MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_lp17

Total Repeats: 305

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012180	TAT	3	9	92	100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012180	GTT	2	6	167	172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012180	TTC	2	6	262	267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_012180	TAA	2	6	389	394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012180	TTA	2	6	395	400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012180	TAT	2	6	434	439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012180	GAA	2	6	499	504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012180	TAA	2	6	652	657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012180	AAG	2	6	701	706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224796763
10	NC_012180	AAT	2	6	793	798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796763
11	NC_012180	AAT	3	9	811	819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796763
12	NC_012180	CTA	2	6	833	838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224796763
13	NC_012180	ATA	2	6	848	853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796763
14	NC_012180	AGA	2	6	870	875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224796763
15	NC_012180	CAA	2	6	876	881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224796763
16	NC_012180	TAG	2	6	909	914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224796763
17	NC_012180	ATA	2	6	941	946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796763
18	NC_012180	GAA	2	6	988	993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224796763
19	NC_012180	TAA	2	6	996	1001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796763
20	NC_012180	AAT	3	9	1018	1026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796763
21	NC_012180	AGA	2	6	1084	1089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224796763
22	NC_012180	CAA	2	6	1093	1098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224796763
23	NC_012180	TAA	2	6	1101	1106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796763
24	NC_012180	ACA	2	6	1198	1203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224796763
25	NC_012180	GAG	2	6	1237	1242	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	224796763
26	NC_012180	ATA	2	6	1280	1285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796763
27	NC_012180	AAC	2	6	1288	1293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224796763
28	NC_012180	TAA	2	6	1329	1334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796763
29	NC_012180	AGC	2	6	1342	1347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224796763
30	NC_012180	ATG	2	6	1373	1378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224796763
31	NC_012180	AGA	2	6	1446	1451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224796763
32	NC_012180	CTT	2	6	1469	1474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224796763
33	NC_012180	AAG	2	6	1568	1573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224796763
34	NC_012180	TTA	2	6	1610	1615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796763
35	NC_012180	TAA	2	6	1815	1820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012180	TAA	2	6	1830	1835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012180	GAA	2	6	1995	2000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012180	ATT	2	6	2035	2040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012180	TAG	2	6	2069	2074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224796760
40	NC_012180	TCA	2	6	2121	2126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224796760
41	NC_012180	ATC	2	6	2210	2215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224796760
42	NC_012180	TAA	2	6	2228	2233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796760
43	NC_012180	CTT	2	6	2242	2247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224796760
44	NC_012180	TAA	2	6	2264	2269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796760
45	NC_012180	TCT	2	6	2298	2303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224796760
46	NC_012180	TTA	2	6	2358	2363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796760
47	NC_012180	ATT	2	6	2436	2441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796760
48	NC_012180	ATC	2	6	2477	2482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224796760
49	NC_012180	AGC	2	6	2534	2539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224796760
50	NC_012180	TCT	2	6	2622	2627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224796760
51	NC_012180	TGA	2	6	2690	2695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224796760
52	NC_012180	ATT	2	6	2741	2746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796760
53	NC_012180	AGT	2	6	2777	2782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224796760
54	NC_012180	TAA	2	6	2857	2862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796760
55	NC_012180	TAA	2	6	2872	2877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796760
56	NC_012180	TAT	2	6	2922	2927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012180	ATA	2	6	2931	2936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012180	ATA	3	9	2944	2952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012180	ATT	2	6	2965	2970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012180	ATT	2	6	2987	2992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012180	TTC	2	6	3069	3074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_012180	TAA	2	6	3081	3086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012180	CAA	2	6	3098	3103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_012180	TAA	2	6	3285	3290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012180	TCT	2	6	3301	3306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_012180	TGA	2	6	3381	3386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012180	TTA	2	6	3423	3428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012180	ATT	2	6	3492	3497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012180	ACT	2	6	3521	3526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_012180	AAC	2	6	3575	3580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_012180	ATT	2	6	3582	3587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012180	TCT	2	6	3603	3608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_012180	ATA	2	6	3872	3877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012180	TTA	2	6	3992	3997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796749
75	NC_012180	TAA	2	6	4057	4062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012180	ATG	2	6	4075	4080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012180	CAT	2	6	4108	4113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224796744
78	NC_012180	TAA	2	6	4114	4119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796744
79	NC_012180	AAT	2	6	4169	4174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796744
