MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_lp28-3

Total Repeats: 687

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012185	CCT	2	6	297	302	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	224984640
2	NC_012185	GAA	2	6	431	436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984640
3	NC_012185	ACA	2	6	446	451	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224984640
4	NC_012185	AGA	2	6	478	483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984640
5	NC_012185	TGA	3	9	505	513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224984640
6	NC_012185	TGC	2	6	553	558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224984640
7	NC_012185	AGT	2	6	626	631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224984640
8	NC_012185	TTG	2	6	696	701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224984640
9	NC_012185	GGC	2	6	703	708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224984640
10	NC_012185	TGA	2	6	718	723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224984640
11	NC_012185	GGT	2	6	818	823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224984640
12	NC_012185	TGA	2	6	832	837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224984640
13	NC_012185	AAG	2	6	887	892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984640
14	NC_012185	GCT	2	6	893	898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224984640
15	NC_012185	ATT	2	6	941	946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984640
16	NC_012185	GCT	3	9	947	955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224984640
17	NC_012185	GTG	3	9	969	977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224984640
18	NC_012185	TGC	3	9	1096	1104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224984640
19	NC_012185	GTG	2	6	1167	1172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224984640
20	NC_012185	TGC	2	6	1204	1209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224984640
21	NC_012185	TTA	2	6	3157	3162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984641
22	NC_012185	CTT	2	6	3235	3240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224984641
23	NC_012185	CAA	2	6	3271	3276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224984641
24	NC_012185	CAA	2	6	4367	4372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224984642
25	NC_012185	AAT	2	6	4374	4379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984642
26	NC_012185	TTA	2	6	4395	4400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984642
27	NC_012185	ATT	2	6	4406	4411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984642
28	NC_012185	ATG	2	6	4482	4487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224984642
29	NC_012185	TAA	2	6	4550	4555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984642
30	NC_012185	TAA	2	6	4574	4579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984642
31	NC_012185	TAT	2	6	4603	4608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984642
32	NC_012185	ATG	2	6	5037	5042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224984643
33	NC_012185	TTC	2	6	5071	5076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224984643
34	NC_012185	TTG	2	6	5088	5093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224984643
35	NC_012185	ATT	2	6	5121	5126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984643
36	NC_012185	TTC	2	6	5132	5137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224984643
37	NC_012185	CTA	2	6	5538	5543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224984644
38	NC_012185	ACA	2	6	5604	5609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224984644
39	NC_012185	TAA	2	6	5615	5620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984644
40	NC_012185	TAA	2	6	5927	5932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984645
41	NC_012185	AAG	2	6	6040	6045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984645
42	NC_012185	AAG	3	9	6058	6066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984645
43	NC_012185	AAG	2	6	6107	6112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984645
44	NC_012185	GAA	2	6	6162	6167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984645
45	NC_012185	TGA	2	6	6173	6178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224984645
46	NC_012185	AGA	2	6	6267	6272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984645
47	NC_012185	TAT	2	6	6490	6495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984645
48	NC_012185	AGA	2	6	6515	6520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984645
49	NC_012185	AAC	2	6	6526	6531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224984645
50	NC_012185	TTA	2	6	6534	6539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984645
51	NC_012185	ATC	2	6	6677	6682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224984645
52	NC_012185	ATT	2	6	7538	7543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984646
53	NC_012185	TTA	2	6	7573	7578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984646
54	NC_012185	ATT	2	6	7767	7772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984646
55	NC_012185	TCT	2	6	7786	7791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224984646
56	NC_012185	AAT	2	6	7792	7797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984646
57	NC_012185	TCC	2	6	7890	7895	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	224984646
58	NC_012185	AAT	2	6	7947	7952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984646
59	NC_012185	ATT	2	6	7974	7979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984646
60	NC_012185	TTC	2	6	8007	8012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224984646
61	NC_012185	ATT	2	6	8055	8060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984646
62	NC_012185	TTA	2	6	8074	8079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984646
63	NC_012185	CAA	2	6	8208	8213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224984647
64	NC_012185	CTT	2	6	8388	8393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224984647
65	NC_012185	ACT	2	6	8467	8472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224984647
