MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_lp17

Total Repeats: 22

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012180	ACTAT	2	10	38	47	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_012180	AATTT	2	10	1937	1946	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012180	AATTT	2	10	3003	3012	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012180	GTTTT	2	10	3249	3258	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012180	TTTGA	2	10	3685	3694	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012180	TAAAG	2	10	5906	5915	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012180	ATTAG	2	10	6031	6040	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012180	TTTTA	2	10	6822	6831	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012180	AAACA	2	10	6865	6874	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_012180	TATAA	2	10	7232	7241	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012180	TAAGA	2	10	10352	10361	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012180	ATAAA	2	10	13642	13651	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012180	AAATT	2	10	15601	15610	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012180	ATTTT	2	10	15793	15802	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012180	ATATA	2	10	16938	16947	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012180	ATATA	2	10	16959	16968	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012180	ATATA	2	10	16980	16989	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012180	TTTTA	2	10	18139	18148	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012180	TTAAA	2	10	18361	18370	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012180	AAAGA	2	10	18403	18412	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012180	TTATG	2	10	18629	18638	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012180	TAAAG	2	10	18794	18803	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.