MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_lp28-3

Total Repeats: 507

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012185	ATT	2	6	96	101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012185	GAT	2	6	156	161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012185	TTA	2	6	175	180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012185	TAT	2	6	1411	1416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012185	TAT	2	6	1438	1443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012185	TAT	2	6	1497	1502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012185	CTT	2	6	1537	1542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_012185	TTA	2	6	1559	1564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012185	TTA	2	6	1592	1597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012185	AAT	2	6	1659	1664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012185	TAA	2	6	1672	1677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012185	ATA	2	6	1753	1758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012185	AAC	2	6	1870	1875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_012185	TTA	2	6	1888	1893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012185	ATT	2	6	1911	1916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012185	AAT	2	6	1964	1969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012185	AAT	2	6	2031	2036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012185	TAA	2	6	2039	2044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012185	TAG	2	6	2074	2079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012185	TAC	2	6	2110	2115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_012185	CAA	2	6	2147	2152	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_012185	AAT	2	6	2181	2186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012185	TAA	2	6	2206	2211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012185	TAT	2	6	2225	2230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012185	CAC	2	6	2297	2302	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_012185	ATT	2	6	2323	2328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012185	CTA	2	6	2334	2339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_012185	CAT	2	6	2386	2391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_012185	ATT	2	6	2396	2401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012185	TAA	2	6	2441	2446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012185	CTT	2	6	2464	2469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_012185	TGC	2	6	2592	2597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_012185	TTA	2	6	2605	2610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012185	TTG	2	6	2614	2619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012185	TTA	2	6	2697	2702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012185	ATA	2	6	2721	2726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012185	TTA	2	6	2749	2754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012185	ACA	2	6	2763	2768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_012185	ATT	2	6	2820	2825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012185	TTA	2	6	2872	2877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012185	ATT	2	6	2901	2906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012185	TCC	2	6	2957	2962	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_012185	TTA	2	6	2993	2998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012185	TCG	2	6	3088	3093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_012185	ACT	2	6	3314	3319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_012185	TAT	2	6	3341	3346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012185	TTA	2	6	3367	3372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012185	TAA	3	9	3446	3454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012185	TAG	2	6	3459	3464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012185	ATC	2	6	3472	3477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_012185	TAT	2	6	3527	3532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012185	TTA	2	6	3575	3580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012185	TAA	2	6	3796	3801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012185	TAC	2	6	3880	3885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_012185	ATC	2	6	3933	3938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_012185	TAA	2	6	3973	3978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012185	TTA	2	6	4049	4054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012185	CAA	2	6	4087	4092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_012185	TAT	2	6	4179	4184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012185	TAT	2	6	4272	4277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012185	TTA	2	6	4298	4303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012185	GTT	2	6	4341	4346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012185	ATT	2	6	4678	4683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012185	TAT	2	6	4776	4781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012185	TAT	2	6	4799	4804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012185	TTA	2	6	4823	4828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012185	AAT	2	6	4851	4856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012185	TAT	2	6	4934	4939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012185	CCA	2	6	4984	4989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_012185	ACA	2	6	4993	4998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_012185	ATT	2	6	5218	5223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012185	TTA	2	6	5240	5245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012185	TAA	2	6	5260	5265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012185	ATA	2	6	5301	5306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012185	AAG	2	6	5338	5343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012185	TAA	3	9	5348	5356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012185	ATT	2	6	5357	5362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012185	ATT	2	6	5396	5401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012185	AAT	2	6	5419	5424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012185	AAG	2	6	5481	5486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012185	ATA	2	6	5492	5497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012185	ATT	2	6	5743	5748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012185	AAT	2	6	5760	5765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012185	AAT	2	6	5804	5809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012185	ATA	3	9	6698	6706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012185	TAT	2	6	6764	6769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_012185	ATT	2	6	6788	6793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_012185	TAA	2	6	6838	6843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_012185	GCC	2	6	6904	6909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_012185	TAT	2	6	7251	7256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_012185	TAT	2	6	7266	7271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012185	TTC	2	6	7373	7378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_012185	TGC	2	6	7445	7450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_012185	CTT	2	6	7532	7537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_012185	TAA	2	6	8126	8131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_012185	TTA	2	6	8148	8153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012185	TAA	3	9	8762	8770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_012185	GTA	2	6	8774	8779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_012185	ATC	2	6	8788	8793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_012185	ATA	2	6	8826	8831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_012185	TAT	2	6	8842	8847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_012185	TGT	2	6	8851	8856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_012185	TAT	2	6	9810	9815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_012185	ATA	2	6	9880	9885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_012185	TGA	2	6	9899	9904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_012185	ACA	2	6	10032	10037	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_012185	ATA	3	9	10061	10069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_012185	TAC	2	6	10133	10138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_012185	TAA	2	6	10197	10202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_012185	GCA	2	6	10305	10310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_012185	TAT	2	6	10349	10354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012185	ACA	2	6	10726	10731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_012185	TTA	2	6	10843	10848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012185	GTG	2	6	11006	11011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_012185	CTT	2	6	11030	11035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_012185	TAA	2	6	11115	11120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_012185	AGA	2	6	11138	11143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_012185	AAT	2	6	11169	11174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_012185	TTA	2	6	11226	11231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_012185	ATT	2	6	11297	11302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_012185	TAA	2	6	11320	11325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012185	TTA	2	6	11338	11343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_012185	AAC	2	6	11348	11353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_012185	AAT	2	6	11391	11396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_012185	ATA	2	6	11422	11427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_012185	CTT	2	6	11487	11492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_012185	CAA	2	6	11496	11501	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_012185	AAC	2	6	11513	11518	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_012185	ATC	2	6	11674	11679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_012185	AAT	2	6	11711	11716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_012185	TAC	2	6	11808	11813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_012185	ATT	2	6	11841	11846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_012185	AAT	2	6	11849	11854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_012185	ATA	2	6	11867	11872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_012185	TCA	2	6	12294	12299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_012185	ATA	2	6	12316	12321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_012185	TTA	2	6	12353	12358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_012185	TTA	2	6	12612	12617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_012185	ATG	2	6	12628	12633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_012185	ATA	2	6	12781	12786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_012185	ATT	2	6	13710	13715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_012185	ATA	2	6	13802	13807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_012185	ACT	2	6	13812	13817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_012185	TAA	2	6	13896	13901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_012185	TAT	2	6	13962	13967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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