66	NC_012185	ATT	2	6	8519	8524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984647
67	NC_012185	TAT	2	6	8542	8547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984647
68	NC_012185	ATA	3	9	8599	8607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984647
69	NC_012185	TCA	2	6	8621	8626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224984647
70	NC_012185	TAT	3	9	8655	8663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984647
71	NC_012185	TAA	2	6	8670	8675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984647
72	NC_012185	TTA	2	6	8892	8897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984648
73	NC_012185	TAT	2	6	9007	9012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984648
74	NC_012185	AAT	2	6	9048	9053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984648
75	NC_012185	CTT	2	6	9214	9219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224984648
76	NC_012185	CTT	2	6	9238	9243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224984648
77	NC_012185	CAT	2	6	9326	9331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224984648
78	NC_012185	TAA	2	6	9376	9381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984648
79	NC_012185	AGA	2	6	9492	9497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984649
80	NC_012185	TAA	2	6	9521	9526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984649
81	NC_012185	TAA	2	6	9534	9539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984649
82	NC_012185	ATT	2	6	9551	9556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984649
83	NC_012185	CAA	2	6	10465	10470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224984650
84	NC_012185	AAT	2	6	10472	10477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984650
85	NC_012185	ATT	2	6	10573	10578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984651
86	NC_012185	AAG	3	9	12128	12136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984652
87	NC_012185	GCT	2	6	12162	12167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224984652
88	NC_012185	TGA	2	6	12168	12173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224984652
89	NC_012185	AGA	2	6	12233	12238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984652
90	NC_012185	AGC	2	6	12260	12265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224984652
91	NC_012185	TAA	2	6	12919	12924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984654
92	NC_012185	CTG	2	6	12964	12969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224984654
93	NC_012185	TTG	2	6	13131	13136	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224984654
94	NC_012185	CAT	2	6	13201	13206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224984654
95	NC_012185	AAC	2	6	13268	13273	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224984654
96	NC_012185	TTA	2	6	13419	13424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984654
97	NC_012185	TTA	2	6	13455	13460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984654
98	NC_012185	ATT	2	6	13517	13522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984654
99	NC_012185	AAT	2	6	14069	14074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984655
100	NC_012185	TTA	2	6	14366	14371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984656
101	NC_012185	ACA	2	6	14411	14416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224984656
102	NC_012185	GTA	2	6	14417	14422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224984656
103	NC_012185	AAC	2	6	14446	14451	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224984656
104	NC_012185	TTG	2	6	14969	14974	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224984657
105	NC_012185	ATC	2	6	14993	14998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224984657
106	NC_012185	AAT	2	6	15001	15006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984657
107	NC_012185	CAC	2	6	15016	15021	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224984657
108	NC_012185	TTA	2	6	15075	15080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984657
109	NC_012185	TAG	2	6	15252	15257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224984658
110	NC_012185	GCC	2	6	15294	15299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224984658
111	NC_012185	CAA	2	6	15322	15327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224984658
112	NC_012185	CAC	2	6	15342	15347	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224984658
113	NC_012185	GCT	2	6	15556	15561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224984659
114	NC_012185	TAA	2	6	15606	15611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984659
115	NC_012185	TAT	2	6	15615	15620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984659
116	NC_012185	TAA	2	6	15624	15629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984659
117	NC_012185	CAC	2	6	15633	15638	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224984659
118	NC_012185	ATT	2	6	15664	15669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984659
119	NC_012185	ATT	2	6	15778	15783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984659
120	NC_012185	ATT	2	6	15796	15801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984659
121	NC_012185	CAT	2	6	15810	15815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224984659
122	NC_012185	TAT	2	6	16100	16105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984660
123	NC_012185	ATG	2	6	16688	16693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224984661
124	NC_012185	TTG	2	6	16743	16748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224984661
125	NC_012185	CTA	2	6	16796	16801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224984661
126	NC_012185	TCA	2	6	16807	16812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224984661
127	NC_012185	TCT	2	6	16879	16884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224984661
128	NC_012185	TAA	2	6	16988	16993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984661
129	NC_012185	AAT	2	6	17053	17058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984661
130	NC_012185	ATA	2	6	17481	17486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984662
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