MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_lp17

Total Repeats: 80

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012180	TTTC	2	8	63	70	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_012180	GATT	2	8	290	297	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012180	AATT	2	8	360	367	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012180	AATA	2	8	505	512	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012180	TATT	2	8	513	520	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012180	TTTA	2	8	544	551	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012180	TAGA	2	8	668	675	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012180	AAAT	2	8	1013	1020	75 %	25 %	0 %	0 %	224796763
9	NC_012180	AGCA	2	8	1622	1629	50 %	0 %	25 %	25 %	224796763
10	NC_012180	AAAT	2	8	1918	1925	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012180	GTTT	2	8	2794	2801	0 %	75 %	25 %	0 %	224796760
12	NC_012180	TGTT	2	8	3777	3784	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012180	AAGA	2	8	3947	3954	75 %	0 %	25 %	0 %	224796749
14	NC_012180	TAAA	2	8	4349	4356	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012180	TAAG	2	8	4462	4469	50 %	25 %	25 %	0 %	224796757
16	NC_012180	ATTA	2	8	5496	5503	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012180	ATTA	2	8	5513	5520	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012180	ATTA	2	8	5530	5537	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012180	ATTA	2	8	5842	5849	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012180	ATAA	2	8	6473	6480	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012180	AAAT	2	8	6669	6676	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012180	GCTT	2	8	6698	6705	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_012180	ACAA	2	8	6711	6718	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_012180	TTAA	2	8	6748	6755	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012180	GTTT	2	8	7125	7132	0 %	75 %	25 %	0 %	224796748
26	NC_012180	AAAC	2	8	7405	7412	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_012180	AAGA	2	8	7508	7515	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012180	TGTT	2	8	7942	7949	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012180	ATTC	2	8	8075	8082	25 %	50 %	0 %	25 %	224796755
30	NC_012180	AACA	2	8	8254	8261	75 %	0 %	0 %	25 %	224796755
31	NC_012180	TAAC	2	8	8309	8316	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_012180	AAAT	2	8	8449	8456	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012180	AATA	2	8	8564	8571	75 %	25 %	0 %	0 %	224796751
34	NC_012180	TTGT	2	8	8884	8891	0 %	75 %	25 %	0 %	224796768
35	NC_012180	AAAG	2	8	9164	9171	75 %	0 %	25 %	0 %	224796747
36	NC_012180	CGAT	2	8	9351	9358	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_012180	TTTA	2	8	9370	9377	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012180	ATTA	2	8	9714	9721	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012180	AAAT	2	8	9729	9736	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012180	TATT	2	8	9759	9766	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012180	ATTA	2	8	9987	9994	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012180	TTTC	2	8	10148	10155	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_012180	TTTA	2	8	10882	10889	25 %	75 %	0 %	0 %	224796769
44	NC_012180	TGAT	2	8	11544	11551	25 %	50 %	25 %	0 %	224796769
45	NC_012180	TTTC	2	8	12104	12111	0 %	75 %	0 %	25 %	224796761
46	NC_012180	ACAT	2	8	12326	12333	50 %	25 %	0 %	25 %	224796761
47	NC_012180	TGTT	2	8	12747	12754	0 %	75 %	25 %	0 %	224796754
48	NC_012180	TGTT	2	8	12832	12839	0 %	75 %	25 %	0 %	224796754
49	NC_012180	AAGG	2	8	12924	12931	50 %	0 %	50 %	0 %	224796754
50	NC_012180	GTTT	2	8	13313	13320	0 %	75 %	25 %	0 %	224796754
51	NC_012180	AGTA	2	8	13396	13403	50 %	25 %	25 %	0 %	224796754
52	NC_012180	TTTA	2	8	13576	13583	25 %	75 %	0 %	0 %	224796766
53	NC_012180	AAAT	2	8	13629	13636	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012180	AATG	2	8	13661	13668	50 %	25 %	25 %	0 %	224796767
55	NC_012180	CATT	2	8	14797	14804	25 %	50 %	0 %	25 %	224796756
56	NC_012180	GATT	2	8	14867	14874	25 %	50 %	25 %	0 %	224796756
57	NC_012180	TAGA	2	8	14931	14938	50 %	25 %	25 %	0 %	224796756
58	NC_012180	TAAT	2	8	14944	14951	50 %	50 %	0 %	0 %	224796756
59	NC_012180	GTTT	2	8	14980	14987	0 %	75 %	25 %	0 %	224796756
60	NC_012180	TCTT	2	8	15192	15199	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_012180	AAGT	2	8	15242	15249	50 %	25 %	25 %	0 %	224796745
62	NC_012180	TTTA	2	8	15527	15534	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012180	AGTT	2	8	16135	16142	25 %	50 %	25 %	0 %	224796758
64	NC_012180	ATTT	2	8	16415	16422	25 %	75 %	0 %	0 %	224796758
65	NC_012180	TATT	2	8	16732	16739	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012180	TAAT	2	8	16846	16853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012180	TAAT	2	8	16867	16874	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012180	TAAT	2	8	16888	16895	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012180	TAAT	2	8	16909	16916	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_012180	TAAT	2	8	16930	16937	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012180	TAAT	2	8	16951	16958	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012180	TAAT	2	8	16972	16979	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012180	TTGT	2	8	17826	17833	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012180	TAAA	2	8	18418	18425	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012180	TTAT	2	8	18879	18886	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012180	ATAA	3	12	18990	19001	75 %	25 %	0 %	0 %	224796764
77	NC_012180	ATCT	2	8	19216	19223	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_012180	TGTT	2	8	19671	19678	0 %	75 %	25 %	0 %	224796746
79	NC_012180	TGTA	2	8	19952	19959	25 %	50 %	25 %	0 %	224796746
80	NC_012180	TAAG	2	8	19968	19975	50 %	25 %	25 %	0 %	224796746

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.