MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_lp28-8

Total Repeats: 79

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012169	TAAA	2	8	98	105	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012169	ATTC	2	8	115	122	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_012169	AACA	2	8	269	276	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_012169	CTAT	2	8	320	327	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_012169	TAAA	3	12	369	380	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012169	AATC	2	8	527	534	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_012169	AATT	2	8	580	587	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012169	CATA	2	8	677	684	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_012169	AATT	2	8	852	859	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012169	AAAT	2	8	901	908	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012169	CAAA	2	8	1254	1261	75 %	0 %	0 %	25 %	224796535
12	NC_012169	TATT	2	8	1485	1492	25 %	75 %	0 %	0 %	224796535
13	NC_012169	AATA	2	8	1502	1509	75 %	25 %	0 %	0 %	224796535
14	NC_012169	AAAT	2	8	1561	1568	75 %	25 %	0 %	0 %	224796535
15	NC_012169	CTAA	2	8	1574	1581	50 %	25 %	0 %	25 %	224796535
16	NC_012169	AAAC	2	8	1594	1601	75 %	0 %	0 %	25 %	224796535
17	NC_012169	ATAA	2	8	2143	2150	75 %	25 %	0 %	0 %	224796533
18	NC_012169	CTTT	2	8	2262	2269	0 %	75 %	0 %	25 %	224796545
19	NC_012169	TTAC	2	8	2402	2409	25 %	50 %	0 %	25 %	224796545
20	NC_012169	TTCA	2	8	2530	2537	25 %	50 %	0 %	25 %	224796545
21	NC_012169	GAAT	2	8	3074	3081	50 %	25 %	25 %	0 %	224796545
22	NC_012169	AAGG	2	8	3135	3142	50 %	0 %	50 %	0 %	224796545
23	NC_012169	ATTT	2	8	4139	4146	25 %	75 %	0 %	0 %	224796543
24	NC_012169	ATAA	2	8	4313	4320	75 %	25 %	0 %	0 %	224796543
25	NC_012169	AATT	3	12	4370	4381	50 %	50 %	0 %	0 %	224796543
26	NC_012169	ATTA	2	8	4603	4610	50 %	50 %	0 %	0 %	224796543
27	NC_012169	AGTA	2	8	4890	4897	50 %	25 %	25 %	0 %	224796542
28	NC_012169	ATAA	2	8	4958	4965	75 %	25 %	0 %	0 %	224796542
29	NC_012169	AAAT	2	8	5002	5009	75 %	25 %	0 %	0 %	224796542
30	NC_012169	CTTT	2	8	5175	5182	0 %	75 %	0 %	25 %	224796542
31	NC_012169	TTTA	2	8	5579	5586	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012169	ATAG	2	8	5723	5730	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012169	AATT	2	8	5952	5959	50 %	50 %	0 %	0 %	224796538
34	NC_012169	AAAT	2	8	6136	6143	75 %	25 %	0 %	0 %	224796538
35	NC_012169	AAGT	2	8	6507	6514	50 %	25 %	25 %	0 %	224796538
36	NC_012169	GTAA	2	8	6548	6555	50 %	25 %	25 %	0 %	224796538
37	NC_012169	ATAA	2	8	6834	6841	75 %	25 %	0 %	0 %	224796538
38	NC_012169	AAAT	2	8	7093	7100	75 %	25 %	0 %	0 %	224796537
39	NC_012169	AAAT	2	8	7394	7401	75 %	25 %	0 %	0 %	224796537
40	NC_012169	TAAA	2	8	7809	7816	75 %	25 %	0 %	0 %	224796537
41	NC_012169	ATTT	2	8	8241	8248	25 %	75 %	0 %	0 %	224796544
42	NC_012169	TCCA	2	8	8575	8582	25 %	25 %	0 %	50 %	224796544
43	NC_012169	AGCC	2	8	8638	8645	25 %	0 %	25 %	50 %	224796544
44	NC_012169	AATA	2	8	8975	8982	75 %	25 %	0 %	0 %	224796530
45	NC_012169	ATTT	2	8	9685	9692	25 %	75 %	0 %	0 %	224796530
46	NC_012169	AAAC	2	8	10039	10046	75 %	0 %	0 %	25 %	224796531
47	NC_012169	TTGT	2	8	10257	10264	0 %	75 %	25 %	0 %	224796531
48	NC_012169	AAAG	2	8	10353	10360	75 %	0 %	25 %	0 %	224796534
49	NC_012169	ATCA	2	8	10644	10651	50 %	25 %	0 %	25 %	224796534
50	NC_012169	AAGC	2	8	10730	10737	50 %	0 %	25 %	25 %	224796534
51	NC_012169	TATT	2	8	10798	10805	25 %	75 %	0 %	0 %	224796534
52	NC_012169	ATTA	2	8	10815	10822	50 %	50 %	0 %	0 %	224796534
53	NC_012169	AAAT	2	8	11076	11083	75 %	25 %	0 %	0 %	224796534
54	NC_012169	TAAT	2	8	11463	11470	50 %	50 %	0 %	0 %	224796536
55	NC_012169	AATA	2	8	11998	12005	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012169	GCTT	2	8	12434	12441	0 %	50 %	25 %	25 %	224796529
57	NC_012169	ATTA	2	8	12471	12478	50 %	50 %	0 %	0 %	224796529
58	NC_012169	ATGT	2	8	13054	13061	25 %	50 %	25 %	0 %	224796529
59	NC_012169	TTAA	2	8	13216	13223	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012169	TTAA	2	8	13246	13253	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012169	TCTT	2	8	13835	13842	0 %	75 %	0 %	25 %	224796539
62	NC_012169	ATTT	2	8	14003	14010	25 %	75 %	0 %	0 %	224796541
63	NC_012169	ATCA	2	8	14390	14397	50 %	25 %	0 %	25 %	224796541
64	NC_012169	TTTA	2	8	14465	14472	25 %	75 %	0 %	0 %	224796541
65	NC_012169	TAAT	2	8	15065	15072	50 %	50 %	0 %	0 %	224796547
66	NC_012169	TTTC	2	8	15272	15279	0 %	75 %	0 %	25 %	224796547
67	NC_012169	CTAA	2	8	15340	15347	50 %	25 %	0 %	25 %	224796546
68	NC_012169	TGAT	2	8	15356	15363	25 %	50 %	25 %	0 %	224796546
69	NC_012169	TTAA	2	8	15392	15399	50 %	50 %	0 %	0 %	224796546
70	NC_012169	TATT	2	8	15419	15426	25 %	75 %	0 %	0 %	224796546
71	NC_012169	TAAA	2	8	15429	15436	75 %	25 %	0 %	0 %	224796546
72	NC_012169	TATT	2	8	15612	15619	25 %	75 %	0 %	0 %	224796546
73	NC_012169	GTAT	2	8	15700	15707	25 %	50 %	25 %	0 %	224796546
74	NC_012169	TTTC	2	8	15987	15994	0 %	75 %	0 %	25 %	224796546
75	NC_012169	TACT	2	8	16077	16084	25 %	50 %	0 %	25 %	224796546
76	NC_012169	AATT	2	8	16482	16489	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012169	TGAA	2	8	16502	16509	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012169	ACCA	2	8	17063	17070	50 %	0 %	0 %	50 %	224796532
79	NC_012169	GCCT	2	8	17825	17832	0 %	25 %	25 %	50 %	224796532

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.