MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_lp28-8

Total Repeats: 274

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012169	TAT	2	6	956	961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796535
2	NC_012169	CAA	2	6	995	1000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224796535
3	NC_012169	TTA	2	6	1017	1022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796535
4	NC_012169	CTA	2	6	1139	1144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224796535
5	NC_012169	ATT	2	6	1297	1302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796535
6	NC_012169	TAA	2	6	1408	1413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796535
7	NC_012169	TCA	2	6	1445	1450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224796535
8	NC_012169	TAA	3	9	1455	1463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796535
9	NC_012169	ACA	2	6	1702	1707	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224796533
10	NC_012169	TAA	2	6	1824	1829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796533
11	NC_012169	AAC	2	6	1833	1838	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224796533
12	NC_012169	TTC	2	6	1899	1904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224796533
13	NC_012169	TAA	2	6	2024	2029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796533
14	NC_012169	ATT	2	6	2041	2046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796533
15	NC_012169	AGG	2	6	2070	2075	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	224796533
16	NC_012169	TCA	2	6	2285	2290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224796545
17	NC_012169	AGG	2	6	2371	2376	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	224796545
18	NC_012169	AGA	2	6	2464	2469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224796545
19	NC_012169	ATA	2	6	2495	2500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796545
20	NC_012169	CAA	2	6	2506	2511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224796545
21	NC_012169	AAT	2	6	2544	2549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796545
22	NC_012169	ATC	2	6	2560	2565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224796545
23	NC_012169	CAG	2	6	2658	2663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224796545
24	NC_012169	CTT	2	6	2664	2669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224796545
25	NC_012169	TTA	2	6	2696	2701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796545
26	NC_012169	CCT	2	6	2705	2710	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	224796545
27	NC_012169	TGC	2	6	2761	2766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224796545
28	NC_012169	AAT	2	6	2796	2801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796545
29	NC_012169	TTA	2	6	2864	2869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796545
30	NC_012169	TAT	2	6	2944	2949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796545
31	NC_012169	CTG	2	6	2985	2990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224796545
32	NC_012169	TCA	2	6	3110	3115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224796545
33	NC_012169	AGA	2	6	3215	3220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224796545
34	NC_012169	AGA	2	6	3229	3234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224796545
35	NC_012169	TCT	2	6	3245	3250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224796545
36	NC_012169	CCT	2	6	3318	3323	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	224796545
37	NC_012169	AGA	2	6	3412	3417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224796545
38	NC_012169	ATA	2	6	3420	3425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796545
39	NC_012169	ATA	2	6	3532	3537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796545
40	NC_012169	GAT	2	6	3655	3660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224796543
41	NC_012169	ATA	2	6	3789	3794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796543
42	NC_012169	GAA	2	6	3817	3822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224796543
43	NC_012169	TTA	2	6	3859	3864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796543
44	NC_012169	TTA	2	6	4000	4005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796543
45	NC_012169	CAA	2	6	4059	4064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224796543
46	NC_012169	ATA	2	6	4066	4071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796543
47	NC_012169	AGT	2	6	4221	4226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224796543
48	NC_012169	ACT	2	6	4245	4250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224796543
49	NC_012169	ATC	2	6	4251	4256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224796543
50	NC_012169	AAC	2	6	4287	4292	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224796543
51	NC_012169	TAT	2	6	4331	4336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796543
52	NC_012169	TCA	2	6	4435	4440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224796543
53	NC_012169	ATA	2	6	4584	4589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796543
54	NC_012169	ATT	2	6	4596	4601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796543
55	NC_012169	AGC	2	6	4635	4640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224796542
56	NC_012169	TGA	2	6	4759	4764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224796542
57	NC_012169	AAT	2	6	4817	4822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796542
58	NC_012169	AGA	2	6	4866	4871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224796542
59	NC_012169	ATT	2	6	4941	4946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796542
60	NC_012169	ATT	2	6	4989	4994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796542
61	NC_012169	TCC	2	6	5025	5030	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	224796542
62	NC_012169	CAG	2	6	5105	5110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224796542
63	NC_012169	ATA	2	6	5112	5117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796542
64	NC_012169	AAG	2	6	5118	5123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224796542
65	NC_012169	CCA	2	6	5135	5140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224796542
66	NC_012169	CAT	5	15	5240	5254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224796542
67	NC_012169	AGC	2	6	5292	5297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224796542
68	NC_012169	TAA	2	6	5361	5366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796542
69	NC_012169	AAT	2	6	5439	5444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796542
