MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_lp54

Total Repeats: 616

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012177	TAA	2	6	744	749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984382
2	NC_012177	TGG	2	6	843	848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224984382
3	NC_012177	ATT	2	6	901	906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984382
4	NC_012177	TTA	2	6	992	997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984382
5	NC_012177	TTA	2	6	1122	1127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984382
6	NC_012177	ATT	2	6	1472	1477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984383
7	NC_012177	TAA	2	6	1522	1527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984383
8	NC_012177	AAT	2	6	1538	1543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984383
9	NC_012177	GAA	2	6	1553	1558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984383
10	NC_012177	TGA	2	6	1591	1596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224984383
11	NC_012177	ACA	2	6	1619	1624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224984383
12	NC_012177	TAA	2	6	1638	1643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984383
13	NC_012177	ATG	2	6	1662	1667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224984383
14	NC_012177	TTA	2	6	1697	1702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984383
15	NC_012177	TAG	2	6	1713	1718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224984383
16	NC_012177	AGA	2	6	1771	1776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984383
17	NC_012177	AGA	2	6	1807	1812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984383
18	NC_012177	TAA	2	6	1954	1959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984383
19	NC_012177	CTT	2	6	2085	2090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224984384
20	NC_012177	ATT	2	6	2144	2149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984384
21	NC_012177	ACT	2	6	2294	2299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224984384
22	NC_012177	TCC	2	6	2374	2379	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	224984384
23	NC_012177	CTC	3	9	2385	2393	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	224984384
24	NC_012177	TCA	2	6	2399	2404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224984384
25	NC_012177	ATT	2	6	2486	2491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984384
26	NC_012177	ACT	2	6	2845	2850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224984384
27	NC_012177	ATT	2	6	2869	2874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984384
28	NC_012177	CAA	2	6	2885	2890	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224984384
29	NC_012177	CAA	2	6	2904	2909	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224984384
30	NC_012177	TAA	2	6	3114	3119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984385
31	NC_012177	TTC	2	6	3166	3171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224984385
32	NC_012177	CAT	2	6	3250	3255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224984385
33	NC_012177	ATC	2	6	3326	3331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224984385
34	NC_012177	TCT	2	6	3387	3392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224984385
35	NC_012177	AAG	2	6	3473	3478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984385
36	NC_012177	ACT	2	6	3491	3496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224984385
37	NC_012177	TTG	2	6	3500	3505	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224984385
38	NC_012177	CAA	2	6	3526	3531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224984385
39	NC_012177	CCG	2	6	3549	3554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224984385
40	NC_012177	TTG	2	6	3578	3583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224984385
41	NC_012177	TCT	2	6	3615	3620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224984385
42	NC_012177	AAT	2	6	3637	3642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984385
43	NC_012177	AGA	2	6	3674	3679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984385
44	NC_012177	TCA	2	6	3762	3767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224984385
45	NC_012177	CCA	2	6	3783	3788	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224984385
46	NC_012177	TCA	2	6	3804	3809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224984385
47	NC_012177	CAT	2	6	3880	3885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224984385
48	NC_012177	ATC	2	6	3965	3970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224984385
49	NC_012177	TTA	2	6	4131	4136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984385
50	NC_012177	TCT	3	9	4209	4217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224984385
51	NC_012177	AAG	2	6	4238	4243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984385
52	NC_012177	TAA	2	6	4255	4260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984385
53	NC_012177	CAT	2	6	4545	4550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224984386
54	NC_012177	TAG	3	9	4587	4595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224984386
55	NC_012177	TGC	2	6	4646	4651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224984386
56	NC_012177	CAT	2	6	4671	4676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224984386
57	NC_012177	AAC	2	6	4726	4731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224984386
58	NC_012177	ACT	2	6	4795	4800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224984386
59	NC_012177	CTT	2	6	4833	4838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224984386
60	NC_012177	TCA	2	6	4844	4849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224984386
61	NC_012177	AGA	2	6	4900	4905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984386
62	NC_012177	AAT	2	6	4941	4946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984386
63	NC_012177	AAT	2	6	4967	4972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984386
64	NC_012177	ATA	2	6	4983	4988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984386
65	NC_012177	CGA	2	6	5186	5191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224984387
