MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_lp28-3

Total Repeats: 132

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012185	TTGA	2	8	311	318	25 %	50 %	25 %	0 %	224984640
2	NC_012185	TAAA	2	8	393	400	75 %	25 %	0 %	0 %	224984640
3	NC_012185	ATTA	2	8	421	428	50 %	50 %	0 %	0 %	224984640
4	NC_012185	TTAT	2	8	4494	4501	25 %	75 %	0 %	0 %	224984642
5	NC_012185	TTTA	2	8	4526	4533	25 %	75 %	0 %	0 %	224984642
6	NC_012185	CATC	2	8	7607	7614	25 %	25 %	0 %	50 %	224984646
7	NC_012185	GTTT	2	8	7725	7732	0 %	75 %	25 %	0 %	224984646
8	NC_012185	TAAT	2	8	7991	7998	50 %	50 %	0 %	0 %	224984646
9	NC_012185	TTTA	2	8	8257	8264	25 %	75 %	0 %	0 %	224984647
10	NC_012185	TACT	2	8	8307	8314	25 %	50 %	0 %	25 %	224984647
11	NC_012185	ATAG	2	8	8579	8586	50 %	25 %	25 %	0 %	224984647
12	NC_012185	TTGA	2	8	9254	9261	25 %	50 %	25 %	0 %	224984648
13	NC_012185	CATT	2	8	9285	9292	25 %	50 %	0 %	25 %	224984648
14	NC_012185	TAAT	2	8	9583	9590	50 %	50 %	0 %	0 %	224984649
15	NC_012185	TTTA	2	8	9662	9669	25 %	75 %	0 %	0 %	224984649
16	NC_012185	CTTT	2	8	9696	9703	0 %	75 %	0 %	25 %	224984649
17	NC_012185	GTAA	2	8	10600	10607	50 %	25 %	25 %	0 %	224984651
18	NC_012185	GGAG	2	8	12449	12456	25 %	0 %	75 %	0 %	224984653
19	NC_012185	TATT	2	8	12797	12804	25 %	75 %	0 %	0 %	224984654
20	NC_012185	TTTA	2	8	12893	12900	25 %	75 %	0 %	0 %	224984654
21	NC_012185	AATT	2	8	13291	13298	50 %	50 %	0 %	0 %	224984654
22	NC_012185	TTAT	2	8	13470	13477	25 %	75 %	0 %	0 %	224984654
23	NC_012185	TAAT	2	8	16714	16721	50 %	50 %	0 %	0 %	224984661
24	NC_012185	CTTG	2	8	16897	16904	0 %	50 %	25 %	25 %	224984661
25	NC_012185	ACTA	2	8	17573	17580	50 %	25 %	0 %	25 %	224984662
26	NC_012185	TTAT	2	8	18147	18154	25 %	75 %	0 %	0 %	224984662
27	NC_012185	TTTA	2	8	18190	18197	25 %	75 %	0 %	0 %	224984662
28	NC_012185	GCAA	2	8	18203	18210	50 %	0 %	25 %	25 %	224984662
29	NC_012185	TATT	2	8	18434	18441	25 %	75 %	0 %	0 %	224984662
30	NC_012185	ATAA	2	8	18946	18953	75 %	25 %	0 %	0 %	224984663
31	NC_012185	AAAC	2	8	23224	23231	75 %	0 %	0 %	25 %	224984671
32	NC_012185	TAAA	2	8	23283	23290	75 %	25 %	0 %	0 %	224984671
33	NC_012185	AGAA	2	8	23485	23492	75 %	0 %	25 %	0 %	224984671
34	NC_012185	ATTG	2	8	23572	23579	25 %	50 %	25 %	0 %	224984671
35	NC_012185	TTAA	2	8	23609	23616	50 %	50 %	0 %	0 %	224984671
36	NC_012185	ATGG	2	8	24364	24371	25 %	25 %	50 %	0 %	224984672
37	NC_012185	AATG	2	8	24854	24861	50 %	25 %	25 %	0 %	224984673
38	NC_012185	ACGA	2	8	25305	25312	50 %	0 %	25 %	25 %	224984673
39	NC_012185	TTTA	2	8	28552	28559	25 %	75 %	0 %	0 %	224984679
40	NC_012185	TGTT	2	8	28578	28585	0 %	75 %	25 %	0 %	224984679
41	NC_012185	TTTA	2	8	28761	28768	25 %	75 %	0 %	0 %	224984680
42	NC_012185	GGAT	2	8	30514	30521	25 %	25 %	50 %	0 %	224984684
43	NC_012185	CAAC	2	8	30576	30583	50 %	0 %	0 %	50 %	224984684
44	NC_012185	TTGT	2	8	30590	30597	0 %	75 %	25 %	0 %	224984684