80	NC_012180	TGA	2	6	4196	4201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224796744
81	NC_012180	ATT	2	6	4291	4296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796744
82	NC_012180	ATT	2	6	4332	4337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012180	GAG	2	6	4412	4417	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012180	CTT	2	6	4521	4526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224796757
85	NC_012180	AGA	2	6	4531	4536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224796757
86	NC_012180	TAA	3	9	4545	4553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796757
87	NC_012180	ATT	2	6	4578	4583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_012180	TCA	2	6	4598	4603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_012180	ATT	2	6	4606	4611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_012180	CTT	2	6	4744	4749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224796762
91	NC_012180	ATT	2	6	4766	4771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796762
92	NC_012180	CTT	2	6	4798	4803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224796762
93	NC_012180	TCA	2	6	4953	4958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224796762
94	NC_012180	CTG	2	6	5041	5046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224796762
95	NC_012180	CTT	2	6	5065	5070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224796762
96	NC_012180	GCA	2	6	5187	5192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224796762
97	NC_012180	TGT	2	6	5267	5272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224796762
98	NC_012180	CTT	2	6	5281	5286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224796762
99	NC_012180	TAA	2	6	5405	5410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796762
100	NC_012180	TAA	2	6	5463	5468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_012180	CAG	2	6	5597	5602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224796752
102	NC_012180	CTA	2	6	5753	5758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_012180	AAT	2	6	5782	5787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_012180	AAT	2	6	5878	5883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_012180	ATA	2	6	5959	5964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_012180	CTA	2	6	5990	5995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_012180	TTA	2	6	6053	6058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_012180	TAC	2	6	6073	6078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_012180	TAA	2	6	6198	6203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_012180	TTA	2	6	6223	6228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_012180	AAC	2	6	6377	6382	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_012180	TAG	2	6	6389	6394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_012180	AGA	2	6	6404	6409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012180	GAT	2	6	6488	6493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_012180	ACA	2	6	6499	6504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_012180	ATT	2	6	6551	6556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_012180	ACA	2	6	6572	6577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_012180	ATT	2	6	6578	6583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_012180	ATA	2	6	6908	6913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_012180	TGA	2	6	6937	6942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_012180	TAA	2	6	7097	7102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796748
122	NC_012180	AAC	2	6	7147	7152	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224796748
123	NC_012180	TAA	2	6	7154	7159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796748
124	NC_012180	TAA	2	6	7186	7191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_012180	ATT	2	6	7342	7347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_012180	TTC	2	6	7385	7390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_012180	ATT	2	6	7470	7475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_012180	AAT	2	6	7530	7535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_012180	TAA	2	6	7767	7772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796759
130	NC_012180	AGT	2	6	7953	7958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_012180	AGT	2	6	7987	7992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_012180	TAA	2	6	8083	8088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796755
133	NC_012180	AGT	2	6	8169	8174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224796755
134	NC_012180	TAC	2	6	8427	8432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_012180	GTA	2	6	8436	8441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_012180	TAT	2	6	8504	8509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796751
137	NC_012180	TTA	2	6	8613	8618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796751
138	NC_012180	GAT	2	6	8661	8666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224796751
139	NC_012180	AAT	2	6	8676	8681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796751
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271	NC_012180	ATT	2	6	17771	17776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
272	NC_012180	GTG	2	6	17811	17816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
273	NC_012180	ATG	2	6	17820	17825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
274	NC_012180	AAT	2	6	17834	17839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
275	NC_012180	GAT	3	9	17869	17877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
276	NC_012180	ATA	2	6	18007	18012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
277	NC_012180	CTT	2	6	18013	18018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
278	NC_012180	TGT	2	6	18040	18045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
279	NC_012180	AAG	2	6	18068	18073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
280	NC_012180	ATT	2	6	18084	18089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
281	NC_012180	ATA	2	6	18091	18096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
282	NC_012180	TAT	2	6	18108	18113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
283	NC_012180	ATT	2	6	18202	18207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
284	NC_012180	ACA	2	6	18263	18268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
285	NC_012180	ATA	2	6	18303	18308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
286	NC_012180	TTA	2	6	18343	18348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
287	NC_012180	ATT	2	6	18682	18687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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290	NC_012180	ATT	2	6	18812	18817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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305	NC_012180	ATC	2	6	19919	19924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224796746

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.