70	NC_012169	ATT	2	6	5472	5477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796542
71	NC_012169	AAT	2	6	6035	6040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796538
72	NC_012169	CAA	2	6	6087	6092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224796538
73	NC_012169	TCA	2	6	6098	6103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224796538
74	NC_012169	ATC	2	6	6229	6234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224796538
75	NC_012169	CAC	2	6	6408	6413	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224796538
76	NC_012169	TAA	2	6	6415	6420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796538
77	NC_012169	AAT	2	6	6468	6473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796538
78	NC_012169	TAA	2	6	6484	6489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796538
79	NC_012169	ATA	2	6	6598	6603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796538
80	NC_012169	TAA	2	6	6746	6751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796538
81	NC_012169	ATA	2	6	6799	6804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796538
82	NC_012169	ATT	2	6	6880	6885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796538
83	NC_012169	ATT	2	6	6938	6943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796538
84	NC_012169	ATT	2	6	7197	7202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796537
85	NC_012169	ATA	2	6	7266	7271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796537
86	NC_012169	TAT	2	6	7292	7297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796537
87	NC_012169	CCA	2	6	7442	7447	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224796537
88	NC_012169	TAG	3	9	7449	7457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224796537
89	NC_012169	ATA	2	6	7581	7586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796537
90	NC_012169	TTC	2	6	7602	7607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224796537
91	NC_012169	ATA	2	6	7630	7635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796537
92	NC_012169	TAA	2	6	7682	7687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796537
93	NC_012169	AAT	2	6	7733	7738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796537
94	NC_012169	CTT	2	6	7746	7751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224796537
95	NC_012169	AAG	2	6	7760	7765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224796537
96	NC_012169	TAA	2	6	7796	7801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796537
97	NC_012169	TCA	2	6	7861	7866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224796537
98	NC_012169	TAC	2	6	7892	7897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224796537
99	NC_012169	GCT	2	6	7907	7912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224796537
100	NC_012169	ATA	3	9	7918	7926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796537
101	NC_012169	TAT	2	6	7947	7952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796537
102	NC_012169	TAA	2	6	7953	7958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796537
103	NC_012169	ACA	2	6	7967	7972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224796537
104	NC_012169	ATT	2	6	8068	8073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796544
105	NC_012169	GAT	2	6	8115	8120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224796544
106	NC_012169	CAA	2	6	8136	8141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224796544
107	NC_012169	TAA	2	6	8172	8177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796544
108	NC_012169	CTT	2	6	8182	8187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224796544
109	NC_012169	CAA	2	6	8268	8273	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224796544
110	NC_012169	TCT	2	6	8345	8350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224796544
111	NC_012169	AAT	2	6	8365	8370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796544
112	NC_012169	TAC	2	6	8436	8441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224796544
113	NC_012169	ATT	2	6	8527	8532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796544
114	NC_012169	AAC	2	6	8605	8610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224796544
115	NC_012169	ATA	2	6	8711	8716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796544
116	NC_012169	ATT	2	6	8735	8740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796544
117	NC_012169	TAA	2	6	8773	8778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796530
118	NC_012169	GAA	2	6	8790	8795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224796530
119	NC_012169	ATA	2	6	8846	8851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796530
120	NC_012169	TAA	2	6	8860	8865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796530
121	NC_012169	ATT	2	6	9078	9083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796530
122	NC_012169	ATC	2	6	9102	9107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224796530
123	NC_012169	ATT	2	6	9111	9116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796530
124	NC_012169	ATT	2	6	9138	9143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796530
125	NC_012169	TTA	2	6	9144	9149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796530
126	NC_012169	AAT	2	6	9229	9234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796530
127	NC_012169	GTT	2	6	9266	9271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224796530
128	NC_012169	TAA	2	6	9343	9348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796530
129	NC_012169	TCA	2	6	9439	9444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224796530
130	NC_012169	ACT	2	6	9500	9505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224796530
131	NC_012169	TTG	2	6	9571	9576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224796530
132	NC_012169	ATT	2	6	9737	9742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796530
133	NC_012169	ACT	2	6	9833	9838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224796530
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258	NC_012169	CTT	2	6	17645	17650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224796532
259	NC_012169	AGC	2	6	17669	17674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224796532
260	NC_012169	AGC	2	6	17711	17716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224796532
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262	NC_012169	ATT	2	6	17747	17752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796532
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.