MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_lp17

Total Repeats: 161

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012180	T	6	6	253	258	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012180	T	8	8	282	289	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012180	T	6	6	1158	1163	0 %	100 %	0 %	0 %	224796763
4	NC_012180	A	6	6	1166	1171	100 %	0 %	0 %	0 %	224796763
5	NC_012180	A	6	6	1648	1653	100 %	0 %	0 %	0 %	224796763
6	NC_012180	A	7	7	1986	1992	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012180	T	8	8	2039	2046	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012180	T	6	6	2246	2251	0 %	100 %	0 %	0 %	224796760
9	NC_012180	T	8	8	2281	2288	0 %	100 %	0 %	0 %	224796760
10	NC_012180	T	8	8	2404	2411	0 %	100 %	0 %	0 %	224796760
11	NC_012180	T	7	7	2568	2574	0 %	100 %	0 %	0 %	224796760
12	NC_012180	T	6	6	2724	2729	0 %	100 %	0 %	0 %	224796760
13	NC_012180	T	7	7	2759	2765	0 %	100 %	0 %	0 %	224796760
14	NC_012180	T	6	6	2787	2792	0 %	100 %	0 %	0 %	224796760
15	NC_012180	T	6	6	3175	3180	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012180	A	6	6	3199	3204	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012180	T	7	7	3335	3341	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012180	T	6	6	3407	3412	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012180	T	6	6	3460	3465	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012180	T	7	7	3512	3518	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012180	T	6	6	3645	3650	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012180	T	8	8	3844	3851	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012180	A	7	7	3909	3915	100 %	0 %	0 %	0 %	224796749
24	NC_012180	A	6	6	3921	3926	100 %	0 %	0 %	0 %	224796749
25	NC_012180	A	7	7	3954	3960	100 %	0 %	0 %	0 %	224796749
26	NC_012180	A	7	7	4101	4107	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012180	A	6	6	4451	4456	100 %	0 %	0 %	0 %	224796757
28	NC_012180	T	6	6	4582	4587	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012180	T	6	6	4639	4644	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012180	T	6	6	4654	4659	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012180	T	6	6	5116	5121	0 %	100 %	0 %	0 %	224796762
32	NC_012180	T	6	6	5160	5165	0 %	100 %	0 %	0 %	224796762
33	NC_012180	T	6	6	5274	5279	0 %	100 %	0 %	0 %	224796762
34	NC_012180	T	7	7	5342	5348	0 %	100 %	0 %	0 %	224796762
35	NC_012180	T	6	6	5441	5446	0 %	100 %	0 %	0 %	224796762
36	NC_012180	A	8	8	5641	5648	100 %	0 %	0 %	0 %	224796752
37	NC_012180	A	6	6	5726	5731	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012180	A	6	6	6041	6046	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012180	A	6	6	6067	6072	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012180	A	6	6	6152	6157	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012180	A	7	7	6458	6464	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012180	T	6	6	6515	6520	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012180	A	6	6	6521	6526	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012180	T	7	7	6704	6710	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012180	T	6	6	6760	6765	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012180	T	6	6	6767	6772	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012180	T	6	6	6791	6796	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012180	T	7	7	6833	6839	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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50	NC_012180	T	8	8	7130	7137	0 %	100 %	0 %	0 %	224796748
51	NC_012180	A	7	7	7317	7323	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012180	A	7	7	7367	7373	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012180	T	6	6	7482	7487	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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57	NC_012180	T	6	6	7893	7898	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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70	NC_012180	T	6	6	8874	8879	0 %	100 %	0 %	0 %	224796768
71	NC_012180	T	7	7	9141	9147	0 %	100 %	0 %	0 %	224796747
72	NC_012180	T	6	6	9152	9157	0 %	100 %	0 %	0 %	224796747
73	NC_012180	A	6	6	9180	9185	100 %	0 %	0 %	0 %	224796747
74	NC_012180	T	6	6	9315	9320	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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112	NC_012180	T	6	6	13386	13391	0 %	100 %	0 %	0 %	224796754
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120	NC_012180	A	7	7	14641	14647	100 %	0 %	0 %	0 %	224796756
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.