MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_lp54

Total Repeats: 130

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012177	ATTT	2	8	794	801	25 %	75 %	0 %	0 %	224984382
2	NC_012177	ATTT	2	8	2697	2704	25 %	75 %	0 %	0 %	224984384
3	NC_012177	AATC	2	8	3158	3165	50 %	25 %	0 %	25 %	224984385
4	NC_012177	ATTT	2	8	3211	3218	25 %	75 %	0 %	0 %	224984385
5	NC_012177	TAAA	2	8	3569	3576	75 %	25 %	0 %	0 %	224984385
6	NC_012177	TCAA	2	8	3645	3652	50 %	25 %	0 %	25 %	224984385
7	NC_012177	ATCA	2	8	3707	3714	50 %	25 %	0 %	25 %	224984385
8	NC_012177	AGCA	2	8	4735	4742	50 %	0 %	25 %	25 %	224984386
9	NC_012177	GAAA	2	8	5294	5301	75 %	0 %	25 %	0 %	224984387
10	NC_012177	ACAA	2	8	5658	5665	75 %	0 %	0 %	25 %	224984388
11	NC_012177	GCAA	2	8	5926	5933	50 %	0 %	25 %	25 %	224984388
12	NC_012177	AAAC	2	8	5992	5999	75 %	0 %	0 %	25 %	224984388
13	NC_012177	ACAA	2	8	6344	6351	75 %	0 %	0 %	25 %	224984388
14	NC_012177	CAAT	2	8	6500	6507	50 %	25 %	0 %	25 %	224984389
15	NC_012177	AGGA	2	8	6915	6922	50 %	0 %	50 %	0 %	224984389
16	NC_012177	AAAT	2	8	7540	7547	75 %	25 %	0 %	0 %	224984390
17	NC_012177	TTAA	2	8	7563	7570	50 %	50 %	0 %	0 %	224984390
18	NC_012177	TGGT	2	8	8024	8031	0 %	50 %	50 %	0 %	224984390
19	NC_012177	AAAT	2	8	8303	8310	75 %	25 %	0 %	0 %	224984392
20	NC_012177	GAAG	2	8	8466	8473	50 %	0 %	50 %	0 %	224984392
21	NC_012177	ATCA	2	8	8953	8960	50 %	25 %	0 %	25 %	224984393
22	NC_012177	AAAC	2	8	8961	8968	75 %	0 %	0 %	25 %	224984393
23	NC_012177	TATT	2	8	9264	9271	25 %	75 %	0 %	0 %	224984394
24	NC_012177	AAGC	2	8	9818	9825	50 %	0 %	25 %	25 %	224984394
25	NC_012177	CAAG	2	8	10926	10933	50 %	0 %	25 %	25 %	224984395
26	NC_012177	TAAA	2	8	11702	11709	75 %	25 %	0 %	0 %	224984397
27	NC_012177	GAAA	2	8	11716	11723	75 %	0 %	25 %	0 %	224984397
28	NC_012177	TCAA	2	8	11951	11958	50 %	25 %	0 %	25 %	224984397
29	NC_012177	AATT	2	8	12638	12645	50 %	50 %	0 %	0 %	224984397
30	NC_012177	ATTT	2	8	13038	13045	25 %	75 %	0 %	0 %	224984398
31	NC_012177	TCAA	2	8	13441	13448	50 %	25 %	0 %	25 %	224984399
32	NC_012177	TAAA	2	8	14075	14082	75 %	25 %	0 %	0 %	224984399
33	NC_012177	TTGA	2	8	14409	14416	25 %	50 %	25 %	0 %	224984400
34	NC_012177	TTTG	2	8	14455	14462	0 %	75 %	25 %	0 %	224984400
35	NC_012177	AAAG	2	8	14472	14479	75 %	0 %	25 %	0 %	224984400
36	NC_012177	CTTT	2	8	14585	14592	0 %	75 %	0 %	25 %	224984400
37	NC_012177	ATTT	2	8	15341	15348	25 %	75 %	0 %	0 %	224984401
38	NC_012177	GAAA	2	8	15631	15638	75 %	0 %	25 %	0 %	224984401
39	NC_012177	TTAA	2	8	16277	16284	50 %	50 %	0 %	0 %	224984402
40	NC_012177	TCTG	2	8	16798	16805	0 %	50 %	25 %	25 %	224984403
41	NC_012177	AAAT	2	8	18488	18495	75 %	25 %	0 %	0 %	224984406
42	NC_012177	ATCA	2	8	19010	19017	50 %	25 %	0 %	25 %	224984406
43	NC_012177	ATTA	2	8	19530	19537	50 %	50 %	0 %	0 %	224984406
