MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_lp54

Total Repeats: 59

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012177	TA	3	6	1972	1977	50 %	50 %	0 %	0 %	224984383
2	NC_012177	CT	3	6	2849	2854	0 %	50 %	0 %	50 %	224984384
3	NC_012177	TA	3	6	3074	3079	50 %	50 %	0 %	0 %	224984385
4	NC_012177	AT	3	6	7292	7297	50 %	50 %	0 %	0 %	224984390
5	NC_012177	AC	3	6	7415	7420	50 %	0 %	0 %	50 %	224984390
6	NC_012177	CA	3	6	7746	7751	50 %	0 %	0 %	50 %	224984390
7	NC_012177	GA	4	8	8548	8555	50 %	0 %	50 %	0 %	224984392
8	NC_012177	TA	4	8	12003	12010	50 %	50 %	0 %	0 %	224984397
9	NC_012177	AT	3	6	13162	13167	50 %	50 %	0 %	0 %	224984398
10	NC_012177	AT	3	6	13547	13552	50 %	50 %	0 %	0 %	224984399
11	NC_012177	TA	3	6	13723	13728	50 %	50 %	0 %	0 %	224984399
12	NC_012177	TG	3	6	13776	13781	0 %	50 %	50 %	0 %	224984399
13	NC_012177	TA	3	6	13789	13794	50 %	50 %	0 %	0 %	224984399
14	NC_012177	GA	4	8	13978	13985	50 %	0 %	50 %	0 %	224984399
15	NC_012177	AG	3	6	15522	15527	50 %	0 %	50 %	0 %	224984401
16	NC_012177	AT	3	6	16294	16299	50 %	50 %	0 %	0 %	224984402
17	NC_012177	AT	3	6	17687	17692	50 %	50 %	0 %	0 %	224984404
18	NC_012177	AT	3	6	17867	17872	50 %	50 %	0 %	0 %	224984405
19	NC_012177	AG	3	6	18325	18330	50 %	0 %	50 %	0 %	224984405
20	NC_012177	GA	3	6	18365	18370	50 %	0 %	50 %	0 %	224984405
21	NC_012177	GA	4	8	18717	18724	50 %	0 %	50 %	0 %	224984406
22	NC_012177	AT	3	6	19364	19369	50 %	50 %	0 %	0 %	224984406
23	NC_012177	AG	4	8	19463	19470	50 %	0 %	50 %	0 %	224984406
24	NC_012177	TA	3	6	20102	20107	50 %	50 %	0 %	0 %	224984407
25	NC_012177	GA	3	6	20707	20712	50 %	0 %	50 %	0 %	224984408
26	NC_012177	AG	3	6	20773	20778	50 %	0 %	50 %	0 %	224984408
27	NC_012177	AT	3	6	20988	20993	50 %	50 %	0 %	0 %	224984409
28	NC_012177	AG	4	8	21112	21119	50 %	0 %	50 %	0 %	224984409
29	NC_012177	AG	3	6	21489	21494	50 %	0 %	50 %	0 %	224984409
30	NC_012177	AT	3	6	21942	21947	50 %	50 %	0 %	0 %	224984410
31	NC_012177	AT	3	6	22747	22752	50 %	50 %	0 %	0 %	224984410
32	NC_012177	GA	4	8	26699	26706	50 %	0 %	50 %	0 %	224984414
33	NC_012177	TA	3	6	26726	26731	50 %	50 %	0 %	0 %	224984414
34	NC_012177	AG	3	6	28220	28225	50 %	0 %	50 %	0 %	224984417
35	NC_012177	GA	3	6	28683	28688	50 %	0 %	50 %	0 %	224984417
36	NC_012177	GA	3	6	29948	29953	50 %	0 %	50 %	0 %	224984420
37	NC_012177	GA	3	6	31878	31883	50 %	0 %	50 %	0 %	224984423
38	NC_012177	GA	3	6	32556	32561	50 %	0 %	50 %	0 %	224984424
39	NC_012177	AG	3	6	33784	33789	50 %	0 %	50 %	0 %	224984426
40	NC_012177	GA	3	6	33840	33845	50 %	0 %	50 %	0 %	224984426
41	NC_012177	GA	3	6	34003	34008	50 %	0 %	50 %	0 %	224984426
42	NC_012177	GT	3	6	34195	34200	0 %	50 %	50 %	0 %	224984426
43	NC_012177	AT	3	6	34237	34242	50 %	50 %	0 %	0 %	224984426
44	NC_012177	TC	3	6	34540	34545	0 %	50 %	0 %	50 %	224984427
45	NC_012177	GT	3	6	34686	34691	0 %	50 %	50 %	0 %	224984427
46	NC_012177	GA	3	6	36185	36190	50 %	0 %	50 %	0 %	224984429
47	NC_012177	AG	3	6	36256	36261	50 %	0 %	50 %	0 %	224984429
48	NC_012177	AG	3	6	36734	36739	50 %	0 %	50 %	0 %	224984429
49	NC_012177	GT	3	6	36844	36849	0 %	50 %	50 %	0 %	224984430
50	NC_012177	AT	3	6	36976	36981	50 %	50 %	0 %	0 %	224984430
51	NC_012177	TA	3	6	37587	37592	50 %	50 %	0 %	0 %	224984431
52	NC_012177	AT	3	6	39411	39416	50 %	50 %	0 %	0 %	224984433
53	NC_012177	TA	3	6	41130	41135	50 %	50 %	0 %	0 %	224984434
54	NC_012177	GT	3	6	43095	43100	0 %	50 %	50 %	0 %	224984437
55	NC_012177	GT	3	6	47652	47657	0 %	50 %	50 %	0 %	224984443
56	NC_012177	TC	3	6	48043	48048	0 %	50 %	0 %	50 %	224984443
57	NC_012177	AG	3	6	52263	52268	50 %	0 %	50 %	0 %	224984448
58	NC_012177	TA	3	6	52792	52797	50 %	50 %	0 %	0 %	224984448
59	NC_012177	TA	3	6	53512	53517	50 %	50 %	0 %	0 %	224984450

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.