MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_lp28-8

Total Repeats: 21

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012169	AGCCG	2	10	5	14	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
2	NC_012169	ATTTA	2	10	802	811	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012169	TAAAA	2	10	1099	1108	80 %	20 %	0 %	0 %	224796535
4	NC_012169	TAAAA	2	10	1126	1135	80 %	20 %	0 %	0 %	224796535
5	NC_012169	AAATA	2	10	1928	1937	80 %	20 %	0 %	0 %	224796533
6	NC_012169	ATTCA	2	10	2434	2443	40 %	40 %	0 %	20 %	224796545
7	NC_012169	TAAAA	2	10	5330	5339	80 %	20 %	0 %	0 %	224796542
8	NC_012169	CAAAT	2	10	6811	6820	60 %	20 %	0 %	20 %	224796538
9	NC_012169	GAAAC	2	10	8823	8832	60 %	0 %	20 %	20 %	224796530
10	NC_012169	GAAAC	2	10	9892	9901	60 %	0 %	20 %	20 %	224796530
11	NC_012169	AAAAT	2	10	9967	9976	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012169	AAAAC	2	10	10116	10125	80 %	0 %	0 %	20 %	224796531
13	NC_012169	TATAA	2	10	10683	10692	60 %	40 %	0 %	0 %	224796534
14	NC_012169	AATTA	2	10	12990	12999	60 %	40 %	0 %	0 %	224796529
15	NC_012169	AAAAT	2	10	13339	13348	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012169	CAATC	2	10	13405	13414	40 %	20 %	0 %	40 %	224796539
17	NC_012169	TTGTT	2	10	13958	13967	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012169	ATTTT	2	10	15513	15522	20 %	80 %	0 %	0 %	224796546
19	NC_012169	TTTAT	2	10	16127	16136	20 %	80 %	0 %	0 %	224796546
20	NC_012169	TTTTA	2	10	16267	16276	20 %	80 %	0 %	0 %	224796546
21	NC_012169	TTAAG	2	10	16560	16569	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.