44	NC_012177	TTTG	2	8	19601	19608	0 %	75 %	25 %	0 %	224984406
45	NC_012177	TAAA	2	8	20803	20810	75 %	25 %	0 %	0 %	224984408
46	NC_012177	AAAT	2	8	21069	21076	75 %	25 %	0 %	0 %	224984409
47	NC_012177	CTTT	2	8	21097	21104	0 %	75 %	0 %	25 %	224984409
48	NC_012177	TAAA	2	8	21248	21255	75 %	25 %	0 %	0 %	224984409
49	NC_012177	TAAG	2	8	21311	21318	50 %	25 %	25 %	0 %	224984409
50	NC_012177	TTGT	2	8	21716	21723	0 %	75 %	25 %	0 %	224984410
51	NC_012177	ATTT	2	8	22674	22681	25 %	75 %	0 %	0 %	224984410
52	NC_012177	ATTA	2	8	22789	22796	50 %	50 %	0 %	0 %	224984410
53	NC_012177	TATG	2	8	22912	22919	25 %	50 %	25 %	0 %	224984410
54	NC_012177	TTTG	2	8	23368	23375	0 %	75 %	25 %	0 %	224984411
55	NC_012177	ACCT	2	8	23950	23957	25 %	25 %	0 %	50 %	224984412
56	NC_012177	TAAA	2	8	24727	24734	75 %	25 %	0 %	0 %	224984413
57	NC_012177	ACAA	2	8	24744	24751	75 %	0 %	0 %	25 %	224984413
58	NC_012177	GATT	2	8	24986	24993	25 %	50 %	25 %	0 %	224984413
59	NC_012177	AATT	2	8	25711	25718	50 %	50 %	0 %	0 %	224984414
60	NC_012177	GCTT	2	8	25722	25729	0 %	50 %	25 %	25 %	224984414
61	NC_012177	ATTT	2	8	26132	26139	25 %	75 %	0 %	0 %	224984414
62	NC_012177	ATGC	2	8	26613	26620	25 %	25 %	25 %	25 %	224984414
63	NC_012177	TTAA	2	8	26744	26751	50 %	50 %	0 %	0 %	224984414
64	NC_012177	ATAA	2	8	27019	27026	75 %	25 %	0 %	0 %	224984415
65	NC_012177	GATT	2	8	27189	27196	25 %	50 %	25 %	0 %	224984415
66	NC_012177	AATG	2	8	27373	27380	50 %	25 %	25 %	0 %	224984415
67	NC_012177	CAAA	2	8	28069	28076	75 %	0 %	0 %	25 %	224984416
68	NC_012177	ATTA	2	8	28353	28360	50 %	50 %	0 %	0 %	224984417
69	NC_012177	TACT	2	8	28382	28389	25 %	50 %	0 %	25 %	224984417
70	NC_012177	ATGA	2	8	29030	29037	50 %	25 %	25 %	0 %	224984418
71	NC_012177	TGTT	2	8	29271	29278	0 %	75 %	25 %	0 %	224984418
72	NC_012177	CAAA	2	8	30010	30017	75 %	0 %	0 %	25 %	224984420
73	NC_012177	TTGC	2	8	30615	30622	0 %	50 %	25 %	25 %	224984421
74	NC_012177	AATT	2	8	30862	30869	50 %	50 %	0 %	0 %	224984422
75	NC_012177	ATTT	2	8	31343	31350	25 %	75 %	0 %	0 %	224984422
76	NC_012177	CAAG	2	8	31355	31362	50 %	0 %	25 %	25 %	224984422
77	NC_012177	CAAT	2	8	32267	32274	50 %	25 %	0 %	25 %	224984423
78	NC_012177	TTGA	2	8	32295	32302	25 %	50 %	25 %	0 %	224984423
79	NC_012177	ACAT	3	12	32381	32392	50 %	25 %	0 %	25 %	224984424
80	NC_012177	TAAA	2	8	32548	32555	75 %	25 %	0 %	0 %	224984424
81	NC_012177	TACA	2	8	32925	32932	50 %	25 %	0 %	25 %	224984425
82	NC_012177	ACGA	2	8	33011	33018	50 %	0 %	25 %	25 %	224984425
83	NC_012177	CAAA	2	8	33304	33311	75 %	0 %	0 %	25 %	224984426
84	NC_012177	AAAC	2	8	33353	33360	75 %	0 %	0 %	25 %	224984426
85	NC_012177	AAGC	2	8	34379	34386	50 %	0 %	25 %	25 %	224984427
86	NC_012177	AGCA	2	8	34429	34436	50 %	0 %	25 %	25 %	224984427
87	NC_012177	TGAT	2	8	34569	34576	25 %	50 %	25 %	0 %	224984427
