MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_lp28-3

Total Repeats: 298

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012185	TTTA	2	8	61	68	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012185	ATGT	2	8	102	109	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012185	TTGA	2	8	311	318	25 %	50 %	25 %	0 %	224984640
4	NC_012185	TAAA	2	8	393	400	75 %	25 %	0 %	0 %	224984640
5	NC_012185	ATTA	2	8	421	428	50 %	50 %	0 %	0 %	224984640
6	NC_012185	GTAA	2	8	1388	1395	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012185	TAAT	2	8	1489	1496	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012185	TAAA	2	8	1639	1646	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012185	AAAT	2	8	1739	1746	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012185	TAGA	2	8	2007	2014	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012185	TAAT	2	8	2099	2106	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012185	TATC	2	8	2314	2321	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_012185	TAAT	2	8	2837	2844	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012185	AAAT	2	8	3512	3519	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012185	AAAC	2	8	3719	3726	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_012185	TATT	2	8	3921	3928	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012185	TTAT	2	8	4494	4501	25 %	75 %	0 %	0 %	224984642
18	NC_012185	TTTA	2	8	4526	4533	25 %	75 %	0 %	0 %	224984642
19	NC_012185	CTTT	2	8	5330	5337	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_012185	ATCA	2	8	5672	5679	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_012185	ATTA	2	8	5780	5787	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012185	ATTA	2	8	5791	5798	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012185	TAAA	2	8	6755	6762	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012185	TTTA	2	8	6770	6777	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012185	TTGT	2	8	6912	6919	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012185	ATTA	2	8	7354	7361	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012185	CATC	2	8	7607	7614	25 %	25 %	0 %	50 %	224984646
28	NC_012185	GTTT	2	8	7725	7732	0 %	75 %	25 %	0 %	224984646
29	NC_012185	TAAT	2	8	7991	7998	50 %	50 %	0 %	0 %	224984646
30	NC_012185	TTTA	2	8	8257	8264	25 %	75 %	0 %	0 %	224984647
31	NC_012185	TACT	2	8	8307	8314	25 %	50 %	0 %	25 %	224984647
32	NC_012185	ATAG	2	8	8579	8586	50 %	25 %	25 %	0 %	224984647
33	NC_012185	TTGA	2	8	9254	9261	25 %	50 %	25 %	0 %	224984648
34	NC_012185	CATT	2	8	9285	9292	25 %	50 %	0 %	25 %	224984648
35	NC_012185	TAAT	2	8	9583	9590	50 %	50 %	0 %	0 %	224984649
36	NC_012185	TTTA	2	8	9662	9669	25 %	75 %	0 %	0 %	224984649
37	NC_012185	CTTT	2	8	9696	9703	0 %	75 %	0 %	25 %	224984649
38	NC_012185	GTAA	2	8	10600	10607	50 %	25 %	25 %	0 %	224984651
39	NC_012185	ATTA	2	8	11365	11372	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012185	AAAT	2	8	11559	11566	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012185	ATTT	2	8	11599	11606	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012185	TTTA	2	8	11618	11625	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012185	ATAA	2	8	11733	11740	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012185	TTAT	2	8	11750	11757	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012185	GGAG	2	8	12449	12456	25 %	0 %	75 %	0 %	224984653
46	NC_012185	AAAC	2	8	12602	12609	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_012185	TATT	2	8	12797	12804	25 %	75 %	0 %	0 %	224984654
48	NC_012185	TTTA	2	8	12893	12900	25 %	75 %	0 %	0 %	224984654
49	NC_012185	AATT	2	8	13291	13298	50 %	50 %	0 %	0 %	224984654
50	NC_012185	TTAT	2	8	13470	13477	25 %	75 %	0 %	0 %	224984654
51	NC_012185	AGAT	2	8	14232	14239	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012185	TTAT	2	8	14563	14570	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012185	ATTA	2	8	14586	14593	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012185	TTAA	2	8	14595	14602	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012185	AATT	2	8	14765	14772	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012185	ACAA	2	8	14847	14854	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_012185	AAAC	2	8	15393	15400	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_012185	ATTT	2	8	15972	15979	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012185	TTTA	2	8	16001	16008	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012185	TAAT	2	8	16270	16277	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012185	TTTA	2	8	16278	16285	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012185	TTTA	2	8	16397	16404	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012185	AAAT	2	8	16478	16485	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012185	TAAT	2	8	16714	16721	50 %	50 %	0 %	0 %	224984661
65	NC_012185	CTTG	2	8	16897	16904	0 %	50 %	25 %	25 %	224984661
66	NC_012185	ATTT	2	8	17125	17132	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012185	GTTT	2	8	17362	17369	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012185	ACTA	2	8	17573	17580	50 %	25 %	0 %	25 %	224984662
69	NC_012185	TTAT	2	8	18147	18154	25 %	75 %	0 %	0 %	224984662
70	NC_012185	TTTA	2	8	18190	18197	25 %	75 %	0 %	0 %	224984662
71	NC_012185	GCAA	2	8	18203	18210	50 %	0 %	25 %	25 %	224984662
72	NC_012185	TATT	2	8	18434	18441	25 %	75 %	0 %	0 %	224984662
73	NC_012185	TAAA	2	8	18753	18760	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012185	ATTA	2	8	18761	18768	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012185	ATAA	2	8	18946	18953	75 %	25 %	0 %	0 %	224984663
