MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_lp17

Total Repeats: 89

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012180	T	6	6	1158	1163	0 %	100 %	0 %	0 %	224796763
2	NC_012180	A	6	6	1166	1171	100 %	0 %	0 %	0 %	224796763
3	NC_012180	A	6	6	1648	1653	100 %	0 %	0 %	0 %	224796763
4	NC_012180	T	6	6	2246	2251	0 %	100 %	0 %	0 %	224796760
5	NC_012180	T	8	8	2281	2288	0 %	100 %	0 %	0 %	224796760
6	NC_012180	T	8	8	2404	2411	0 %	100 %	0 %	0 %	224796760
7	NC_012180	T	7	7	2568	2574	0 %	100 %	0 %	0 %	224796760
8	NC_012180	T	6	6	2724	2729	0 %	100 %	0 %	0 %	224796760
9	NC_012180	T	7	7	2759	2765	0 %	100 %	0 %	0 %	224796760
10	NC_012180	T	6	6	2787	2792	0 %	100 %	0 %	0 %	224796760
11	NC_012180	A	7	7	3909	3915	100 %	0 %	0 %	0 %	224796749
12	NC_012180	A	6	6	3921	3926	100 %	0 %	0 %	0 %	224796749
13	NC_012180	A	7	7	3954	3960	100 %	0 %	0 %	0 %	224796749
14	NC_012180	A	6	6	4451	4456	100 %	0 %	0 %	0 %	224796757
15	NC_012180	T	6	6	5116	5121	0 %	100 %	0 %	0 %	224796762
16	NC_012180	T	6	6	5160	5165	0 %	100 %	0 %	0 %	224796762
17	NC_012180	T	6	6	5274	5279	0 %	100 %	0 %	0 %	224796762
18	NC_012180	T	7	7	5342	5348	0 %	100 %	0 %	0 %	224796762
19	NC_012180	T	6	6	5441	5446	0 %	100 %	0 %	0 %	224796762
20	NC_012180	A	8	8	5641	5648	100 %	0 %	0 %	0 %	224796752
21	NC_012180	A	7	7	7048	7054	100 %	0 %	0 %	0 %	224796748
22	NC_012180	T	8	8	7130	7137	0 %	100 %	0 %	0 %	224796748
23	NC_012180	G	8	8	7740	7747	0 %	0 %	100 %	0 %	224796759
24	NC_012180	T	6	6	8092	8097	0 %	100 %	0 %	0 %	224796755
25	NC_012180	T	8	8	8123	8130	0 %	100 %	0 %	0 %	224796755
26	NC_012180	A	6	6	8187	8192	100 %	0 %	0 %	0 %	224796755
27	NC_012180	A	6	6	8496	8501	100 %	0 %	0 %	0 %	224796751
28	NC_012180	A	6	6	8622	8627	100 %	0 %	0 %	0 %	224796751
29	NC_012180	A	6	6	8818	8823	100 %	0 %	0 %	0 %	224796768
30	NC_012180	T	6	6	8874	8879	0 %	100 %	0 %	0 %	224796768
31	NC_012180	T	7	7	9141	9147	0 %	100 %	0 %	0 %	224796747
32	NC_012180	T	6	6	9152	9157	0 %	100 %	0 %	0 %	224796747
33	NC_012180	A	6	6	9180	9185	100 %	0 %	0 %	0 %	224796747
34	NC_012180	T	6	6	9533	9538	0 %	100 %	0 %	0 %	224796765
35	NC_012180	T	9	9	9540	9548	0 %	100 %	0 %	0 %	224796765
36	NC_012180	T	6	6	9856	9861	0 %	100 %	0 %	0 %	224796750
37	NC_012180	A	6	6	9904	9909	100 %	0 %	0 %	0 %	224796750
38	NC_012180	T	8	8	10835	10842	0 %	100 %	0 %	0 %	224796769
39	NC_012180	T	7	7	10968	10974	0 %	100 %	0 %	0 %	224796769
40	NC_012180	T	6	6	11035	11040	0 %	100 %	0 %	0 %	224796769
41	NC_012180	T	6	6	11088	11093	0 %	100 %	0 %	0 %	224796769
42	NC_012180	T	7	7	11195	11201	0 %	100 %	0 %	0 %	224796769
43	NC_012180	T	6	6	11312	11317	0 %	100 %	0 %	0 %	224796769
44	NC_012180	T	7	7	11355	11361	0 %	100 %	0 %	0 %	224796769
45	NC_012180	T	6	6	11553	11558	0 %	100 %	0 %	0 %	224796769
