MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_lp17

Total Repeats: 34

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012180	AAAT	2	8	1013	1020	75 %	25 %	0 %	0 %	224796763
2	NC_012180	AGCA	2	8	1622	1629	50 %	0 %	25 %	25 %	224796763
3	NC_012180	GTTT	2	8	2794	2801	0 %	75 %	25 %	0 %	224796760
4	NC_012180	AAGA	2	8	3947	3954	75 %	0 %	25 %	0 %	224796749
5	NC_012180	TAAG	2	8	4462	4469	50 %	25 %	25 %	0 %	224796757
6	NC_012180	GTTT	2	8	7125	7132	0 %	75 %	25 %	0 %	224796748
7	NC_012180	ATTC	2	8	8075	8082	25 %	50 %	0 %	25 %	224796755
8	NC_012180	AACA	2	8	8254	8261	75 %	0 %	0 %	25 %	224796755
9	NC_012180	AATA	2	8	8564	8571	75 %	25 %	0 %	0 %	224796751
10	NC_012180	TTGT	2	8	8884	8891	0 %	75 %	25 %	0 %	224796768
11	NC_012180	AAAG	2	8	9164	9171	75 %	0 %	25 %	0 %	224796747
12	NC_012180	TTTA	2	8	10882	10889	25 %	75 %	0 %	0 %	224796769
13	NC_012180	TGAT	2	8	11544	11551	25 %	50 %	25 %	0 %	224796769
14	NC_012180	TTTC	2	8	12104	12111	0 %	75 %	0 %	25 %	224796761
15	NC_012180	ACAT	2	8	12326	12333	50 %	25 %	0 %	25 %	224796761
16	NC_012180	TGTT	2	8	12747	12754	0 %	75 %	25 %	0 %	224796754
17	NC_012180	TGTT	2	8	12832	12839	0 %	75 %	25 %	0 %	224796754
18	NC_012180	AAGG	2	8	12924	12931	50 %	0 %	50 %	0 %	224796754
19	NC_012180	GTTT	2	8	13313	13320	0 %	75 %	25 %	0 %	224796754
20	NC_012180	AGTA	2	8	13396	13403	50 %	25 %	25 %	0 %	224796754
21	NC_012180	TTTA	2	8	13576	13583	25 %	75 %	0 %	0 %	224796766
22	NC_012180	AATG	2	8	13661	13668	50 %	25 %	25 %	0 %	224796767
23	NC_012180	CATT	2	8	14797	14804	25 %	50 %	0 %	25 %	224796756
24	NC_012180	GATT	2	8	14867	14874	25 %	50 %	25 %	0 %	224796756
25	NC_012180	TAGA	2	8	14931	14938	50 %	25 %	25 %	0 %	224796756
26	NC_012180	TAAT	2	8	14944	14951	50 %	50 %	0 %	0 %	224796756
27	NC_012180	GTTT	2	8	14980	14987	0 %	75 %	25 %	0 %	224796756
28	NC_012180	AAGT	2	8	15242	15249	50 %	25 %	25 %	0 %	224796745
29	NC_012180	AGTT	2	8	16135	16142	25 %	50 %	25 %	0 %	224796758
30	NC_012180	ATTT	2	8	16415	16422	25 %	75 %	0 %	0 %	224796758
31	NC_012180	ATAA	3	12	18990	19001	75 %	25 %	0 %	0 %	224796764
32	NC_012180	TGTT	2	8	19671	19678	0 %	75 %	25 %	0 %	224796746
33	NC_012180	TGTA	2	8	19952	19959	25 %	50 %	25 %	0 %	224796746
34	NC_012180	TAAG	2	8	19968	19975	50 %	25 %	25 %	0 %	224796746

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.