MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_lp28-3

Total Repeats: 45

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012185	AACCCA	2	12	335	346	50 %	0 %	0 %	50 %	224984640
2	NC_012185	ATCTTA	2	12	2087	2098	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_012185	GGATAT	2	12	4164	4175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012185	TTACTT	2	12	4948	4959	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_012185	TTTTCT	2	12	7380	7391	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_012185	TTTTTG	2	12	9387	9398	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	224984648
7	NC_012185	AATTAT	2	12	9628	9639	50 %	50 %	0 %	0 %	224984649
8	NC_012185	TAAAAA	2	12	10109	10120	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012185	ATATTA	2	12	12370	12381	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012185	TAATTT	2	12	18421	18432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984662
11	NC_012185	TCTTTA	2	12	19751	19762	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_012185	ATTTTC	2	12	20131	20142	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	224984665
13	NC_012185	TTAGAT	2	12	25540	25551	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	224984674
14	NC_012185	TTTTAA	2	12	26798	26809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984676
15	NC_012185	GTTTTT	2	12	26810	26821	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	224984676
16	NC_012185	TAGAAA	2	12	26931	26942	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012185	TTGATT	2	12	28462	28473	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012185	ATTCTA	2	12	28854	28865	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_012185	TCTTTT	2	12	31070	31081	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	224984685
20	NC_012185	TTACTT	2	12	31693	31704	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_012185	TAAAAA	2	12	31864	31875	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012185	TTTAAA	2	12	32367	32378	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012185	TAAAAC	2	12	34127	34138	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	224984691
24	NC_012185	ATCACC	2	12	39643	39654	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	224984708
25	NC_012185	ATTTTT	2	12	45166	45177	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	224984722
26	NC_012185	TCCTTA	2	12	45894	45905	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	224984724
27	NC_012185	TTTTCT	2	12	48559	48570	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	224984730
28	NC_012185	AGCATT	2	12	48983	48994	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	224984731
29	NC_012185	TAATTT	2	12	49890	49901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012185	TTCTTT	2	12	50696	50707	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	224984733
31	NC_012185	ATAAAA	2	12	53358	53369	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012185	TATTTT	2	12	56449	56460	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	224984741
33	NC_012185	TTTAAT	2	12	56810	56821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012185	CAAAGG	2	12	58384	58395	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	224984743
35	NC_012185	TTTCCA	2	12	62421	62432	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	224984748
36	NC_012185	GATAAT	2	12	66228	66239	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012185	AAATGA	2	12	68045	68056	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	224984756
38	NC_012185	AAAGAA	3	18	68496	68513	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	224984757
39	NC_012185	AATATC	2	12	70149	70160	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	224984760
40	NC_012185	GAATTA	2	12	72165	72176	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	224984765
41	NC_012185	TTTAAT	2	12	73328	73339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012185	ATATAA	2	12	76181	76192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984770
43	NC_012185	TTAAAA	5	30	76792	76821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984771
44	NC_012185	TAAAAA	2	12	76911	76922	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	224984772
45	NC_012185	GATAAT	2	12	80557	80568	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.