46	NC_012180	T	8	8	11699	11706	0 %	100 %	0 %	0 %	224796769
47	NC_012180	T	7	7	11762	11768	0 %	100 %	0 %	0 %	224796769
48	NC_012180	T	8	8	12071	12078	0 %	100 %	0 %	0 %	224796761
49	NC_012180	T	6	6	12225	12230	0 %	100 %	0 %	0 %	224796761
50	NC_012180	T	8	8	12536	12543	0 %	100 %	0 %	0 %	224796754
51	NC_012180	A	6	6	12654	12659	100 %	0 %	0 %	0 %	224796754
52	NC_012180	T	6	6	12664	12669	0 %	100 %	0 %	0 %	224796754
53	NC_012180	C	6	6	12693	12698	0 %	0 %	0 %	100 %	224796754
54	NC_012180	T	6	6	13017	13022	0 %	100 %	0 %	0 %	224796754
55	NC_012180	T	6	6	13327	13332	0 %	100 %	0 %	0 %	224796754
56	NC_012180	T	7	7	13378	13384	0 %	100 %	0 %	0 %	224796754
57	NC_012180	T	6	6	13386	13391	0 %	100 %	0 %	0 %	224796754
58	NC_012180	A	6	6	13682	13687	100 %	0 %	0 %	0 %	224796767
59	NC_012180	T	8	8	13701	13708	0 %	100 %	0 %	0 %	224796767
60	NC_012180	A	6	6	13841	13846	100 %	0 %	0 %	0 %	224796767
61	NC_012180	A	7	7	14038	14044	100 %	0 %	0 %	0 %	224796767
62	NC_012180	A	6	6	14531	14536	100 %	0 %	0 %	0 %	224796756
63	NC_012180	A	7	7	14641	14647	100 %	0 %	0 %	0 %	224796756
64	NC_012180	T	7	7	14849	14855	0 %	100 %	0 %	0 %	224796756
65	NC_012180	A	7	7	15034	15040	100 %	0 %	0 %	0 %	224796756
66	NC_012180	A	6	6	15405	15410	100 %	0 %	0 %	0 %	224796745
67	NC_012180	T	6	6	15899	15904	0 %	100 %	0 %	0 %	224796758
68	NC_012180	T	6	6	15997	16002	0 %	100 %	0 %	0 %	224796758
69	NC_012180	T	6	6	16088	16093	0 %	100 %	0 %	0 %	224796758
70	NC_012180	T	6	6	16204	16209	0 %	100 %	0 %	0 %	224796758
71	NC_012180	T	6	6	16367	16372	0 %	100 %	0 %	0 %	224796758
72	NC_012180	A	6	6	16395	16400	100 %	0 %	0 %	0 %	224796758
73	NC_012180	A	7	7	16457	16463	100 %	0 %	0 %	0 %	224796758
74	NC_012180	T	6	6	16500	16505	0 %	100 %	0 %	0 %	224796758
75	NC_012180	A	7	7	17010	17016	100 %	0 %	0 %	0 %	224796753
76	NC_012180	A	7	7	17093	17099	100 %	0 %	0 %	0 %	224796753
77	NC_012180	A	7	7	17233	17239	100 %	0 %	0 %	0 %	224796753
78	NC_012180	A	6	6	17519	17524	100 %	0 %	0 %	0 %	224796753
79	NC_012180	A	6	6	19027	19032	100 %	0 %	0 %	0 %	224796764
80	NC_012180	T	6	6	19076	19081	0 %	100 %	0 %	0 %	224796764
81	NC_012180	A	6	6	19103	19108	100 %	0 %	0 %	0 %	224796764
82	NC_012180	T	6	6	19346	19351	0 %	100 %	0 %	0 %	224796746
83	NC_012180	T	8	8	19386	19393	0 %	100 %	0 %	0 %	224796746
84	NC_012180	T	8	8	19395	19402	0 %	100 %	0 %	0 %	224796746
85	NC_012180	T	6	6	19432	19437	0 %	100 %	0 %	0 %	224796746
86	NC_012180	T	8	8	19543	19550	0 %	100 %	0 %	0 %	224796746
87	NC_012180	T	8	8	19753	19760	0 %	100 %	0 %	0 %	224796746
88	NC_012180	T	6	6	19766	19771	0 %	100 %	0 %	0 %	224796746
89	NC_012180	T	9	9	19854	19862	0 %	100 %	0 %	0 %	224796746

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.