MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_lp17

Total Repeats: 21

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012180	GATAA	2	10	1216	1225	60 %	20 %	20 %	0 %	224796763
2	NC_012180	AAAAG	2	10	1423	1432	80 %	0 %	20 %	0 %	224796763
3	NC_012180	GTTTT	2	10	2192	2201	0 %	80 %	20 %	0 %	224796760
4	NC_012180	TTTGA	2	10	2635	2644	20 %	60 %	20 %	0 %	224796760
5	NC_012180	ATTTA	2	10	2879	2888	40 %	60 %	0 %	0 %	224796760
6	NC_012180	CAAAA	2	10	4225	4234	80 %	0 %	0 %	20 %	224796744
7	NC_012180	TTTAT	2	10	4842	4851	20 %	80 %	0 %	0 %	224796762
8	NC_012180	AAATT	2	10	5197	5206	60 %	40 %	0 %	0 %	224796762
9	NC_012180	CAAAA	2	10	8577	8586	80 %	0 %	0 %	20 %	224796751
10	NC_012180	TATCT	2	10	11227	11236	20 %	60 %	0 %	20 %	224796769
11	NC_012180	TTTTA	2	10	11299	11308	20 %	80 %	0 %	0 %	224796769
12	NC_012180	TTATC	2	10	11847	11856	20 %	60 %	0 %	20 %	224796769
13	NC_012180	AATTG	2	10	12094	12103	40 %	40 %	20 %	0 %	224796761
14	NC_012180	GGTTT	2	10	12521	12530	0 %	60 %	40 %	0 %	224796754
15	NC_012180	ATTTG	2	10	12768	12777	20 %	60 %	20 %	0 %	224796754
16	NC_012180	TTTTC	2	10	13050	13059	0 %	80 %	0 %	20 %	224796754
17	NC_012180	ATTTT	2	10	13858	13867	20 %	80 %	0 %	0 %	224796767
18	NC_012180	TTTAA	2	10	14205	14214	40 %	60 %	0 %	0 %	224796767
19	NC_012180	GTATG	2	10	15362	15371	20 %	40 %	40 %	0 %	224796745
20	NC_012180	TTGAA	2	10	19447	19456	40 %	40 %	20 %	0 %	224796746
21	NC_012180	TCTAA	2	10	19824	19833	40 %	40 %	0 %	20 %	224796746

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.