MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_lp17

Total Repeats: 164

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012180	AAG	2	6	701	706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224796763
2	NC_012180	AAT	2	6	793	798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796763
3	NC_012180	AAT	3	9	811	819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796763
4	NC_012180	CTA	2	6	833	838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224796763
5	NC_012180	ATA	2	6	848	853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796763
6	NC_012180	AGA	2	6	870	875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224796763
7	NC_012180	CAA	2	6	876	881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224796763
8	NC_012180	TAG	2	6	909	914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224796763
9	NC_012180	ATA	2	6	941	946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796763
10	NC_012180	GAA	2	6	988	993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224796763
11	NC_012180	TAA	2	6	996	1001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796763
12	NC_012180	AAT	3	9	1018	1026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796763
13	NC_012180	AGA	2	6	1084	1089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224796763
14	NC_012180	CAA	2	6	1093	1098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224796763
15	NC_012180	TAA	2	6	1101	1106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796763
16	NC_012180	ACA	2	6	1198	1203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224796763
17	NC_012180	GAG	2	6	1237	1242	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	224796763
18	NC_012180	ATA	2	6	1280	1285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796763
19	NC_012180	AAC	2	6	1288	1293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224796763
20	NC_012180	TAA	2	6	1329	1334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796763
21	NC_012180	AGC	2	6	1342	1347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224796763
22	NC_012180	ATG	2	6	1373	1378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224796763
23	NC_012180	AGA	2	6	1446	1451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224796763
24	NC_012180	CTT	2	6	1469	1474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224796763
25	NC_012180	AAG	2	6	1568	1573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224796763
26	NC_012180	TTA	2	6	1610	1615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796763
27	NC_012180	TAG	2	6	2069	2074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224796760
28	NC_012180	TCA	2	6	2121	2126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224796760
29	NC_012180	ATC	2	6	2210	2215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224796760
30	NC_012180	TAA	2	6	2228	2233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796760
31	NC_012180	CTT	2	6	2242	2247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224796760
32	NC_012180	TAA	2	6	2264	2269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796760
33	NC_012180	TCT	2	6	2298	2303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224796760
34	NC_012180	TTA	2	6	2358	2363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796760
35	NC_012180	ATT	2	6	2436	2441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796760
36	NC_012180	ATC	2	6	2477	2482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224796760
37	NC_012180	AGC	2	6	2534	2539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224796760
38	NC_012180	TCT	2	6	2622	2627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224796760
39	NC_012180	TGA	2	6	2690	2695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224796760
40	NC_012180	ATT	2	6	2741	2746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796760
41	NC_012180	AGT	2	6	2777	2782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224796760
42	NC_012180	TAA	2	6	2857	2862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796760
43	NC_012180	TAA	2	6	2872	2877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796760
44	NC_012180	TTA	2	6	3992	3997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796749
45	NC_012180	CAT	2	6	4108	4113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224796744
46	NC_012180	TAA	2	6	4114	4119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796744
47	NC_012180	AAT	2	6	4169	4174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796744
48	NC_012180	TGA	2	6	4196	4201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224796744
49	NC_012180	ATT	2	6	4291	4296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796744
50	NC_012180	CTT	2	6	4521	4526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224796757
51	NC_012180	AGA	2	6	4531	4536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224796757
52	NC_012180	TAA	3	9	4545	4553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796757
53	NC_012180	CTT	2	6	4744	4749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224796762
54	NC_012180	ATT	2	6	4766	4771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796762
55	NC_012180	CTT	2	6	4798	4803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224796762
56	NC_012180	TCA	2	6	4953	4958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224796762
57	NC_012180	CTG	2	6	5041	5046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224796762
58	NC_012180	CTT	2	6	5065	5070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224796762
59	NC_012180	GCA	2	6	5187	5192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224796762
60	NC_012180	TGT	2	6	5267	5272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224796762
61	NC_012180	CTT	2	6	5281	5286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224796762
62	NC_012180	TAA	2	6	5405	5410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796762
63	NC_012180	CAG	2	6	5597	5602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224796752
64	NC_012180	TAA	2	6	7097	7102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796748
65	NC_012180	AAC	2	6	7147	7152	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224796748
66	NC_012180	TAA	2	6	7154	7159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796748