45	NC_012185	ACTT	2	8	31174	31181	25 %	50 %	0 %	25 %	224984685
46	NC_012185	CTTA	2	8	31219	31226	25 %	50 %	0 %	25 %	224984685
47	NC_012185	ATCT	2	8	33082	33089	25 %	50 %	0 %	25 %	224984688
48	NC_012185	ATAA	2	8	34754	34761	75 %	25 %	0 %	0 %	224984692
49	NC_012185	TTTC	2	8	34847	34854	0 %	75 %	0 %	25 %	224984692
50	NC_012185	ATCA	2	8	34858	34865	50 %	25 %	0 %	25 %	224984692
51	NC_012185	ATTG	2	8	36148	36155	25 %	50 %	25 %	0 %	224984695
52	NC_012185	CTTT	2	8	36854	36861	0 %	75 %	0 %	25 %	224984699
53	NC_012185	AGAT	2	8	38745	38752	50 %	25 %	25 %	0 %	224984705
54	NC_012185	AGTT	2	8	39500	39507	25 %	50 %	25 %	0 %	224984707
55	NC_012185	TATT	2	8	39659	39666	25 %	75 %	0 %	0 %	224984708
56	NC_012185	CAAT	2	8	39713	39720	50 %	25 %	0 %	25 %	224984708
57	NC_012185	TTTA	2	8	40094	40101	25 %	75 %	0 %	0 %	224984710
58	NC_012185	GATA	2	8	40374	40381	50 %	25 %	25 %	0 %	224984711
59	NC_012185	TATC	2	8	40603	40610	25 %	50 %	0 %	25 %	224984712
60	NC_012185	CATG	2	8	41286	41293	25 %	25 %	25 %	25 %	224984713
61	NC_012185	GTTA	2	8	41530	41537	25 %	50 %	25 %	0 %	224984714
62	NC_012185	TTTG	2	8	42964	42971	0 %	75 %	25 %	0 %	224984717
63	NC_012185	AAAT	2	8	43241	43248	75 %	25 %	0 %	0 %	224984718
64	NC_012185	AGCA	2	8	44783	44790	50 %	0 %	25 %	25 %	224984722
65	NC_012185	CTTT	2	8	45137	45144	0 %	75 %	0 %	25 %	224984722
66	NC_012185	ATAA	2	8	45912	45919	75 %	25 %	0 %	0 %	224984724
67	NC_012185	CTAT	2	8	46076	46083	25 %	50 %	0 %	25 %	224984725
68	NC_012185	AATT	2	8	46656	46663	50 %	50 %	0 %	0 %	224984726
69	NC_012185	TTTA	2	8	46716	46723	25 %	75 %	0 %	0 %	224984726
70	NC_012185	GTAA	2	8	47715	47722	50 %	25 %	25 %	0 %	224984730
71	NC_012185	GTAA	2	8	47958	47965	50 %	25 %	25 %	0 %	224984730
72	NC_012185	AGAT	2	8	47988	47995	50 %	25 %	25 %	0 %	224984730
73	NC_012185	CTTG	2	8	48154	48161	0 %	50 %	25 %	25 %	224984730
74	NC_012185	CTTT	2	8	48229	48236	0 %	75 %	0 %	25 %	224984730
75	NC_012185	ATTT	2	8	53797	53804	25 %	75 %	0 %	0 %	224984739
76	NC_012185	GAAG	2	8	55426	55433	50 %	0 %	50 %	0 %	224984740
77	NC_012185	TAAG	2	8	55604	55611	50 %	25 %	25 %	0 %	224984740
78	NC_012185	AAAG	2	8	55846	55853	75 %	0 %	25 %	0 %	224984740
79	NC_012185	ATAA	2	8	56092	56099	75 %	25 %	0 %	0 %	224984741
80	NC_012185	TAAT	2	8	56288	56295	50 %	50 %	0 %	0 %	224984741
81	NC_012185	AATT	2	8	56327	56334	50 %	50 %	0 %	0 %	224984741
82	NC_012185	GTTT	2	8	57147	57154	0 %	75 %	25 %	0 %	224984742
83	NC_012185	TCTT	2	8	57379	57386	0 %	75 %	0 %	25 %	224984742
84	NC_012185	ATGA	2	8	58162	58169	50 %	25 %	25 %	0 %	224984743
85	NC_012185	TTTA	2	8	58182	58189	25 %	75 %	0 %	0 %	224984743
86	NC_012185	GAAA	2	8	58798	58805	75 %	0 %	25 %	0 %	224984744
87	NC_012185	ATGT	2	8	59750	59757	25 %	50 %	25 %	0 %	224984744
88	NC_012185	TCAA	2	8	60275	60282	50 %	25 %	0 %	25 %	224984745
