MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_lp28-3

Total Repeats: 26

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012185	AACCCA	2	12	335	346	50 %	0 %	0 %	50 %	224984640
2	NC_012185	TTTTTG	2	12	9387	9398	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	224984648
3	NC_012185	AATTAT	2	12	9628	9639	50 %	50 %	0 %	0 %	224984649
4	NC_012185	TAATTT	2	12	18421	18432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984662
5	NC_012185	ATTTTC	2	12	20131	20142	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	224984665
6	NC_012185	TTAGAT	2	12	25540	25551	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	224984674
7	NC_012185	TTTTAA	2	12	26798	26809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984676
8	NC_012185	GTTTTT	2	12	26810	26821	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	224984676
9	NC_012185	TCTTTT	2	12	31070	31081	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	224984685
10	NC_012185	TAAAAC	2	12	34127	34138	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	224984691
11	NC_012185	ATCACC	2	12	39643	39654	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	224984708
12	NC_012185	ATTTTT	2	12	45166	45177	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	224984722
13	NC_012185	TCCTTA	2	12	45894	45905	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	224984724
14	NC_012185	TTTTCT	2	12	48559	48570	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	224984730
15	NC_012185	AGCATT	2	12	48983	48994	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	224984731
16	NC_012185	TTCTTT	2	12	50696	50707	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	224984733
17	NC_012185	TATTTT	2	12	56449	56460	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	224984741
18	NC_012185	CAAAGG	2	12	58384	58395	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	224984743
19	NC_012185	TTTCCA	2	12	62421	62432	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	224984748
20	NC_012185	AAATGA	2	12	68045	68056	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	224984756
21	NC_012185	AAAGAA	3	18	68496	68513	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	224984757
22	NC_012185	AATATC	2	12	70149	70160	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	224984760
23	NC_012185	GAATTA	2	12	72165	72176	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	224984765
24	NC_012185	ATATAA	2	12	76181	76192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984770
25	NC_012185	TTAAAA	5	30	76792	76821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984771
26	NC_012185	TAAAAA	2	12	76911	76922	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	224984772

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.