MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_lp17

Total Repeats: 46

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012180	TTTC	2	8	63	70	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_012180	GATT	2	8	290	297	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012180	AATT	2	8	360	367	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012180	AATA	2	8	505	512	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012180	TATT	2	8	513	520	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012180	TTTA	2	8	544	551	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012180	TAGA	2	8	668	675	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012180	AAAT	2	8	1918	1925	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012180	TGTT	2	8	3777	3784	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012180	TAAA	2	8	4349	4356	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012180	ATTA	2	8	5496	5503	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012180	ATTA	2	8	5513	5520	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012180	ATTA	2	8	5530	5537	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012180	ATTA	2	8	5842	5849	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012180	ATAA	2	8	6473	6480	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012180	AAAT	2	8	6669	6676	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012180	GCTT	2	8	6698	6705	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_012180	ACAA	2	8	6711	6718	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_012180	TTAA	2	8	6748	6755	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012180	AAAC	2	8	7405	7412	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_012180	AAGA	2	8	7508	7515	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012180	TGTT	2	8	7942	7949	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012180	TAAC	2	8	8309	8316	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_012180	AAAT	2	8	8449	8456	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012180	CGAT	2	8	9351	9358	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_012180	TTTA	2	8	9370	9377	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012180	ATTA	2	8	9714	9721	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012180	AAAT	2	8	9729	9736	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012180	TATT	2	8	9759	9766	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012180	ATTA	2	8	9987	9994	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012180	TTTC	2	8	10148	10155	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_012180	AAAT	2	8	13629	13636	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012180	TCTT	2	8	15192	15199	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_012180	TTTA	2	8	15527	15534	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012180	TATT	2	8	16732	16739	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012180	TAAT	2	8	16846	16853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012180	TAAT	2	8	16867	16874	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012180	TAAT	2	8	16888	16895	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012180	TAAT	2	8	16909	16916	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012180	TAAT	2	8	16930	16937	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012180	TAAT	2	8	16951	16958	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012180	TAAT	2	8	16972	16979	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012180	TTGT	2	8	17826	17833	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012180	TAAA	2	8	18418	18425	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012180	TTAT	2	8	18879	18886	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012180	ATCT	2	8	19216	19223	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.