67	NC_012180	TAA	2	6	7767	7772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796759
68	NC_012180	TAA	2	6	8083	8088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796755
69	NC_012180	AGT	2	6	8169	8174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224796755
70	NC_012180	TAT	2	6	8504	8509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796751
71	NC_012180	TTA	2	6	8613	8618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796751
72	NC_012180	GAT	2	6	8661	8666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224796751
73	NC_012180	AAT	2	6	8676	8681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796751
74	NC_012180	TTA	2	6	8684	8689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796751
75	NC_012180	ATT	2	6	8704	8709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796751
76	NC_012180	TAT	2	6	8843	8848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796768
77	NC_012180	ATA	2	6	8851	8856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796768
78	NC_012180	ACA	2	6	8917	8922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224796768
79	NC_012180	CAT	2	6	9041	9046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224796747
80	NC_012180	TAT	2	6	9063	9068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796747
81	NC_012180	TAT	2	6	9105	9110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796747
82	NC_012180	AAT	2	6	9187	9192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796747
83	NC_012180	TAT	2	6	9438	9443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796765
84	NC_012180	TTG	2	6	10790	10795	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224796769
85	NC_012180	TCA	2	6	10956	10961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224796769
86	NC_012180	ATT	2	6	11095	11100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796769
87	NC_012180	TTA	2	6	11151	11156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796769
88	NC_012180	TCT	2	6	11207	11212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224796769
89	NC_012180	TTC	2	6	11383	11388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224796769
90	NC_012180	CTT	2	6	11397	11402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224796769
91	NC_012180	TGT	2	6	11491	11496	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224796769
92	NC_012180	ATT	2	6	11803	11808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796769
93	NC_012180	ATT	2	6	11824	11829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796769
94	NC_012180	TAT	2	6	11839	11844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796769
95	NC_012180	ATT	2	6	12067	12072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796761
96	NC_012180	TCT	2	6	12135	12140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224796761
97	NC_012180	TCT	2	6	12169	12174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224796761
98	NC_012180	TCT	2	6	12268	12273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224796761
99	NC_012180	AAT	2	6	12483	12488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796754
100	NC_012180	AAG	2	6	12672	12677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224796754
101	NC_012180	TTC	2	6	12794	12799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224796754
102	NC_012180	TTA	2	6	12885	12890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796754
103	NC_012180	AAT	2	6	12938	12943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796754
104	NC_012180	GTT	2	6	12980	12985	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224796754
105	NC_012180	ATA	2	6	13023	13028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796754
106	NC_012180	ATT	2	6	13074	13079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796754
107	NC_012180	TTC	2	6	13175	13180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224796754
108	NC_012180	TAA	2	6	13267	13272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796754
109	NC_012180	ACC	2	6	13274	13279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224796754
110	NC_012180	TAA	2	6	13405	13410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796754
111	NC_012180	AAC	2	6	13517	13522	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224796766
112	NC_012180	TAA	3	9	13526	13534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796766
113	NC_012180	TAT	2	6	13588	13593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796766
114	NC_012180	TGT	2	6	13676	13681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224796767
115	NC_012180	ATG	2	6	13771	13776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224796767
116	NC_012180	ATT	2	6	13786	13791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796767
117	NC_012180	GTT	2	6	13974	13979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224796767
118	NC_012180	TAT	2	6	13980	13985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796767
119	NC_012180	ACA	2	6	14022	14027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224796767
120	NC_012180	TTG	2	6	14098	14103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224796767
121	NC_012180	ATA	2	6	14116	14121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796767
122	NC_012180	ATG	2	6	14152	14157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224796767
123	NC_012180	TTG	2	6	14158	14163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224796767
124	NC_012180	GAT	2	6	14199	14204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224796767
125	NC_012180	TGA	2	6	14402	14407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224796756
126	NC_012180	TAT	2	6	14510	14515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796756
127	NC_012180	TAT	2	6	14555	14560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796756
128	NC_012180	ATT	2	6	14679	14684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796756
129	NC_012180	CAA	3	9	14858	14866	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224796756
130	NC_012180	ATT	2	6	15231	15236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796745
131	NC_012180	AAG	2	6	15270	15275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224796745
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.