66	NC_012177	GAA	2	6	5241	5246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984387
67	NC_012177	AAC	2	6	5251	5256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224984387
68	NC_012177	TTA	2	6	5413	5418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984387
69	NC_012177	AGA	2	6	5551	5556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984388
70	NC_012177	ATA	2	6	5630	5635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984388
71	NC_012177	AGA	2	6	5734	5739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984388
72	NC_012177	TAC	2	6	5856	5861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224984388
73	NC_012177	ACA	2	6	6126	6131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224984388
74	NC_012177	ATT	2	6	6203	6208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984388
75	NC_012177	ATG	2	6	6279	6284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224984388
76	NC_012177	ATT	3	9	6329	6337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984388
77	NC_012177	ACT	2	6	6355	6360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224984388
78	NC_012177	TAA	2	6	6542	6547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984389
79	NC_012177	ATT	2	6	6619	6624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984389
80	NC_012177	TGA	2	6	6648	6653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224984389
81	NC_012177	ATA	3	9	6730	6738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984389
82	NC_012177	GCA	2	6	6781	6786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224984389
83	NC_012177	TTA	2	6	6893	6898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984389
84	NC_012177	GAC	2	6	7146	7151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224984390
85	NC_012177	TAG	2	6	7153	7158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224984390
86	NC_012177	ACA	2	6	7219	7224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224984390
87	NC_012177	AAG	2	6	7516	7521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984390
88	NC_012177	TGG	2	6	7710	7715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224984390
89	NC_012177	ACA	2	6	7742	7747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224984390
90	NC_012177	TGA	2	6	7757	7762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224984390
91	NC_012177	AGC	2	6	7824	7829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224984390
92	NC_012177	AGA	2	6	7859	7864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984390
93	NC_012177	AGA	2	6	7913	7918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984390
94	NC_012177	AAG	2	6	7949	7954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984390
95	NC_012177	TTC	2	6	7982	7987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224984390
96	NC_012177	CAA	2	6	8142	8147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224984391
97	NC_012177	AGG	2	6	8173	8178	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	224984391
98	NC_012177	GAT	2	6	8203	8208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224984391
99	NC_012177	TTA	2	6	8247	8252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984391
100	NC_012177	AAT	2	6	8335	8340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984392
101	NC_012177	TAA	2	6	8426	8431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984392
102	NC_012177	AAT	2	6	8509	8514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984392
103	NC_012177	TAT	2	6	8562	8567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984392
104	NC_012177	AGA	2	6	8646	8651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984392
105	NC_012177	ATA	2	6	8666	8671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984392
106	NC_012177	AGA	2	6	8767	8772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984393
107	NC_012177	AGC	2	6	9318	9323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224984394
108	NC_012177	TGA	2	6	9326	9331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224984394
109	NC_012177	TGA	2	6	9527	9532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224984394
110	NC_012177	AGA	2	6	9563	9568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984394
111	NC_012177	AGA	2	6	9617	9622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984394
112	NC_012177	ACA	2	6	9783	9788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224984394
113	NC_012177	ATT	2	6	9930	9935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984394
114	NC_012177	CAA	2	6	10013	10018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224984394
115	NC_012177	CAG	2	6	10030	10035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224984394
116	NC_012177	CAA	2	6	10196	10201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224984395
117	NC_012177	TAC	2	6	10232	10237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224984395
118	NC_012177	CAA	2	6	10475	10480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224984395
119	NC_012177	GTT	2	6	10497	10502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224984395
120	NC_012177	TTA	2	6	10515	10520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984395
121	NC_012177	AGA	2	6	10523	10528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984395
122	NC_012177	ACA	2	6	10686	10691	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224984395
123	NC_012177	CTA	2	6	10783	10788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224984395
124	NC_012177	CAG	2	6	10906	10911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224984395
125	NC_012177	ATA	2	6	10973	10978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984395
126	NC_012177	TAA	2	6	11179	11184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984396
127	NC_012177	ACT	2	6	11801	11806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224984397
128	NC_012177	TTA	2	6	11841	11846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984397
129	NC_012177	TAA	2	6	11879	11884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984397
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131	NC_012177	TAG	2	6	11964	11969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224984397
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