MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_lp54

Total Repeats: 74

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012177	CCTAA	2	10	18	27	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
2	NC_012177	ATAAA	2	10	138	147	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012177	AAATC	2	10	1577	1586	60 %	20 %	0 %	20 %	224984383
4	NC_012177	GAATT	2	10	1602	1611	40 %	40 %	20 %	0 %	224984383
5	NC_012177	AAATT	2	10	1646	1655	60 %	40 %	0 %	0 %	224984383
6	NC_012177	TTTTA	2	10	2122	2131	20 %	80 %	0 %	0 %	224984384
7	NC_012177	GCATA	2	10	2496	2505	40 %	20 %	20 %	20 %	224984384
8	NC_012177	CCTAG	2	10	2813	2822	20 %	20 %	20 %	40 %	224984384
9	NC_012177	ATTAT	2	10	2974	2983	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012177	TTTTA	2	10	4747	4756	20 %	80 %	0 %	0 %	224984386
11	NC_012177	TATAC	2	10	5934	5943	40 %	40 %	0 %	20 %	224984388
12	NC_012177	AATAC	2	10	8120	8129	60 %	20 %	0 %	20 %	224984391
13	NC_012177	AAGAG	2	10	8577	8586	60 %	0 %	40 %	0 %	224984392
14	NC_012177	TATGT	2	10	8837	8846	20 %	60 %	20 %	0 %	224984393
15	NC_012177	ATAAA	2	10	8994	9003	80 %	20 %	0 %	0 %	224984393
16	NC_012177	ATTTT	2	10	9154	9163	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012177	TAATA	2	10	9228	9237	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012177	AGTAA	2	10	9504	9513	60 %	20 %	20 %	0 %	224984394
19	NC_012177	TATTT	2	10	11383	11392	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012177	TACTT	2	10	11473	11482	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_012177	ATCAA	2	10	11556	11565	60 %	20 %	0 %	20 %	224984397
22	NC_012177	ATAAA	2	10	12314	12323	80 %	20 %	0 %	0 %	224984397
23	NC_012177	AAAAC	2	10	12344	12353	80 %	0 %	0 %	20 %	224984397
24	NC_012177	TTAAA	2	10	13679	13688	60 %	40 %	0 %	0 %	224984399
25	NC_012177	GATTT	2	10	14018	14027	20 %	60 %	20 %	0 %	224984399
26	NC_012177	AAAAT	2	10	14669	14678	80 %	20 %	0 %	0 %	224984400
27	NC_012177	AAATA	2	10	17054	17063	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012177	TTTTA	2	10	17119	17128	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012177	ATTTT	2	10	17145	17154	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012177	TAAAT	2	10	17291	17300	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012177	TATTT	2	10	17500	17509	20 %	80 %	0 %	0 %	224984404
32	NC_012177	AATTT	2	10	17793	17802	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012177	AATAA	2	10	17832	17841	80 %	20 %	0 %	0 %	224984405
34	NC_012177	AATGA	2	10	19236	19245	60 %	20 %	20 %	0 %	224984406
35	NC_012177	TGAAT	2	10	20058	20067	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012177	CTAAA	2	10	20388	20397	60 %	20 %	0 %	20 %	224984407
37	NC_012177	ATTTA	2	10	20485	20494	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012177	TATTG	2	10	22131	22140	20 %	60 %	20 %	0 %	224984410
39	NC_012177	ATTTT	2	10	25197	25206	20 %	80 %	0 %	0 %	224984413
40	NC_012177	TTAAT	2	10	25312	25321	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012177	AAATC	2	10	27295	27304	60 %	20 %	0 %	20 %	224984415
42	NC_012177	ATTTT	2	10	27667	27676	20 %	80 %	0 %	0 %	224984416
43	NC_012177	CCAAA	2	10	28590	28599	60 %	0 %	0 %	40 %	224984417
44	NC_012177	TTTAA	2	10	29333	29342	40 %	60 %	0 %	0 %	224984418
45	NC_012177	TAATT	2	10	30369	30378	40 %	60 %	0 %	0 %	224984421
46	NC_012177	TACTT	2	10	30492	30501	20 %	60 %	0 %	20 %	224984421
47	NC_012177	AGTAC	2	10	31949	31958	40 %	20 %	20 %	20 %	224984423
48	NC_012177	TAATG	2	10	31965	31974	40 %	40 %	20 %	0 %	224984423
49	NC_012177	GTTTA	2	10	32656	32665	20 %	60 %	20 %	0 %	224984424
50	NC_012177	AGCTT	2	10	33625	33634	20 %	40 %	20 %	20 %	224984426
51	NC_012177	AAATA	2	10	33797	33806	80 %	20 %	0 %	0 %	224984426
52	NC_012177	TTAAA	2	10	34349	34358	60 %	40 %	0 %	0 %	224984426
53	NC_012177	GCTTG	2	10	36381	36390	0 %	40 %	40 %	20 %	224984429
54	NC_012177	CTTTT	2	10	38104	38113	0 %	80 %	0 %	20 %	224984431
55	NC_012177	ATTTT	2	10	41373	41382	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012177	AAATT	2	10	41762	41771	60 %	40 %	0 %	0 %	224984436
57	NC_012177	TTATC	2	10	42903	42912	20 %	60 %	0 %	20 %	224984437
58	NC_012177	TTCTT	2	10	44042	44051	0 %	80 %	0 %	20 %	224984438
59	NC_012177	ATTTT	2	10	45511	45520	20 %	80 %	0 %	0 %	224984439
60	NC_012177	TTATT	2	10	45713	45722	20 %	80 %	0 %	0 %	224984439
61	NC_012177	TTTGA	2	10	46266	46275	20 %	60 %	20 %	0 %	224984440
62	NC_012177	TTTGA	2	10	46296	46305	20 %	60 %	20 %	0 %	224984440
63	NC_012177	TTTAG	2	10	46457	46466	20 %	60 %	20 %	0 %	224984440
64	NC_012177	ATTAT	2	10	46846	46855	40 %	60 %	0 %	0 %	224984441
65	NC_012177	ATTAG	2	10	46957	46966	40 %	40 %	20 %	0 %	224984441
66	NC_012177	TGAAT	2	10	47122	47131	40 %	40 %	20 %	0 %	224984441
67	NC_012177	ATTTC	2	10	47675	47684	20 %	60 %	0 %	20 %	224984443
68	NC_012177	TTTGG	2	10	48708	48717	0 %	60 %	40 %	0 %	224984445
69	NC_012177	TTTAG	2	10	49301	49310	20 %	60 %	20 %	0 %	224984445
70	NC_012177	TTTAG	2	10	50394	50403	20 %	60 %	20 %	0 %	224984446
71	NC_012177	AATAA	2	10	51027	51036	80 %	20 %	0 %	0 %	224984447
72	NC_012177	TTTCC	2	10	51246	51255	0 %	60 %	0 %	40 %	224984447
73	NC_012177	TGGTT	2	10	51341	51350	0 %	60 %	40 %	0 %	224984447
74	NC_012177	TAAAA	2	10	51568	51577	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.