88	NC_012177	CAAT	2	8	34638	34645	50 %	25 %	0 %	25 %	224984427
89	NC_012177	GTAT	2	8	35093	35100	25 %	50 %	25 %	0 %	224984428
90	NC_012177	ATGA	2	8	36344	36351	50 %	25 %	25 %	0 %	224984429
91	NC_012177	ATTT	2	8	36490	36497	25 %	75 %	0 %	0 %	224984429
92	NC_012177	TGTT	2	8	36558	36565	0 %	75 %	25 %	0 %	224984429
93	NC_012177	TTGT	2	8	38130	38137	0 %	75 %	25 %	0 %	224984431
94	NC_012177	ATTT	2	8	38293	38300	25 %	75 %	0 %	0 %	224984431
95	NC_012177	GTTT	2	8	38419	38426	0 %	75 %	25 %	0 %	224984431
96	NC_012177	ATTT	2	8	38493	38500	25 %	75 %	0 %	0 %	224984431
97	NC_012177	TTTG	2	8	38584	38591	0 %	75 %	25 %	0 %	224984431
98	NC_012177	GCTT	2	8	38604	38611	0 %	50 %	25 %	25 %	224984431
99	NC_012177	TTGA	2	8	39130	39137	25 %	50 %	25 %	0 %	224984432
100	NC_012177	AAAT	2	8	39284	39291	75 %	25 %	0 %	0 %	224984432
101	NC_012177	TTTA	2	8	39482	39489	25 %	75 %	0 %	0 %	224984433
102	NC_012177	TTGT	2	8	39980	39987	0 %	75 %	25 %	0 %	224984433
103	NC_012177	ACTT	2	8	40617	40624	25 %	50 %	0 %	25 %	224984434
104	NC_012177	TTTA	2	8	40788	40795	25 %	75 %	0 %	0 %	224984434
105	NC_012177	TTGC	2	8	41465	41472	0 %	50 %	25 %	25 %	224984435
106	NC_012177	TTTA	2	8	41745	41752	25 %	75 %	0 %	0 %	224984436
107	NC_012177	GTTT	2	8	41954	41961	0 %	75 %	25 %	0 %	224984436
108	NC_012177	ATCT	2	8	42308	42315	25 %	50 %	0 %	25 %	224984436
109	NC_012177	AATT	2	8	42657	42664	50 %	50 %	0 %	0 %	224984436
110	NC_012177	ATTT	2	8	43339	43346	25 %	75 %	0 %	0 %	224984437
111	NC_012177	GAAA	2	8	44186	44193	75 %	0 %	25 %	0 %	224984438
112	NC_012177	TTGT	2	8	44478	44485	0 %	75 %	25 %	0 %	224984438
113	NC_012177	TTGA	2	8	44638	44645	25 %	50 %	25 %	0 %	224984438
114	NC_012177	CTTG	2	8	44883	44890	0 %	50 %	25 %	25 %	224984438
115	NC_012177	TTTA	2	8	45573	45580	25 %	75 %	0 %	0 %	224984439
116	NC_012177	TAAA	2	8	45786	45793	75 %	25 %	0 %	0 %	224984439
117	NC_012177	AATT	2	8	46137	46144	50 %	50 %	0 %	0 %	224984440
118	NC_012177	TATT	2	8	46775	46782	25 %	75 %	0 %	0 %	224984441
119	NC_012177	GACT	2	8	46988	46995	25 %	25 %	25 %	25 %	224984441
120	NC_012177	ATTT	2	8	47156	47163	25 %	75 %	0 %	0 %	224984441
121	NC_012177	TATT	2	8	47327	47334	25 %	75 %	0 %	0 %	224984441
122	NC_012177	TTTA	2	8	47586	47593	25 %	75 %	0 %	0 %	224984443
123	NC_012177	AAGT	2	8	48793	48800	50 %	25 %	25 %	0 %	224984445
124	NC_012177	ATCT	2	8	49167	49174	25 %	50 %	0 %	25 %	224984445
125	NC_012177	GATT	2	8	49224	49231	25 %	50 %	25 %	0 %	224984445
126	NC_012177	TCAT	2	8	49593	49600	25 %	50 %	0 %	25 %	224984446
127	NC_012177	ATTT	2	8	50212	50219	25 %	75 %	0 %	0 %	224984446
128	NC_012177	TATT	2	8	51150	51157	25 %	75 %	0 %	0 %	224984447
129	NC_012177	AAAT	2	8	52526	52533	75 %	25 %	0 %	0 %	224984448
130	NC_012177	GATT	2	8	53816	53823	25 %	50 %	25 %	0 %	224984451

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.