %	224985722
36	NC_012204	A	6	6	9193	9198	100 %	0 %	0 %	0 %	224985722
37	NC_012204	A	7	7	9395	9401	100 %	0 %	0 %	0 %	224985722
38	NC_012204	A	6	6	9411	9416	100 %	0 %	0 %	0 %	224985722
39	NC_012204	A	7	7	9479	9485	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012204	A	7	7	9530	9536	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012204	A	6	6	10109	10114	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012204	T	7	7	10166	10172	0 %	100 %	0 %	0 %	224985724
43	NC_012204	T	6	6	10193	10198	0 %	100 %	0 %	0 %	224985724
44	NC_012204	T	7	7	10235	10241	0 %	100 %	0 %	0 %	224985724
45	NC_012204	T	6	6	10257	10262	0 %	100 %	0 %	0 %	224985724
46	NC_012204	T	7	7	10278	10284	0 %	100 %	0 %	0 %	224985724
47	NC_012204	T	6	6	10394	10399	0 %	100 %	0 %	0 %	224985725
48	NC_012204	T	7	7	10590	10596	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012204	A	6	6	10600	10605	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012204	A	6	6	10637	10642	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012204	T	6	6	10710	10715	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012204	A	7	7	10759	10765	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012204	T	9	9	10995	11003	0 %	100 %	0 %	0 %	224985726
54	NC_012204	A	6	6	11195	11200	100 %	0 %	0 %	0 %	224985727
55	NC_012204	A	7	7	11389	11395	100 %	0 %	0 %	0 %	224985727
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58	NC_012204	A	7	7	11587	11593	100 %	0 %	0 %	0 %	224985727
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60	NC_012204	A	7	7	11621	11627	100 %	0 %	0 %	0 %	224985727
61	NC_012204	A	8	8	11689	11696	100 %	0 %	0 %	0 %	224985727
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63	NC_012204	A	8	8	11767	11774	100 %	0 %	0 %	0 %	224985727
64	NC_012204	A	7	7	11950	11956	100 %	0 %	0 %	0 %	224985727
65	NC_012204	A	7	7	12022	12028	100 %	0 %	0 %	0 %	224985727
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67	NC_012204	A	6	6	12142	12147	100 %	0 %	0 %	0 %	224985727
68	NC_012204	A	6	6	12149	12154	100 %	0 %	0 %	0 %	224985727
69	NC_012204	A	6	6	12231	12236	100 %	0 %	0 %	0 %	224985728
70	NC_012204	A	8	8	12327	12334	100 %	0 %	0 %	0 %	224985728
71	NC_012204	A	6	6	12399	12404	100 %	0 %	0 %	0 %	224985728
72	NC_012204	T	6	6	12427	12432	0 %	100 %	0 %	0 %	224985728
73	NC_012204	A	6	6	12452	12457	100 %	0 %	0 %	0 %	224985728
74	NC_012204	A	6	6	12489	12494	100 %	0 %	0 %	0 %	224985728
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80	NC_012204	A	7	7	13218	13224	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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90	NC_012204	A	8	8	13912	13919	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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110	NC_012204	T	6	6	16431	16436	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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112	NC_012204	T	6	6	16481	16486	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_012204	A	6	6	16586	16591	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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119	NC_012204	A	6	6	17077	17082	100 %	0 %	0 %	0 %	224985735
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135	NC_012204	A	6	6	18522	18527	100 %	0 %	0 %	0 %	224985736
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.