89	NC_012185	AATC	2	8	60289	60296	50 %	25 %	0 %	25 %	224984745
90	NC_012185	AAAG	2	8	61055	61062	75 %	0 %	25 %	0 %	224984746
91	NC_012185	AGCA	2	8	61908	61915	50 %	0 %	25 %	25 %	224984747
92	NC_012185	CTTC	2	8	62004	62011	0 %	50 %	0 %	50 %	224984748
93	NC_012185	AATT	2	8	62718	62725	50 %	50 %	0 %	0 %	224984749
94	NC_012185	CAAA	2	8	62798	62805	75 %	0 %	0 %	25 %	224984749
95	NC_012185	AATG	2	8	64214	64221	50 %	25 %	25 %	0 %	224984750
96	NC_012185	ATTA	2	8	65994	66001	50 %	50 %	0 %	0 %	224984754
97	NC_012185	ATAA	2	8	66584	66591	75 %	25 %	0 %	0 %	224984755
98	NC_012185	AAAG	2	8	67992	67999	75 %	0 %	25 %	0 %	224984756
99	NC_012185	AGAA	2	8	68069	68076	75 %	0 %	25 %	0 %	224984756
100	NC_012185	GCAA	2	8	68094	68101	50 %	0 %	25 %	25 %	224984756
101	NC_012185	TATT	2	8	68209	68216	25 %	75 %	0 %	0 %	224984756
102	NC_012185	TAGC	2	8	68527	68534	25 %	25 %	25 %	25 %	224984757
103	NC_012185	GTTT	2	8	70364	70371	0 %	75 %	25 %	0 %	224984760
104	NC_012185	GCAG	2	8	70527	70534	25 %	0 %	50 %	25 %	224984760
105	NC_012185	ATTT	2	8	70718	70725	25 %	75 %	0 %	0 %	224984761
106	NC_012185	TATT	2	8	70748	70755	25 %	75 %	0 %	0 %	224984761
107	NC_012185	CTTG	3	12	70837	70848	0 %	50 %	25 %	25 %	224984761
108	NC_012185	ATAG	2	8	71065	71072	50 %	25 %	25 %	0 %	224984762
109	NC_012185	TTGA	2	8	72072	72079	25 %	50 %	25 %	0 %	224984765
110	NC_012185	GTAT	2	8	72119	72126	25 %	50 %	25 %	0 %	224984765
111	NC_012185	GAAG	2	8	74919	74926	50 %	0 %	50 %	0 %	224984768
112	NC_012185	AAGA	2	8	75091	75098	75 %	0 %	25 %	0 %	224984768
113	NC_012185	AATT	2	8	75254	75261	50 %	50 %	0 %	0 %	224984768
114	NC_012185	ATAA	2	8	76028	76035	75 %	25 %	0 %	0 %	224984769
115	NC_012185	AAAT	2	8	76076	76083	75 %	25 %	0 %	0 %	224984769
116	NC_012185	CAAA	2	8	76433	76440	75 %	0 %	0 %	25 %	224984770
117	NC_012185	TATT	2	8	76663	76670	25 %	75 %	0 %	0 %	224984771
118	NC_012185	AATA	2	8	76680	76687	75 %	25 %	0 %	0 %	224984771
119	NC_012185	TAAA	2	8	76738	76745	75 %	25 %	0 %	0 %	224984771
120	NC_012185	CTAA	2	8	76752	76759	50 %	25 %	0 %	25 %	224984771
121	NC_012185	AAAC	2	8	76772	76779	75 %	0 %	0 %	25 %	224984771
122	NC_012185	ATAA	2	8	77332	77339	75 %	25 %	0 %	0 %	224984773
123	NC_012185	AACA	2	8	77398	77405	75 %	0 %	0 %	25 %	224984774
124	NC_012185	CTTT	2	8	77452	77459	0 %	75 %	0 %	25 %	224984775
125	NC_012185	TTAC	2	8	77592	77599	25 %	50 %	0 %	25 %	224984775
126	NC_012185	TTCA	2	8	77720	77727	25 %	50 %	0 %	25 %	224984775
127	NC_012185	GCTT	2	8	78667	78674	0 %	50 %	25 %	25 %	224984776
128	NC_012185	ATCT	2	8	78685	78692	25 %	50 %	0 %	25 %	224984776
129	NC_012185	AGAC	2	8	81160	81167	50 %	0 %	25 %	25 %	224984779
130	NC_012185	TAAC	2	8	81285	81292	50 %	25 %	0 %	25 %	224984779
131	NC_012185	TTTG	2	8	81623	81630	0 %	75 %	25 %	0 %	224984781
132	NC_012185	ATTT	2	8	81664	81671	25 %	75 %	0 %	0 %	224984781

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.