MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_lp28-8

Total Repeats: 32

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012169	AAG	2	6	81	86	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012169	AGA	2	6	109	114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012169	ATT	2	6	145	150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012169	ACT	2	6	168	173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_012169	ATT	2	6	178	183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012169	ATG	2	6	245	250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012169	TAT	2	6	256	261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012169	CTT	2	6	468	473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_012169	TTA	2	6	508	513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012169	TTA	2	6	622	627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012169	ATA	2	6	635	640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012169	AAT	2	6	836	841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012169	GAT	2	6	915	920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012169	ATA	2	6	939	944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012169	ATT	2	6	5545	5550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012169	ATT	2	6	5594	5599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012169	AAG	2	6	5674	5679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012169	CCT	2	6	5752	5757	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_012169	TGT	2	6	5774	5779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012169	TAA	2	6	5782	5787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012169	AAC	2	6	5788	5793	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_012169	ACA	2	6	5837	5842	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_012169	ACC	2	6	5846	5851	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_012169	TAA	2	6	5908	5913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012169	TTC	2	6	6949	6954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_012169	ACC	2	6	11973	11978	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_012169	TAA	2	6	12056	12061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012169	TTA	2	6	12068	12073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012169	TAA	2	6	13153	13158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012169	ATT	2	6	13178	13183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012169	ATA	2	6	13359	13364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012169	ATA	2	6	16522	16527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.