76	NC_012185	AAAG	2	8	19430	19437	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012185	TTAA	2	8	19497	19504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012185	CTTT	2	8	19844	19851	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_012185	TTGC	2	8	20361	20368	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_012185	ATTG	2	8	20401	20408	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012185	TATC	2	8	20440	20447	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_012185	CTTT	2	8	20463	20470	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_012185	ATTT	2	8	20630	20637	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012185	TTAA	2	8	21413	21420	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012185	CTTT	2	8	21565	21572	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_012185	AGTA	2	8	22333	22340	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_012185	CGGA	2	8	22390	22397	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
88	NC_012185	TAAT	2	8	22903	22910	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_012185	ATTA	2	8	23115	23122	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_012185	AAAC	2	8	23224	23231	75 %	0 %	0 %	25 %	224984671
91	NC_012185	TAAA	2	8	23283	23290	75 %	25 %	0 %	0 %	224984671
92	NC_012185	AGAA	2	8	23485	23492	75 %	0 %	25 %	0 %	224984671
93	NC_012185	ATTG	2	8	23572	23579	25 %	50 %	25 %	0 %	224984671
94	NC_012185	TTAA	2	8	23609	23616	50 %	50 %	0 %	0 %	224984671
95	NC_012185	ATGG	2	8	24364	24371	25 %	25 %	50 %	0 %	224984672
96	NC_012185	AATG	2	8	24854	24861	50 %	25 %	25 %	0 %	224984673
97	NC_012185	ACGA	2	8	25305	25312	50 %	0 %	25 %	25 %	224984673
98	NC_012185	TTTC	2	8	26233	26240	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_012185	AGTA	2	8	26492	26499	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_012185	ATAA	3	12	26543	26554	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_012185	ATTT	2	8	26665	26672	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_012185	AATT	2	8	26704	26711	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_012185	AGAT	2	8	26968	26975	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_012185	GATT	2	8	27267	27274	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_012185	AAAG	2	8	27354	27361	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_012185	AATT	2	8	27965	27972	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_012185	ATTT	2	8	28010	28017	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_012185	TTAT	2	8	28321	28328	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_012185	TTTA	2	8	28552	28559	25 %	75 %	0 %	0 %	224984679
110	NC_012185	TGTT	2	8	28578	28585	0 %	75 %	25 %	0 %	224984679
111	NC_012185	TTTA	2	8	28761	28768	25 %	75 %	0 %	0 %	224984680
112	NC_012185	ATTA	2	8	29205	29212	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_012185	CACT	2	8	29387	29394	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_012185	GTTA	2	8	29556	29563	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_012185	GGAT	2	8	30514	30521	25 %	25 %	50 %	0 %	224984684
116	NC_012185	CAAC	2	8	30576	30583	50 %	0 %	0 %	50 %	224984684
117	NC_012185	TTGT	2	8	30590	30597	0 %	75 %	25 %	0 %	224984684
118	NC_012185	ACTT	2	8	31174	31181	25 %	50 %	0 %	25 %	224984685
119	NC_012185	CTTA	2	8	31219	31226	25 %	50 %	0 %	25 %	224984685
120	NC_012185	TAAA	2	8	31374	31381	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_012185	TTAA	2	8	31431	31438	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012185	TCTT	2	8	31545	31552	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_012185	TACT	2	8	31581	31588	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_012185	TAAA	2	8	31764	31771	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_012185	AAAC	2	8	31955	31962	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_012185	ATCT	2	8	33082	33089	25 %	50 %	0 %	25 %	224984688
127	NC_012185	TATT	2	8	33165	33172	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_012185	TTTA	2	8	33245	33252	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_012185	TACT	2	8	33678	33685	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_012185	CCAT	2	8	33794	33801	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_012185	TTTA	2	8	34016	34023	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_012185	AATT	2	8	34465	34472	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_012185	TAAA	2	8	34624	34631	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_012185	ATAA	2	8	34754	34761	75 %	25 %	0 %	0 %	224984692
135	NC_012185	TTTC	2	8	34847	34854	0 %	75 %	0 %	25 %	224984692
136	NC_012185	ATCA	2	8	34858	34865	50 %	25 %	0 %	25 %	224984692
137	NC_012185	ATTG	2	8	36148	36155	25 %	50 %	25 %	0 %	224984695
138	NC_012185	CTTT	2	8	36854	36861	0 %	75 %	0 %	25 %	224984699
139	NC_012185	CTTT	2	8	37163	37170	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_012185	AATT	2	8	37180	37187	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_012185	TACC	2	8	38244	38251	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_012185	AGAT	2	8	38745	38752	50 %	25 %	25 %	0 %	224984705
143	NC_012185	ATTA	2	8	38818	38825	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_012185	AGCA	2	8	38929	38936	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_012185	TCAA	2	8	38945	38952	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_012185	AATT	2	8	39096	39103	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_012185	AGTT	2	8	39500	39507	25 %	50 %	25 %	0 %	224984707
148	NC_012185	TATT	2	8	39659	39666	25 %	75 %	0 %	0 %	224984708
149	NC_012185	CAAT	2	8	39713	39720	50 %	25 %	0 %	25 %	224984708
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151	NC_012185	GATA	2	8	40374	40381	50 %	25 %	25 %	0 %	224984711
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297	NC_012185	ATTT	2	8	81664	81671	25 %	75 %	0 %	0 %	224984781
298	NC_012185	AGAA	2	8	81741	81748	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.