MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_lp28-8

Total Repeats: 13

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012169	TCTATT	2	12	714	725	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_012169	ATATAA	2	12	1002	1013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796535
3	NC_012169	AAATTA	2	12	1617	1628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796535
4	NC_012169	TAAAAA	2	12	1721	1732	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	224796533
5	NC_012169	AATTAG	2	12	3560	3571	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	224796543
6	NC_012169	GTCAAA	2	12	6847	6858	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	224796538
7	NC_012169	TAACCT	2	12	10330	10341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_012169	TTTTAA	2	12	14438	14449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796541
9	NC_012169	TTATTT	2	12	15380	15391	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	224796546
10	NC_012169	TTTTTG	2	12	16144	16155	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	224796546
11	NC_012169	ATACTA	2	12	16377	16388	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	224796546
12	NC_012169	CCGCAC	2	12	17275	17286	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	224796532
13	NC_012169	CCAGCA	2	12	17757	17768	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	224796532

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.