MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_lp28-3

Total Repeats: 19

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012185	ATCTTA	2	12	2087	2098	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_012185	GGATAT	2	12	4164	4175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012185	TTACTT	2	12	4948	4959	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_012185	TTTTCT	2	12	7380	7391	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_012185	TAAAAA	2	12	10109	10120	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012185	ATATTA	2	12	12370	12381	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012185	TCTTTA	2	12	19751	19762	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_012185	TAGAAA	2	12	26931	26942	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012185	TTGATT	2	12	28462	28473	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012185	ATTCTA	2	12	28854	28865	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_012185	TTACTT	2	12	31693	31704	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_012185	TAAAAA	2	12	31864	31875	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012185	TTTAAA	2	12	32367	32378	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012185	TAATTT	2	12	49890	49901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012185	ATAAAA	2	12	53358	53369	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012185	TTTAAT	2	12	56810	56821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012185	GATAAT	2	12	66228	66239	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012185	TTTAAT	2	12	73328	73339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012185	GATAAT	2	12	80557	80568	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.