MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_lp54

Total Repeats: 78

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012177	A	6	6	1	6	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012177	A	6	6	46	51	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012177	A	7	7	229	235	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012177	G	7	7	374	380	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012177	A	8	8	1138	1145	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012177	T	6	6	1159	1164	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012177	A	6	6	1274	1279	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012177	A	7	7	3009	3015	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012177	A	6	6	4521	4526	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012177	T	8	8	5054	5061	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012177	A	9	9	5062	5070	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012177	T	6	6	6995	7000	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012177	T	7	7	9069	9075	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012177	T	9	9	9160	9168	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012177	T	7	7	11448	11454	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012177	T	6	6	11458	11463	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012177	T	6	6	11481	11486	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012177	T	6	6	14842	14847	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012177	T	7	7	14894	14900	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012177	A	6	6	14917	14922	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012177	A	6	6	17752	17757	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012177	A	7	7	17816	17822	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012177	T	6	6	19846	19851	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012177	T	6	6	19946	19951	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012177	A	7	7	19954	19960	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012177	T	7	7	20577	20583	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012177	T	6	6	21555	21560	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012177	A	8	8	21583	21590	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012177	T	6	6	21611	21616	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012177	A	6	6	21660	21665	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012177	T	7	7	23266	23272	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012177	A	6	6	23433	23438	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012177	T	6	6	23601	23606	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012177	A	7	7	23609	23615	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012177	T	7	7	23718	23724	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012177	A	6	6	23743	23748	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012177	A	6	6	24479	24484	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012177	T	6	6	24551	24556	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012177	T	6	6	24558	24563	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012177	A	7	7	24576	24582	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012177	T	7	7	25447	25453	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012177	A	6	6	25538	25543	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012177	A	8	8	27451	27458	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012177	A	6	6	27465	27470	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012177	A	6	6	30779	30784	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012177	A	6	6	30791	30796	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012177	T	6	6	35800	35805	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012177	A	6	6	35836	35841	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012177	A	6	6	35854	35859	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012177	A	6	6	38692	38697	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012177	T	6	6	38793	38798	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012177	T	6	6	40304	40309	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012177	T	6	6	41332	41337	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012177	A	6	6	41343	41348	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012177	A	9	9	42772	42780	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012177	A	9	9	42782	42790	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012177	T	8	8	42807	42814	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012177	A	8	8	43802	43809	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012177	T	6	6	43864	43869	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012177	A	6	6	45239	45244	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012177	A	6	6	45263	45268	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012177	T	7	7	45287	45293	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012177	A	6	6	46518	46523	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012177	T	6	6	49438	49443	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012177	A	10	10	49483	49492	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012177	A	6	6	49515	49520	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012177	T	8	8	49536	49543	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012177	T	6	6	50529	50534	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012177	T	9	9	50539	50547	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_012177	A	6	6	51473	51478	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012177	T	8	8	51604	51611	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012177	A	9	9	51612	51620	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012177	A	6	6	51885	51890	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012177	T	8	8	52878	52885	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012177	T	6	6	52887	52892	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012177	C	6	6	52915	52920	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
77	NC_012177	T	7	7	53909	53915	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012177	A	6	6	53916	53921	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.